RPS10-NUDT3 (RPS10-NUDT3 readthrough)

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RPS10-NUDT3
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other
location:
6p21.31
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None
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NM_001202470
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HGNC:49181
approved reserved:
2013-09-25
6p21.31
基因染色体位置图

RPS10-NUDT3是一个融合基因,由核糖体蛋白S10(RPS10)基因和核苷二磷酸连接部分X型基序3(NUDT3)基因通过染色体易位形成。RPS10编码核糖体40S亚基的组成部分,参与蛋白质合成,而NUDT3编码一种水解酶,可能参与核苷酸代谢和信号转导。该融合基因的产物可能同时具有两种蛋白的功能或获得新的功能。RPS10-NUDT3融合基因在多种癌症中被发现,如乳腺癌、肺癌和白血病,可能与肿瘤发生和发展相关。突变或异常表达可能影响核糖体功能或细胞代谢,进而促进细胞增殖或抑制凋亡。过表达RPS10-NUDT3可能增强蛋白质合成或改变核苷酸代谢,促进肿瘤生长,而降低表达可能抑制这些过程。RPS10属于核糖体蛋白基因家族,其成员普遍参与核糖体组装和蛋白质翻译;NUDT3属于NUDIX水解酶家族,成员多参与核苷酸代谢和信号调控。这两个家族的基因通常对细胞的基本生命活动至关重要,突变或异常表达常与疾病尤其是癌症相关。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring RPS10 (ribosomal protein S10) and NUDT3 (nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 3) genes on chromosome 6. The read-through transcript produces a fusion protein that shares sequence identity with each individual gene product. [provided by RefSeq, Feb 2011]

这一位点代表自然发生的周边RPS10(核糖体蛋白S10)和NUDT3之间通读转录(Nudix结构(二磷酸核苷挂钩部分X)型图案3)第6号染色体基因的通读转录产生融合蛋白共享序列同一性与每个单独基因产物。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RPS10-NUDT3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs169583       rs169584       rs172280       rs182280       rs206919       rs206920       rs206921       rs206922       rs206923       rs206924       rs206925       rs206926       rs206928       rs206929       rs206930       rs206931       rs206932      

RPS10-NUDT3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTTCGTGAAGTCTGTGAGG
60
GCTTCCTCTCCTGGTTCTC
60
GTTCGTGAAGTCTGTGAGGA
60
GCTTCCTCTCCTGGTTCTC
60
TTCGTGAAGTCTGTGAGGAG
60
GCTTCCTCTCCTGGTTCTC
60
      尚未收录相关数据

RPS10-NUDT3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RPS10-NUDT3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000028
S4R435 (UniProtKB)
IBA
GO:0003735
S4R435 (UniProtKB)
IBA
GO:0016787
S4R435 (UniProtKB)
IEA
GO:0022627
S4R435 (UniProtKB)
IBA

可能调控 RPS10-NUDT3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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