RPRD1B (regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B)

symbol:
RPRD1B
locus group:
protein-coding gene
location:
20q11.23
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dJ1057B20.2|DKFZp434P0735|CREPT|FLJ44520|NET60|Kub5-Hera|K-H
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cell-cycle related and expression-…
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58490
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uc002xho.5
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NM_021215
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HGNC:16209
approved reserved:
2001-07-17
20q11.23
基因染色体位置图

RPRD1B(Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B)是一种参与转录调控和细胞周期进程的基因。其编码的蛋白质含有RNA识别基序(RRM),能够结合RNA并参与pre-mRNA加工(pre-mRNA splicing,即前体信使RNA的剪接过程)和转录终止调控。该蛋白主要定位于细胞核,通过与RNA聚合酶II(负责转录蛋白质编码基因的酶)及其他转录因子相互作用,影响基因表达。RPRD1B属于RPRD基因家族,该家族成员均含有保守的RRM结构域,并在转录调控、RNA代谢和细胞周期检查点(cell cycle checkpoint,确保细胞分裂正确进行的监控机制)中发挥作用。RPRD1B的功能异常可能影响细胞周期调控,导致基因组不稳定性。研究发现,RPRD1B的突变或表达异常与多种癌症相关,如乳腺癌、肺癌和结直肠癌。其过表达可能通过干扰正常转录终止或RNA加工过程促进肿瘤发生,而表达降低则可能导致DNA损伤修复缺陷,增加癌变风险。此外,RPRD1B与p53(一种重要的肿瘤抑制蛋白)通路存在交叉作用,可能通过调控p53靶基因影响细胞凋亡(apoptosis,程序性细胞死亡)或衰老。在基因家族层面,RPRD成员(如RPRD1A和RPRD2)均参与转录延伸和终止的调控,但各自具有组织特异性表达模式和独特相互作用网络。例如,RPRD1A在精子发生中起关键作用,而RPRD1B更广泛参与增殖相关过程。该基因的表达水平变化可能影响其他细胞周期相关基因(如CDK和Cyclin家族成员)的表达,进而改变细胞增殖速率。目前针对RPRD1B的研究仍在深入,其精确分子机制及作为癌症治疗靶点的潜力有待进一步探索。

None

RPRD1B基因的碱基序列:[NCBI]
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RPRD1B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs751230       rs755107       rs881556       rs910664       rs958034       rs990792       rs990793       rs1106772       rs1467461       rs1569907       rs1962746       rs2092906       rs2207883       rs2256288       rs2273352       rs2273353       rs2273354      

RPRD1B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGTTACTAGCAGAATATAACGGG
59
ATCAGTGAGTCACCAGCTC
59
AAAGGACCTGAATTCACTAGAG
58
TTTCTTCTCTTCTGTTGCTGG
59
GTGTCCTGTCTTGTTGACAG
59
CTGCCTCTTTGTCTGTGGA
60
GAGAGCAGGAGTAGCTGAG
59
TGTTTGTATTCCAGCCTGTC
58
ATCTGGCAAGAACGAAGTG
58
TTCTCTTCTGTTGCTTTGGG
58
TGTTGGTGGAGTATACCCAG
59
CAAAGTCAATCATGACACCCTC
60
GGATCGAGTCCAACAACAG
58
CAGGGTAGTCGTCATCCTC
59
AGGTGCAGGAATACAAACAG
58
TGACACCCATCCTAGTCAG
58
TTTCAGCAAATTCAGGAGGA
58
AGTTCCTCAGTCAAGAGGG
58
AAAGATTGCTGAACATCTGGC
60
CTTCTCTTCTGTTGCTTTGGG
60
      尚未收录相关数据

RPRD1B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RPRD1B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000993
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q9NQG5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9NQG5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9NQG5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9NQG5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9NQG5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9NQG5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0008284
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0010564
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016591
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0042795
Q9NQG5 (UniProtKB)
TAS
GO:0045944
Q9NQG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0070940
Q9NQG5 (UniProtKB)
IMP

可能调控 RPRD1B基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

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