RPL36A-HNRNPH2 (RPL36A-HNRNPH2 readthrough)

symbol:
RPL36A-HNRNPH2
locus group:
other
location:
Xq22.1
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NM_001199973
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HGNC:48349
approved reserved:
2013-05-10
Xq22.1
基因染色体位置图

RPL36A-HNRNPH2是一个融合基因,由核糖体蛋白L36A(RPL36A)基因和异质核核糖核蛋白H2(HNRNPH2)基因融合而成。RPL36A编码核糖体60S亚基的组成蛋白,参与蛋白质合成,而HNRNPH2属于HNRNP家族,调控RNA的剪接、转运和稳定性。HNRNP家族成员通常含有RNA识别基序(RRM),能结合pre-mRNA并影响其加工。RPL36A-HNRNPH2融合可能导致HNRNPH2的异常表达或功能改变,影响RNA代谢。HNRNPH2突变或表达异常与神经发育障碍如X连锁智力障碍相关,过表达可能扰乱RNA加工,导致错误剪接或翻译失调,而表达降低可能影响正常RNA代谢。该融合基因的致癌潜力尚不明确,但HNRNP家族成员在其他癌症中可能作为原癌基因发挥作用。目前针对RPL36A-HNRNPH2的研究较少,需进一步探索其生物学功能及临床意义。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring ribosomal protein L36a and heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 (H') genes on chromosome X. The read-through transcript produces a protein with similarity to the protein encoded by the upstream locus, ribosomal protein L36a. Alternatively spliced transcript variants have been identified. [provided by RefSeq, Jan 2011]

此轨迹表示天然产生的通读转录相邻核糖体蛋白L36a和异质核核糖H 2(H‘)X染色体上的基因之间的通读转录产生的蛋白质与相似于由上游编码的蛋白质基因,核糖体蛋白L36a。可变剪接转录物变体也已确定。 [由RefSeq的,2011年1月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RPL36A-HNRNPH2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782816250       rs782814916       rs782812916       rs782806717       rs782782090       rs782764206       rs782762282       rs782752162       rs782735475       rs782719912       rs782669686       rs782662962       rs782663233       rs782631203       rs782628648       rs782610523       rs782573018      

RPL36A-HNRNPH2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGATAAGAAGAGAAAGCTACACC
59
TGATTGTTGGGCTCTTGGT
60
GCAAGCATGGTTAACGTCC
60
CTTGTACTGTGTCACTTTATGGG
60
GGAGATAAGAAGAGAAAGCTACAC
59
GATTGTTGGGCTCTTGGTG
59
CAAGCATGGTTAACGTCCC
59
CTTGTACTGTGTCACTTTATGGG
60
CAAGCATGGTTAACGTCCC
59
TTGTACTGTGTCACTTTATGGG
58
GAGATAAGAAGAGAAAGCTACACC
59
GATTGTTGGGCTCTTGGTG
59
      尚未收录相关数据

RPL36A-HNRNPH2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RPL36A-HNRNPH2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003735
H0Y3V9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005840
H0Y3V9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006412
H0Y3V9 (UniProtKB)
IEA
GO:0003735
H7BZ11 (UniProtKB)
IEA
GO:0006412
H7BZ11 (UniProtKB)
IEA
GO:0022625
H7BZ11 (UniProtKB)
IBA

可能调控 RPL36A-HNRNPH2基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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