RPF1 (ribosome production factor 1 homolog)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RPF1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p22.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
RNA processing factor 1|ribosome p…
entrez id:
80135
ensembl gene id:
ENSG00000117133
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uc001djv.5
refseq accession:
NM_025065
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HGNC:30350
approved reserved:
2005-05-20

基因染色体位置

基因染色体位置

1p22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

RPF1（Ribosome Production Factor 1）是一种参与核糖体生物合成的基因，主要功能是调控核糖体RNA（rRNA）的加工和成熟过程，从而影响核糖体的组装和蛋白质合成效率。该基因的表达产物是一种蛋白质，通过与rRNA前体和其他核糖体组装因子相互作用，确保rRNA的正确剪切和修饰。RPF1的作用位点主要在细胞核内，特别是在核仁区域，这是核糖体合成的关键场所。如果RPF1发生突变，可能导致rRNA加工异常，进而影响核糖体的功能，造成蛋白质合成障碍，最终可能引发细胞生长迟缓或凋亡。研究表明，RPF1的突变或表达异常与某些癌症（如白血病）和发育障碍相关，因为核糖体功能紊乱会影响细胞增殖和分化。当RPF1过表达时，可能加速核糖体的生成，促进细胞增殖，甚至在某些情况下导致肿瘤发生；而降低表达则可能抑制蛋白质合成，影响细胞正常功能，导致生长缺陷或组织退化。RPF1属于核糖体生物合成因子家族（Ribosome Biogenesis Factors），该家族的基因共性在于它们都参与核糖体的形成过程，包括rRNA的转录、加工、修饰以及核糖体亚基的组装。这些基因通常高度保守，在真核生物中广泛存在，对维持细胞稳态至关重要。

None

无

OMIM数据库中对RPF1基因的介绍     Wikipedia数据库中对RPF1基因的介绍

基因序列

基因序列

RPF1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RPF1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs7541909       rs35532023       rs61768862       rs77534448       rs114498720       rs115060446       rs141030609       rs141421533       rs147733178       rs151312092       rs369937645       rs372267670       rs533147940       rs535745817       rs536879084       rs543424527       rs545565613      

基因表达

基因表达

RPF1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGTACCCAAGACCATTGAC
58
GCTTCATCATAAGCGACCTC
59
ACACTTAATGTTCACGCGG
59
CTTTGGTGGAGCCTTATCG
58
ACACTTAATGTTCACGCGG
59
CTTTGGTGGAGCCTTATCG
58
CACTTAATGTTCACGCGGT
59
CTTTGGTGGAGCCTTATCG
58
CCTAATGATGAAGAGGTCGC
58
GAGAATCTTGGGAGAAGTCTG
58
CACTTAATGTTCACGCGGT
59
CTTTGGTGGAGCCTTATCG
58
ACTTAATGTTCACGCGGTG
59
CTTTGGTGGAGCCTTATCG
58
ACTTAATGTTCACGCGGTG
59
CTTTGGTGGAGCCTTATCG
58
CTAATGATGAAGAGGTCGCT
57
GAGAATCTTGGGAGAAGTCTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RPF1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RPF1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000027
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IBA
GO:0000460
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IBA
GO:0000470
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IBA
GO:0003723
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005730
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IDA
GO:0030687
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IBA
GO:0042134
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IBA
GO:0044822
Q9H9Y2 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RPF1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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