ROPN1 (rhophilin associated tail protein 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ROPN1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q21.1
gene_family:
alias symbol:
ODF6|ropporin|ROPN1A|CT91
alias name:
cancer/testis antigen 91
entrez id:
54763
ensembl gene id:
ENSG00000065371
ucsc gene id:
uc062ned.1
refseq accession:
NM_017578
hgnc_id:
HGNC:17692
approved reserved:
2003-01-21

基因染色体位置

基因染色体位置

3q21.1
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ROPN1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2270987       rs2280422       rs2292075       rs2332715       rs2332716       rs2332717       rs2332718       rs2332719       rs2877777       rs3732482       rs4048387       rs4499545       rs4571195       rs6438821       rs6762224       rs6770339       rs6774735      

基因表达

基因表达

ROPN1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCTTAAGAAGGGTGGGAGG
58
ATTGATTGGTTGGCCTCAG
58
CCGCCGAGCAATTTATCTC
59
TTGGCTTATCTGTCTGAGCC
59
CTGCATTCTCAGGTTGCTG
59
ATCTGTTGGGAGATTCACCA
58
CGAGCCTGAGCAATTTATCTC
59
TTGGCTTATCTGTCTGAGCC
59
CTTAAGAAGGGTGGGAGGC
59
TGGCTTATCTGTCTGAGCC
59
CGAGCCTGAGCAATTTATCTC
59
TGGCTTATCTGTCTGAGCC
59
TCTTAAGAAGGGTGGGAGG
58
GGCTTATCTGTCTGAGCCA
59
CCGCCGAGCAATTTATCTC
59
TGGCTTATCTGTCTGAGCC
59
CTTAAGAAGGGTGGGAGGC
59
CATTGATTGGTTGGCCTCAG
59
CTGCATTCTCAGGTTGCTG
59
TCTGTTGGGAGATTCACCAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ROPN1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ROPN1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
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Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HAT0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9HAT0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9HAT0 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ROPN1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Brain Ischemia 0.002367032 1 0 GAD
Cerebrovascular accident 0.002367032 1 0 GAD
Ischemic Cerebrovascular Accident 0.000271442 1 3 BeFree
Varicocele 0.000271442 1 0 BeFree
Ischemic stroke 0.000271442 1 3 BeFree
Hypertensive disease 0.000271442 1 3 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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