RNU12-2P (RNA, U12 small nuclear 2, pseudogene)

symbol:
RNU12-2P
locus group:
pseudogene
location:
Xp11.23
gene_family:
alias symbol:
U12
alias name:
None
entrez id:
26823
ensembl gene id:
ENSG00000201659
ucsc gene id:
uc064ytu.1
refseq accession:
NG_013273
hgnc_id:
HGNC:10109
approved reserved:
1999-12-14
Xp11.23
基因染色体位置图

RNU12-2P是一个假基因(pseudogene),属于U12小核RNA(snRNA)基因家族。假基因是指与功能基因序列相似但通常由于突变失去功能的基因。U12 snRNA是剪接体(spliceosome)的组成部分,参与前体mRNA(pre-mRNA)的剪接过程,即移除内含子(非编码区)并连接外显子(编码区)以形成成熟的mRNA。U12 snRNA主要识别并剪接罕见的U12型内含子(约占人类内含子的0.5%),这类内含子具有特殊的边界序列(AT-AC或GT-AG)。由于RNU12-2P是假基因,它可能不表达或产生无功能的RNA产物,因此对剪接过程没有贡献。假基因通常通过基因组复制或逆转录转座(retrotransposition)产生,并积累突变(如插入、缺失或终止密码子提前),导致功能丧失。尽管RNU12-2P本身可能没有功能,但假基因有时可以调节其同源功能基因的表达,例如通过竞争性结合microRNA或转录因子。目前没有明确证据表明RNU12-2P的突变或表达变化与疾病直接相关,但U12 snRNA的功能异常可能导致剪接缺陷,进而影响基因表达,可能与某些遗传病或癌症有关。U12 snRNA基因家族的共性包括高度保守的序列和结构,以及与次要剪接体(minor spliceosome)的特异性结合。如果RNU12-2P过表达或降低表达,可能对其他基因影响有限,因为它本身是假基因,但理论上过表达可能干扰正常U12 snRNA的功能或调控网络。需要注意的是,假基因的研究仍在进展中,其潜在功能或调控作用可能尚未完全阐明。

None

RNU12-2P基因的碱基序列:[NCBI]
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RNU12-2P基因的碱基突变:           仅显示部分snp

RNU12-2P基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACTGCTAATGTGAGACGA
59
GTAGGCTGGTCACCTTAGG
59
TCACTGCTAATGTGAGACG
57
GTAGGCTGGTCACCTTAGG
59
CACTGCTAATGTGAGACGA
57
GTAGGCTGGTCACCTTAGG
59
      尚未收录相关数据

RNU12-2P基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNU12-2P基因的本体(GO)信息:

可能调控 RNU12-2P基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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