RNU11 (RNA, U11 small nuclear)

symbol:
RNU11
locus group:
non-coding RNA
location:
1p35.3
gene_family:
Small nuclear RNAs
alias symbol:
U11|RNU11-1
alias name:
None
entrez id:
26824
ensembl gene id:
ENSG00000274978
ucsc gene id:
uc009vtj.2
refseq accession:
NR_004407
hgnc_id:
HGNC:10108
approved reserved:
1999-12-14
1p35.3
基因染色体位置图

RNU11是一种小核RNA(small nuclear RNA,简称snRNA),属于U类snRNA家族的一员。U类snRNA家族(U snRNA family)是一类高度保守的非编码RNA分子,主要参与前体mRNA(pre-mRNA)的剪接过程,这是真核生物基因表达调控的关键步骤。剪接是指从pre-mRNA中去除内含子(非编码区)并将外显子(编码区)连接起来形成成熟mRNA的过程。U11 snRNA是次要剪接体(minor spliceosome)的核心组成部分,次要剪接体负责识别和剪接一类特殊的内含子,称为U12型内含子(U12-type intron),这类内含子仅占人类基因组中所有内含子的约0.5%。U11 snRNA通过与U12 snRNA、蛋白质及其他组分形成复合物,识别内含子的5'剪接位点(5' splice site),确保剪接的精确性。如果U11基因发生突变,可能导致次要剪接体功能异常,进而影响含有U12型内含子的基因的表达,这类基因通常参与细胞周期调控、DNA修复等重要生物学过程。U11功能异常可能与某些罕见遗传病或癌症相关,但具体机制仍需进一步研究。目前关于U11过表达或降低表达的研究较少,但理论上,其表达水平的异常可能干扰次要剪接体的平衡,导致剪接错误,影响相关基因的正常功能,甚至引发疾病。U类snRNA家族的共性包括:均由RNA聚合酶II或III转录,经过加工修饰后与特定蛋白质结合形成小核核糖核蛋白颗粒(snRNP),并在剪接体中发挥重要作用。U11 snRNA的功能特点体现了snRNA在基因表达调控中的精细性和复杂性。

None

RNU11基因的碱基序列:[NCBI]
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RNU11基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7368197       rs9426296       rs9426392       rs10127601       rs11801300       rs35910435       rs35986604       rs58069500       rs72663817       rs72663818       rs72887603       rs75100096       rs75113560       rs76909508       rs77143637       rs77870344       rs78813870      

RNU11基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

RNU11基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNU11基因的本体(GO)信息:

可能调控 RNU11基因的相关microRNA:     

BioGrid

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Infection by human herpesvirus 7 0.000271442 1 0 BeFree

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