RNF216 (ring finger protein 216)

symbol:
RNF216
locus group:
protein-coding gene
location:
7p22.1
gene_family:
Ring finger proteins
alias symbol:
TRIAD3|UBCE7IP1|ZIN
alias name:
None
entrez id:
54476
ensembl gene id:
ENSG00000011275
ucsc gene id:
uc003sox.3
refseq accession:
NM_207111
hgnc_id:
HGNC:21698
approved reserved:
2007-08-20
7p22.1
基因染色体位置图

RNF216(Ring Finger Protein 216)是一种编码E3泛素连接酶的基因,属于RING(Really Interesting New Gene)指蛋白家族。该家族的特点是含有保守的RING结构域,能够介导蛋白质的泛素化修饰,从而参与蛋白质降解、信号转导、DNA修复等多种细胞过程。RNF216通过其RING结构域与其他蛋白质相互作用,促进靶蛋白的泛素化,进而调控其稳定性或功能。RNF216在中枢神经系统(尤其是下丘脑和垂体)中表达较高,参与神经发育、突触可塑性以及激素分泌的调控。其主要作用位点包括神经元和内分泌细胞,通过泛素-蛋白酶体系统调节关键蛋白的降解。RNF216的突变可能导致其泛素连接酶活性丧失,与多种神经系统疾病相关,如常染色体隐性遗传的Gordon Holmes综合征(表现为共济失调、性腺功能减退和痴呆)。此外,RNF216的异常表达还与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)和肿瘤发生有关。若RNF216过表达,可能过度降解其靶蛋白,破坏细胞稳态,导致神经功能紊乱或肿瘤抑制蛋白的异常降解;而降低表达则可能使靶蛋白积累,影响信号通路正常功能,例如干扰促性腺激素释放激素(GnRH)的分泌,进而影响生殖发育。RNF216所在的RING指蛋白家族成员普遍参与细胞周期调控、免疫应答和凋亡等过程,通过泛素化修饰精确调控底物蛋白的命运。该基因的功能研究为理解神经系统疾病和肿瘤的分子机制提供了重要线索。

This gene encodes a cytoplasmic protein which specifically colocalizes and interacts with the serine/threonine protein kinase, receptor-interacting protein (RIP). Zinc finger domains of the encoded protein are required for its interaction with RIP and for inhibition of TNF- and IL1-induced NF-kappa B activation pathways. The encoded protein may also function as an E3 ubiquitin-protein ligase which accepts ubiquitin from E2 ubiquitin-conjugating enzymes and transfers it to substrates. Several alternatively spliced transcript variants have been described for this locus but the full-length natures of only some are known. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码特异性共定位,并与丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,受体相互作用蛋白(RIP)相互作用的胞浆蛋白。所编码的蛋白质的锌指结构域都需要其在RIP相互作用和对TNF-α的抑制和IL1诱导的NF-κB的活化通路。所编码的蛋白质也可以用作从E2泛素结合酶和将其传送给基片接受泛素的E3泛素 - 蛋白连接酶。几个可变剪接转录物变体已被用于这个基因座,但仅全长性质描述一些是已知的。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RNF216基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs852260       rs852261       rs852262       rs852263       rs852264       rs852265       rs852266       rs852267       rs1468996       rs3779095       rs3779096       rs3801008       rs3801009       rs3801010       rs3801011       rs3801012       rs3837094      

RNF216基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCCTGTATAAGTACTATGAGCG
58
CTACAGGTTTCCTTTCGGC
58
CCATTTCTGCCAACATCCC
59
CATCATCTTCAGTGGGATCG
58
CTGAATGTGACAGTGTTAACTCC
59
CTGCTCAACTCAGCTTTGG
59
GCTGTATGTTTCGCATCAC
57
ATCAGGGCAAGAAGAAAGG
57
TAATCTCACCACTTTGCCTC
57
ATTGTTGTTTCCCTCTTCCA
57
TAATCTCGACTCACCACGAG
59
TGATCCACTCTGTAATCCCAG
59
TAATCTCGACTCACCACGA
57
TGATCCACTCTGTAATCCCA
57
ACCATTTCTGCCAACATCC
58
ATCATCTTCAGTGGGATCGG
59
TCCAGATGTAGCAAATGGGT
59
GGAGTTAACACTGTCACATTCAG
59
TTGTCCTCCATCTTCCTGC
59
ATGGTGATGCGAAACATACAG
59
      尚未收录相关数据

RNF216基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNF216基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9NWF9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NWF9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NWF9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9NWF9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9NWF9 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
Q9NWF9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016032
Q9NWF9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016874
Q9NWF9 (UniProtKB)
IEA
GO:0032480
Q9NWF9 (UniProtKB)
TAS
GO:0032648
Q9NWF9 (UniProtKB)
IDA
GO:0043161
Q9NWF9 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q9NWF9 (UniProtKB)
IEA
GO:0050691
Q9NWF9 (UniProtKB)
IDA
GO:0061630
Q9NWF9 (UniProtKB)
EXP
GO:0070936
Q9NWF9 (UniProtKB)
IDA

可能调控 RNF216基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Cerebellar Ataxia and Hypogonadotropic Hypogonadism 0.240542884 3 6 BeFree_CLINVAR_UNIPROT
Dementia 0.000271442 1 0 BeFree
Presenile dementia 0.000271442 1 0 BeFree
Chorea 0.000271442 1 0 BeFree
aspirin intolerance 0.000271442 1 0 BeFree
Cerebellar Ataxia 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Obesity 0.000271442 1 0 BeFree

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电话: 0531-88819269

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