RNF13 (ring finger protein 13)

symbol:
RNF13
locus group:
protein-coding gene
location:
3q25.1
gene_family:
Ring finger proteins
alias symbol:
RZF
alias name:
None
entrez id:
11342
ensembl gene id:
ENSG00000082996
ucsc gene id:
uc003exp.5
refseq accession:
NM_183384
hgnc_id:
HGNC:10057
approved reserved:
1999-10-19
3q25.1
基因染色体位置图

RNF13(Ring Finger Protein 13)是一种属于E3泛素连接酶家族的基因,其编码的蛋白质含有RING(Really Interesting New Gene)结构域,该结构域赋予其泛素化功能,即通过标记目标蛋白使其被蛋白酶体降解或改变其活性。RNF13在多种组织中表达,尤其在神经系统和免疫系统中发挥重要作用。它参与调控细胞凋亡、自噬、炎症反应以及内质网应激等过程,主要作用位点包括细胞膜、内质网和高尔基体。RNF13的突变可能导致其泛素化功能异常,进而影响蛋白质稳态,与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)、癌症和自身免疫疾病的发生相关。过表达RNF13可能增强泛素化活性,导致某些关键蛋白的过度降解,从而破坏细胞稳态;而降低表达则可能减少泛素化作用,导致异常蛋白积累,引发细胞功能障碍。RNF13属于RING型E3泛素连接酶家族,该家族成员均含有RING结构域,负责特异性识别底物蛋白并介导泛素化修饰。这一家族的共性是通过泛素-蛋白酶体系统调控蛋白质的稳定性、定位和功能,从而影响多种细胞信号通路。RNF13的具体作用机制和疾病关联仍在研究中,但其在蛋白质质量控制中的关键作用使其成为潜在的治疗靶点。

The protein encoded by this gene contains a RING zinc finger, a motif known to be involved in protein-protein interactions. The specific function of this gene has not yet been determined. Alternatively spliced transcript variants that encode the same protein have been reported. A pseudogene, which is also located on chromosome 3, has been defined for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质包含一个RING锌指,已知参与蛋白质 - 蛋白质相互作用的基序。该基因的特定功能还没有被确定。已经报道了编码相同蛋白可变剪接转录物变体。假基因,也位于3号染色体上,已针对该基因定义。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

RNF13基因的碱基序列:[NCBI]
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RNF13基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7856       rs866234       rs866729       rs1043642       rs1802142       rs3845911       rs3911489       rs4373022       rs6768054       rs6778304       rs6806908       rs7614899       rs11415581       rs11557683       rs11914691       rs34281303       rs34292098      

RNF13基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAGCAGGATACAAGGCAG
59
TAGTACCTCAATGTCGTTGGA
59
TTTCTGTGCCTTTGGAGAG
58
CATGAGCATCCCTATGGAG
57
TAGACTTCCAGCTGAAGGT
58
TTCACAGGCATTCTCTGGT
59
GGACTTCAAGCTGAATCACG
59
CATCCCTATGGAGAGCAGC
60
AGCTAGAAGAAACAGACTTCG
57
ACACTTGCAGTGATAAGCT
57
AGAGCAGGATACAAGGCAG
59
TAGTACCTCAATGTCGTTGGA
59
TGACCTCATTAGCATGGGA
58
TGGAACTAAGATAAGGTGGC
57
GATGTATGTGCCATTTGTTTGG
59
TTGCAGTGATAAGCATGGG
58
GACAGTAAGTACAGTTGAGGT
57
GAACTAAGATAAGGTGGCCC
58
GACAGTAAGTACAGTTGAGGT
57
GAACTAAGATAAGGTGGCCC
58
      尚未收录相关数据

RNF13基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNF13基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
C9IY58 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9IY58 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9J383 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
C9J7B4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9J7B4 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
C9JCY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JCY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C5Q6 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
O43567 (UniProtKB)
IEA
GO:0004842
O43567 (UniProtKB)
ISS
GO:0005515
O43567 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43567 (UniProtKB)
IPI
GO:0005637
O43567 (UniProtKB)
IEA
GO:0005765
O43567 (UniProtKB)
ISS
GO:0005765
O43567 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
O43567 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
O43567 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
O43567 (UniProtKB)
IEA
GO:0016874
O43567 (UniProtKB)
IEA
GO:0031902
O43567 (UniProtKB)
ISS
GO:0051865
O43567 (UniProtKB)
ISS
GO:0061630
O43567 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RNF13基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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