RNASEL (ribonuclease L)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RNASEL
locus group:
protein-coding gene
location:
1q25.3
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
6041
ensembl gene id:
ENSG00000135828
ucsc gene id:
uc009wxz.3
refseq accession:
NM_021133
hgnc_id:
HGNC:10050
approved reserved:
1993-06-09

基因染色体位置

基因染色体位置

1q25.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a component of the interferon-regulated 2-5A system that functions in the antiviral and antiproliferative roles of interferons. Mutations in this gene have been associated with predisposition to prostate cancer and this gene is a candidate for the hereditary prostate cancer 1 (HPC1) allele. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的干扰素调节2-5A系统，在抗病毒和干扰素的抗增殖作用的功能的一个组件。在这种基因突变与易感性前列腺癌相关联，并且该基因是遗传性前列腺癌1（HPC1）等??位基因的候选者。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RNASEL基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs11072       rs486907       rs501286       rs516134       rs533259       rs557934       rs579006       rs589402       rs589974       rs611280       rs618685       rs620070       rs627928       rs641265       rs642917       rs672018       rs672527      

基因表达

基因表达

RNASEL基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGATCTAGAGGACCTTGGAC
59
ACTTTGAGCTTTCAGATCCTC
58
AGATCTAGAGGACCTTGGAC
58
ACTTTGAGCTTTCAGATCCTC
58
ATCTAGAGGACCTTGGACG
58
TACTTTGAGCTTTCAGATCCTC
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
BRCA1
RNASEL
Activation
15940267

基因本体信息

RNASEL基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNASEL基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
Q05823 (UniProtKB)
IDA
GO:0004521
Q05823 (UniProtKB)
NAS
GO:0004672
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q05823 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0005575
Q05823 (UniProtKB)
ND
GO:0005759
Q05823 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q05823 (UniProtKB)
TAS
GO:0006364
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0006397
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
Q05823 (UniProtKB)
NAS
GO:0016363
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0019843
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0043021
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0043488
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0045071
Q05823 (UniProtKB)
IDA
GO:0045444
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q05823 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:0051607
Q05823 (UniProtKB)
IDA
GO:0055085
Q05823 (UniProtKB)
TAS
GO:0060337
Q05823 (UniProtKB)
TAS
GO:0090502
Q05823 (UniProtKB)
IEA
GO:2001275
Q05823 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RNASEL基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostate cancer, familial 0.36434307 16 6 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
Prostatic Neoplasms 0.17194822 21 2 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Multiple Sclerosis 0.12 1 1 GWASCAT
Malignant neoplasm of prostate 0.061998501 59 7 BeFree_GAD
Prostate carcinoma 0.014386419 53 4 BeFree
Chronic Fatigue Syndrome 0.006534468 5 0 BeFree_LHGDN
Fatigue 0.005991584 3 0 BeFree_LHGDN
Infection 0.0054487 2 0 LHGDN
Hepatitis C 0.003452799 5 0 BeFree_GAD
Virus Diseases 0.003257302 12 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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