RNASEK-C17orf49 (RNASEK-C17orf49 readthrough)

symbol:
RNASEK-C17orf49
locus group:
other
location:
17p13.1
gene_family:
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None
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None
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100529209
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ENSG00000161939
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uc060agz.1
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NR_037717
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HGNC:44419
approved reserved:
2012-10-08
17p13.1
基因染色体位置图

RNASEK-C17orf49是一个位于人类17号染色体上的基因,属于核糖核酸酶K(RNASEK)基因家族。该基因编码的蛋白质与核糖核酸酶活性相关,可能在RNA代谢和降解过程中发挥作用。RNASEK基因家族的共性在于它们编码的蛋白质通常具有核酸酶活性,参与RNA的加工、降解或调控,从而影响基因表达和细胞功能。RNASEK-C17orf49的具体功能尚未完全明确,但研究表明它可能在维持细胞内RNA稳态中起重要作用。该基因的表达产物可能在核糖体生物发生或mRNA稳定性调控中发挥作用,影响蛋白质合成的效率。突变或表达异常可能导致RNA代谢紊乱,进而影响细胞正常功能。目前的研究尚未明确将该基因与特定疾病直接关联,但RNA代谢异常与多种疾病(如神经退行性疾病和癌症)有关,因此RNASEK-C17orf49的异常表达可能间接参与这些病理过程。如果该基因过表达,可能导致RNA过度降解,影响正常基因表达模式;而降低表达则可能使RNA积累,干扰细胞功能。该基因可能与其他RNA代谢相关基因(如核糖核酸酶或RNA结合蛋白编码基因)存在功能上的相互作用。由于研究仍在进行中,RNASEK-C17orf49的详细机制和生理病理作用需要进一步探索。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring RNASEK (ribonuclease, RNase K) and C17orf49 (chromosome 17 open reading frame 49) genes. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD) and is unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Jan 2011]

这一位点代表自然发生的周边RNASEK(核糖核酸酶,RNA酶K)和C17orf49(染色体17开放阅读框49)基因之间通读转录。在通读成绩单是无义介导的mRNA降解(NMD)的候选人,是不可能产生的蛋白产物。 [由RefSeq的,2011年1月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RNASEK-C17orf49基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3010       rs312463       rs1510604       rs2271316       rs11571353       rs11571354       rs11571355       rs11571356       rs11571365       rs11571366       rs56122361       rs57177126       rs72834412       rs73979717       rs74530795       rs77381985       rs79285097      

RNASEK-C17orf49基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCATGTTGATAATGCTCGG
57
ATCTTTCTCCGTGAAGGGA
58
ACAACTGTTTCATCGCTGC
60
CTCTCCGACCATGTATTCCT
59
TTGATTGAGGACGTTCCCT
59
CGTAAAGGTTGTATATGTTCTGGG
60
GGAGTGATCATATAATGCTCGG
59
ATCTTTCTCCGTGAAGGGA
58
AAACAGAAGGCTGATGTGAC
58
TCCTAGCCCTTCAATATCCAC
59
TTGAGGACGTTCCCTTCAC
60
CTCGTAAAGGTTGTATATGTTCTGG
60
AAACAGAAGGCTGATGTGAC
58
TCCTAGCCCTTCAATATCCA
57
CAACTGTTTCATCGCTGCA
60
CTCTCCGACCATGTATTCCT
59
GAGTGATCATATAATGCTCGGA
58
AATCTTTCTCCGTGAAGGG
57
TCATGTTGATAATGCTCGGA
57
AAATCTTTCTCCGTGAAGGG
58
      尚未收录相关数据

RNASEK-C17orf49基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNASEK-C17orf49基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
H0YIS7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YIS7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RNASEK-C17orf49基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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