RMRP (RNA component of mitochondrial RNA processing endoribonuclease)

symbol:
RMRP
locus group:
non-coding RNA
location:
9p13.3
gene_family:
alias symbol:
RMRPR|RRP2|NME1
alias name:
RNase MRP RNA
entrez id:
6023
ensembl gene id:
ENSG00000277027
ucsc gene id:
uc003zxh.2
refseq accession:
NR_003051
hgnc_id:
HGNC:10031
approved reserved:
1989-06-30
9p13.3
基因染色体位置图

RMRP(RNA Component of Mitochondrial RNA Processing Endoribonuclease)是一种非编码RNA基因,属于核糖核酸酶MRP复合物的核心组成部分。该基因位于人类9号染色体(9p13.3),其转录产物是线粒体RNA加工内切核糖核酸酶(RNase MRP)的功能性RNA组分。RNase MRP是一种核糖核蛋白复合物,具有内切核糖核酸酶活性,主要参与线粒体DNA复制起始位点的RNA加工(切割前导链RNA以启动线粒体DNA复制)以及核糖体RNA(如5.8S rRNA)的成熟过程。RMRP基因突变会导致多种疾病,最常见的是软骨-毛发发育不全(Cartilage-Hair Hypoplasia, CHH),这是一种常染色体隐性遗传病,表现为短肢侏儒症、毛发稀疏、免疫缺陷和癌症易感性。突变通常发生在RMRP的启动子区域或保守功能域,影响RNase MRP的组装或酶活性,进而干扰线粒体功能、核糖体生物合成和细胞周期调控。该基因属于小核仁RNA(snoRNA)家族中的H/ACA box类,这类RNA通常指导rRNA的假尿苷酸化修饰,但RMRP是例外,它通过形成特定二级结构与其他蛋白质结合行使切割功能。过表达RMRP可能破坏RNA加工平衡,导致核糖体生成异常或线粒体功能障碍;而表达降低则直接影响线粒体DNA复制和rRNA成熟,引发能量代谢障碍或细胞增殖缺陷。研究发现RMRP的表达水平与某些癌症(如白血病、乳腺癌)进展相关,其调控异常可能通过影响细胞凋亡或端粒酶活性促进肿瘤发生。

This gene encodes the RNA component of mitochondrial RNA processing endoribonuclease, which cleaves mitochondrial RNA at a priming site of mitochondrial DNA replication. This RNA also interacts with the telomerase reverse transcriptase catalytic subunit to form a distinct ribonucleoprotein complex that has RNA-dependent RNA polymerase activity and produces double-stranded RNAs that can be processed into small interfering RNA. Mutations in this gene are associated with cartilage-hair hypoplasia.[provided by RefSeq, Mar 2010]

这个基因编码的线粒体RNA加工内切核糖核酸酶的RNA组分,其裂解线粒体RNA在线粒体DNA复制的引发位点。该RNA也与端粒酶相互作用逆转录酶催化亚基以形成具有RNA依赖性RNA聚合酶活性,并产生可以被加工成小干扰RNA双链RNA鲜明核糖核蛋白复合物。在这个基因的突变与软骨毛发发育不全有关。[由RefSeq的,2010年3月提供]

RMRP基因的碱基序列:[NCBI]
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RMRP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1890593       rs3750430       rs3829076       rs3829077       rs7021463       rs7021642       rs7024732       rs7029668       rs10441724       rs10441725       rs10441726       rs10972553       rs12115438       rs12551232       rs12552387       rs45622432       rs61740130      

RMRP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTGAGGACTCTGTTCCTC
58
ATGTCTACGTGCGTATGCA
60
ACTGAGGACTCTGTTCCTC
58
ATGTCTACGTGCGTATGCA
59
CTGAGGACTCTGTTCCTCC
58
AATGTCTACGTGCGTATGC
58
CTGAGGACTCTGTTCCTCC
59
AATGTCTACGTGCGTATGC
58
CTGAGGACTCTGTTCCTCC
58
ATGTCTACGTGCGTATGCA
59
CTGAGGACTCTGTTCCTCC
59
ATGTCTACGTGCGTATGCA
60
      尚未收录相关数据

RMRP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RMRP基因的本体(GO)信息:

可能调控 RMRP基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Cartilage-hair hypoplasia 0.37302921 48 8 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
Anauxetic dysplasia 0.360814326 3 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
METAPHYSEAL DYSPLASIA WITHOUT HYPOTRICHOSIS 0.240271442 1 2 BeFree_CLINVAR_CTD_human
Omenn Syndrome 0.12 0 0 ORPHANET
Neoplasm Metastasis 0.004614512 17 0 BeFree
Dwarfism 0.003800186 14 0 BeFree
Aplastic Anemia 0.00272435 1 0 LHGDN
Metaphyseal chondrodysplasia 0.002714419 10 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.001357209 5 0 BeFree
Skeletal dysplasia 0.001357209 5 0 BeFree

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