RIT1 (Ras like without CAAX 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RIT1
locus group:
protein-coding gene
location:
1q22
gene_family:
RAS type family GTPases
alias symbol:
RIBB|ROC1|MGC125864|MGC125865
alias name:
Ric-like, expressed in many tissue…
entrez id:
6016
ensembl gene id:
ENSG00000143622
ucsc gene id:
uc001fmh.3
refseq accession:
NM_006912
hgnc_id:
HGNC:10023
approved reserved:
1996-08-28

基因染色体位置

基因染色体位置

1q22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a member of a subfamily of Ras-related GTPases. The encoded protein is involved in regulating p38 MAPK-dependent signaling cascades related to cellular stress. This protein also cooperates with nerve growth factor to promote neuronal development and regeneration. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2012]

该基因编码的Ras相关GTP酶亚家族的一个成员。所编码的蛋白质是参与调节有关细胞应激p38蛋白依赖性信号级联。这种蛋白质也与神经生长因子的合作，促进神经元的发育和再生。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2012年2月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RIT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs708614       rs41264985       rs57810844       rs71628697       rs75009387       rs76644993       rs76903692       rs111951730       rs186541684       rs529516575       rs534301604       rs545495997       rs562026387       rs564079590       rs568161866       rs490498       rs493446      

基因表达

基因表达

RIT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATGCTTATAAGATCAGGATCCG
59
TAAACTCTGCCTGTCCAGC
60
GATGCTTATAAGATCAGGATCCG
59
TAAACTCTGCCTGTCCAGC
60
TAGGGAAGAGTGCCATGAC
59
ATGATCTGGCTTACCAATGGT
60
GATGCTTATAAGATCAGGATCCG
59
TAAACTCTGCCTGTCCAGC
60
CTAAGACAGGTCACCAAGGA
59
GGTATGCAGCAGATGTCTC
58
GATGCTTATAAGATCAGGATCCG
59
CTCTGCCTGCTATCCTGTC
60
GATGCTTATAAGATCAGGATCCG
59
TAAACTCTGCCTGTCCAGC
60
TGCTTATAAGATCAGGATCCGT
59
TGTAAACTCTGCCTGTCCA
59
GACGTACTGACGATACACC
58
CTTCTTCCTTGGTGACCTG
58
TGCTTATAAGATCAGGATCCGT
59
TGTAAACTCTGCCTGTCCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RIT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RIT1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q92963 (UniProtKB)
IPI
GO:0005516
Q92963 (UniProtKB)
TAS
GO:0005525
Q92963 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
Q92963 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
Q92963 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q92963 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
Q92963 (UniProtKB)
TAS
GO:0007265
Q92963 (UniProtKB)
IDA
GO:0005525
V9GY29 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
V9GY29 (UniProtKB)
IEA
GO:0007264
V9GY29 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
V9GY29 (UniProtKB)
IEA
GO:0005525
V9GYC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
V9GYC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007264
V9GYC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
V9GYC3 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RIT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
NOONAN SYNDROME 8 0.24 1 2 CLINVAR_UNIPROT
Noonan Syndrome 0.120542884 2 0 BeFree_ORPHANET
Inflammatory Bowel Diseases 0.12 1 1 GWASCAT
Liver carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Conduct Disorder 0.002367032 1 1 GAD
Malignant neoplasm of liver 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Heart Defects 0.000271442 1 0 BeFree
Liver and Intrahepatic Biliary Tract Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Craniofacial Abnormalities 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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