RHO (rhodopsin)

symbol:
RHO
locus group:
protein-coding gene
location:
3q22.1
gene_family:
Opsin receptors
alias symbol:
OPN2|CSNBAD1
alias name:
opsin 2, rod pigment
entrez id:
6010
ensembl gene id:
ENSG00000163914
ucsc gene id:
uc003emt.4
refseq accession:
NM_000539
hgnc_id:
HGNC:10012
approved reserved:
1986-01-01
3q22.1
基因染色体位置图

RHO基因编码视紫红质(rhodopsin),是一种在视网膜视杆细胞中高度表达的G蛋白偶联受体(GPCR),属于视蛋白(opsin)基因家族。视紫红质是视觉光转导的关键分子,负责在弱光条件下感知光线。当光线照射时,视紫红质的发色团11-顺式视黄醛(11-cis-retinal)异构化为全反式视黄醛,触发构象变化并激活转导蛋白(transducin),进而启动光信号传导级联反应。RHO基因突变是常染色体显性视网膜色素变性(adRP)最常见的原因,占病例的20-30%。突变可能导致视紫红质错误折叠、异常运输或功能丧失,引发视杆细胞凋亡和进行性视力丧失。常见的致病突变包括P23H(脯氨酸23替换为组氨酸)和R135W(精氨酸135替换为色氨酸)。RHO基因过表达可能导致蛋白质错误折叠堆积,激活未折叠蛋白反应(UPR),加剧细胞应激;而表达降低则直接损害光感受器功能,导致夜盲症。视蛋白家族成员(如视锥细胞的视蛋白)均具有七次跨膜结构,依赖视黄醛发色团,但光谱敏感性不同。研究显示某些RHO突变体可能具有毒性增益功能(toxic gain-of-function),异常激活信号通路,这为基因治疗策略(如CRISPR编辑或AAV载体递送)提供了靶点。值得注意的是,RHO突变表型存在差异,部分突变导致早发型严重视网膜变性,而另一些仅引起晚发型症状,这种异质性与突变具体影响的蛋白质结构域(如胞内环、跨膜区)密切相关。

Retinitis pigmentosa is an inherited progressive disease which is a major cause of blindness in western communities. It can be inherited as an autosomal dominant, autosomal recessive, or X-linked recessive disorder. In the autosomal dominant form,which comprises about 25% of total cases, approximately 30% of families have mutations in the gene encoding the rod photoreceptor-specific protein rhodopsin. This is the transmembrane protein which, when photoexcited, initiates the visual transduction cascade. Defects in this gene are also one of the causes of congenital stationary night blindness. [provided by RefSeq, Jul 2008]

视网膜色素变性是一种遗传性疾病是西方社会失明的主要原因。它可作为常染色体显性,常染色体隐性,或X连锁隐性疾病。在常染色体显性形式,其包括占全部病例的约25%,家庭的大约30%具有在编码棒状特定感光体蛋白的视紫红质的基因突变。这是跨膜蛋白,其,光激发时,启动视觉转导级联。在这个基因的缺陷也先天性静止性夜盲的原因之一。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

RHO基因的碱基序列:[NCBI]
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RHO基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2410       rs7984       rs2071092       rs2071093       rs2269736       rs2625953       rs2625954       rs2625955       rs2855552       rs2855557       rs2855558       rs3733148       rs3733149       rs3755837       rs6803468       rs6803484       rs11359208      

RHO基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGATGAACAAGCAGTTCCG
59
GTCCTAGGCAGGTCTTAGG
59
TGATGAACAAGCAGTTCCG
59
GTCCTAGGCAGGTCTTAGG
59
GATGAACAAGCAGTTCCGG
59
GTCCTAGGCAGGTCTTAGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CRX
RHO
Repression
KLF15
RHO
Repression
KLF15
RHO
Unknown
NR2E3
RHO
Activation
NRL
RHO
Repression
NRL
RHO
Unknown
SOX2
RHO
Repression

RHO基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RHO基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0001523
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0001750
P08100 (UniProtKB)
IDA
GO:0001750
P08100 (UniProtKB)
IDA
GO:0001917
P08100 (UniProtKB)
IDA
GO:0004930
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P08100 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08100 (UniProtKB)
IPI
GO:0005794
P08100 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P08100 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0005911
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0007186
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0007601
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0007603
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0008020
P08100 (UniProtKB)
IBA
GO:0009585
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0016038
P08100 (UniProtKB)
ISS
GO:0016038
P08100 (UniProtKB)
ISS
GO:0016056
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0016918
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0018298
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0022400
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0030660
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0030660
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0030660
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0030867
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0042622
P08100 (UniProtKB)
IDA
GO:0045494
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0060041
P08100 (UniProtKB)
IEA
GO:0060170
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0060342
P08100 (UniProtKB)
IDA
GO:0097381
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0097381
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0097381
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0097381
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0097381
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0097381
P08100 (UniProtKB)
TAS
GO:0097381
P08100 (UniProtKB)
TAS

可能调控 RHO基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Retinitis Pigmentosa 0.464557081 149 14 BeFree_CLINVAR_CTD_human_GAD_LHGDN_ORPHANET
Night Blindness, Congenital Stationary, Autosomal Dominant 1 0.44 3 3 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Retinitis Pigmentosa 4 0.44 17 34 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Night blindness, congenital stationary 0.241900093 7 2 BeFree_CTD_human_ORPHANET
Fundus Albipunctatus 0.240542884 2 0 BeFree_CTD_human_ORPHANET
Retinal Degeneration 0.130314791 39 3 BeFree_CTD_human
Retinitis punctata albescens (disorder) 0.122909916 2 1 BeFree_CLINVAR_GAD
Autosomal dominant retinitis pigmentosa 0.037925917 131 13 BeFree_GAD
Retinal Diseases 0.010987159 15 1 BeFree_GAD_LHGDN
Night Blindness 0.006991475 8 2 BeFree_GAD_LHGDN

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