RHCE (Rh blood group CcEe antigens)

symbol:
RHCE
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.11
gene_family:
Blood group antigens|CD molecules
alias symbol:
CD240CE
alias name:
None
entrez id:
6006
ensembl gene id:
ENSG00000188672
ucsc gene id:
uc001bkf.4
refseq accession:
NM_020485
hgnc_id:
HGNC:10008
approved reserved:
1993-10-22
1p36.11
基因染色体位置图

RHCE基因位于人类1号染色体(1p36.11),属于Rhesus(Rh)血型系统基因家族,该家族还包括RHD基因。Rh基因家族编码红细胞膜表面的重要抗原蛋白,决定个体的Rh血型(如Rh阳性或阴性)。RHCE基因编码的RhCE蛋白是一种跨膜糖蛋白,与RHD蛋白共同构成红细胞膜上的Rh复合物,负责维持红细胞形态稳定性和氨运输功能。该蛋白主要表达于红细胞表面,其抗原决定簇(epitopes)可引发输血反应或新生儿溶血病。RHCE基因存在高度多态性,常见等位基因包括ce、Ce、cE、CE等组合,决定不同的Rh抗原组合(如C/c和E/e抗原)。RHCE基因突变可能导致Rh抗原缺失或弱表达,引发罕见病症如Rh缺失综合征(Rh deficiency syndrome),表现为溶血性贫血和红细胞形态异常( stomatocytosis,口形红细胞增多症)。RHCE与RHD基因的缺失或突变会导致Rh阴性血型,在输血或妊娠中若Rh阴性个体接触Rh阳性血液可能产生抗Rh抗体。RHCE过表达尚未见明确病理报道,但该基因表达水平变化可能影响红细胞膜稳定性;而低表达或缺失会导致红细胞寿命缩短。该基因与新生儿溶血病(HDN)、自身免疫性溶血性贫血(AIHA)等疾病相关。Rh蛋白家族共性在于:均为12次跨膜蛋白,具有氨转运功能,在红细胞膜上形成复合物,并携带多种血型抗原表位。专业术语解释:抗原决定簇(epitope)指能被抗体识别的蛋白质特定区域;口形红细胞(stomatocyte)是中央凹陷呈杯状的红细胞形态异常;跨膜蛋白指贯穿细胞膜结构的蛋白质。英文注释:Rhesus(Rh)、epitopes(抗原表位)、stomatocytosis(口形红细胞增多症)、hemolytic disease of the newborn(HDN,新生儿溶血病)。

The Rh blood group system is the second most clinically significant of the blood groups, second only to ABO. It is also the most polymorphic of the blood groups, with variations due to deletions, gene conversions, and missense mutations. The Rh blood group includes this gene which encodes both the RhC and RhE antigens on a single polypeptide and a second gene which encodes the RhD protein. The classification of Rh-positive and Rh-negative individuals is determined by the presence or absence of the highly immunogenic RhD protein on the surface of erythrocytes. A mutation in this gene results in amorph-type Rh-null disease. Alternative splicing of this gene results in four transcript variants encoding four different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Rh血型系统是血型的第二临床最显著,仅次于ABO。它也是最具多态性的血型,与因缺失变异,基因转换和错义突变。 Rh血型包括该基因编码都在一个单一的多肽的RHC和RHE抗原和其编码的RhD蛋白的第二基因。 Rh阳性和Rh阴性个体的分类是由红细胞的表面上的存在或不存在的高度免疫原性的RhD蛋白的测定。在amorph型的Rh空疾病这个基因导致的突变。在四个转录该基因的结果选择性剪接变异体的编码四种不同的亚型。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

RHCE基因的碱基序列:[NCBI]
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RHCE基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7694       rs8876       rs9689       rs12835       rs15309       rs581970       rs582674       rs582675       rs582717       rs584607       rs585488       rs586178       rs586338       rs586419       rs586434       rs586839       rs588880      

RHCE基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGCAGCTCTCATTCTCCTC
60
CCAGCCGAATACTTGATAGGA
60
TAGCAGTCAGTGTGGTGAC
59
TGTGCACATAAGTCATGCTG
59
CCCTGAGGATGGTCATCAG
59
ATTTAGGAGCAAACCTGTCAG
58
GTCACCTGATCCCTTCTCC
59
ATGACGGAGATGTGGAATCC
60
ATGCACTCCATCTTCAGCT
59
AAGCCAATCATGCCATTGC
60
ATGCACTCCATCTTCAGCT
59
AAGCCAATCATGCCATTGC
60
ACTCCATCTTCAGCTTGCT
59
ATTTAGGAGCAAACATGCCA
58
ATATCTTCAACGATTGGCTTCC
59
TTTAGCCACATGAGGTGCT
59
AATCCAGAACCAGAAGTCGG
60
GTCTCCGGAAATTTGAGGTG
59
CTTCAACCTCTTCATGCTGG
59
CAGCCGAATACTGAACAGTG
59
      尚未收录相关数据

RHCE基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RHCE基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008519
E7EMF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E7EMF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0072488
E7EMF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0008519
E7EQ47 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E7EQ47 (UniProtKB)
IEA
GO:0072488
E7EQ47 (UniProtKB)
IEA
GO:0008519
E7EU00 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E7EU00 (UniProtKB)
IEA
GO:0072488
E7EU00 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PKB3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008519
F6XSS0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F6XSS0 (UniProtKB)
IEA
GO:0072488
F6XSS0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
P18577 (UniProtKB)
TAS
GO:0008519
P18577 (UniProtKB)
IBA
GO:0015695
P18577 (UniProtKB)
IBA
GO:0019740
P18577 (UniProtKB)
IBA
GO:0072488
P18577 (UniProtKB)
IBA
GO:0008519
Q5VSJ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5VSJ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0072488
Q5VSJ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0008519
Q5VSJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5VSJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0072488
Q5VSJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008519
Q5VSJ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5VSJ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0072488
Q5VSJ9 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RHCE基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Rh-Null Disease, Amorph Type 0.12 0 0 CLINVAR
Rh Deficiency Syndrome 0.12 0 0 ORPHANET
Anemia, Hemolytic, Congenital 0.12 1 0 CTD_human
Rh Isoimmunization 0.002367032 1 0 GAD
Blood Group Incompatibility 0.002367032 1 0 GAD
Liver Cirrhosis, Alcoholic 0.002367032 1 0 GAD
Malaria 0.002367032 1 0 GAD
Anemia, Sickle Cell 0.001085767 4 0 BeFree
melanoma 0.000814326 3 8 BeFree
SKIN/HAIR/EYE PIGMENTATION, VARIATION IN, 2 (disorder) 0.000542884 2 0 BeFree

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