RHBDF2 (rhomboid 5 homolog 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RHBDF2
locus group:
protein-coding gene
location:
17q25.1
gene_family:
Rhomboid family
alias symbol:
FLJ22341|RHBDL5|TOCG|iRhom2
alias name:
None
entrez id:
79651
ensembl gene id:
ENSG00000129667
ucsc gene id:
uc060kji.1
refseq accession:
NM_024599
hgnc_id:
HGNC:20788
approved reserved:
2004-07-07

基因染色体位置

基因染色体位置

17q25.1
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RHBDF2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8150       rs2289801       rs2289802       rs7216872       rs7221225       rs8071747       rs8073245       rs11553544       rs73998911       rs77076744       rs111924263       rs116097888       rs137910466       rs143692182       rs182666434       rs190511294       rs193028838      

基因表达

基因表达

RHBDF2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACCTCTCCATCACCATCC
59
AAGTAGGCTGGGTTCTTCC
59
ATCCCTCTGAAGGAGTATGG
58
CAAAGTGCTTCACCTTGGA
58
TCTAAAGCCCTTCACAGCA
59
TCCTACCTTCGAGTCTGAG
58
AACCTCTCCATCACCATCC
59
CTGGGTTCTTCCTCTCAGG
59
GCAAACTCAGACTCGAAGC
59
CATTCTTGTCAGCAGAGGC
59
TCTCTTCCTACATGCTGGC
59
AGGATGGTCATTTGAAAGACC
58
CATGCTCTAAAGCCCTTCAC
59
CCTTCGAGTCTGAGTTTGC
59
AATCCCTCTGAAGGAGTATGG
59
AAAGTGCTTCACCTTGGAG
58
CTGCCTGAGAGGAAGAACC
60
CGCTTCTCTGAACTCTCCT
59
TCTCTTCCTACATGCTGGC
59
GGATGGTCATTTGAAAGACCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RHBDF2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RHBDF2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004252
K7EKI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
K7EKI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
K7EKI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004252
K7EPN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
K7EPN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
K7EPN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004252
K7EPV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
K7EPV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
K7EPV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005789
Q6PJF5 (UniProtKB)
ISS
GO:0005789
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q6PJF5 (UniProtKB)
IDA
GO:0015031
Q6PJF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q6PJF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0019838
Q6PJF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0042058
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0050708
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0050709
Q6PJF5 (UniProtKB)
ISS
GO:0004252
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0016485
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RHBDF2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
TYLOSIS WITH ESOPHAGEAL CANCER 0.360271442 2 2 BeFree_CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
PALMOPLANTAR KERATODERMA, NONEPIDERMOLYTIC 0.002442977 9 0 BeFree
Keratoderma, Palmoplantar, Diffuse 0.002442977 9 0 BeFree
Hyperkeratosis 0.002442977 9 0 BeFree
Malignant neoplasm of esophagus 0.002171535 8 0 BeFree
Extraskeletal Myxoid Chondrosarcoma 0.002171535 8 0 BeFree
Esophageal carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Esophageal Neoplasms 0.001085767 4 0 BeFree
Chondrosarcoma 0.000814326 3 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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