RGPD6 (RANBP2 like and GRIP domain containing 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RGPD6
locus group:
protein-coding gene
location:
2q13
gene_family:
Tetratricopeptide repeat domain containing
alias symbol:
RGP6
alias name:
None
entrez id:
729540
ensembl gene id:
ENSG00000183054
ucsc gene id:
uc061mvo.1
refseq accession:
NM_001123363
hgnc_id:
HGNC:32419
approved reserved:
2005-12-15

基因染色体位置

基因染色体位置

2q13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

RGPD6（RANBP2-like and GRIP domain containing 6）属于RANBP2/GRIP家族，该家族成员通常含有重复的RAN结合蛋白2（RANBP2）样结构域和GRIP（glutamate receptor-interacting protein）结构域，主要参与细胞内运输、核质转运和蛋白质相互作用等过程。RGPD6位于人类染色体2q13，是一个旁系同源基因，可能通过基因复制事件产生。该基因编码的蛋白质可能参与细胞核与细胞质之间的物质运输，尤其是与RAN GTP酶循环相关的功能，但具体生物学功能尚未完全明确。RANBP2/GRIP家族成员的共性是参与核孔复合体的形成或维持，并调控大分子（如RNA和蛋白质）的核质转运。若RGPD6发生突变，可能影响其与其他蛋白质（如核转运受体）的相互作用，导致细胞内运输紊乱，但目前尚未发现与特定疾病的直接关联。过表达RGPD6可能干扰正常的核质转运平衡，影响细胞周期或信号传导；而表达降低可能导致运输效率下降，但具体表型尚需进一步研究。值得注意的是，RGPD6所在的染色体区域与某些癌症和神经发育障碍相关，但其作用机制仍需验证。由于该基因研究较少，许多功能推测基于其家族共性，未来需通过实验确认其在特定通路或疾病中的角色。

None

无

OMIM数据库中对RGPD6基因的介绍     Wikipedia数据库中对RGPD6基因的介绍

基因序列

基因序列

RGPD6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RGPD6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs533459346       rs534722851       rs536939335       rs539616441       rs542312717       rs544481614       rs553220243       rs554218460       rs555402472       rs557330626       rs561925558       rs564410702       rs568096595       rs573217362       rs575627995       rs577093553       rs2464078      

基因表达

基因表达

RGPD6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAACATGGCCTTCAACCTG
59
AAAGAATTAAGACCGCTGCC
59
AGCTCACAGATTTCTGGGT
59
TAATTCCACTGAACGCCTG
58
GCTCACAGATTTCTGGGTC
58
TTTAATTCCACTGAACGCCT
58
AGCTCACAGATTTCTGGGT
58
TAATTCCACTGAACGCCTG
57
AGAATTATGGACCAGACTCGG
59
GTGCTGCTTCTGTTAGTGG
59
CCAATCAGCGATGATATTGGA
58
CCATTATGTGCTCGAATAGCA
59
AGCATTTCAGGTTCCAAGAC
58
TCACAGGCCATCATTTCCA
59
CGGTTGCTCAAGATGAGGA
60
CCATCAACCTATCGAAGTCCA
60
CTCGACAGTCAATGAAAGGA
58
GAAATCTGTGAGCTTTGGGA
58
GTGACAAGAAGTCAATGAAAGG
58
CAGAAATCTGTGAGCTTTGG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RGPD6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RGPD6基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RGPD6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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