RGN (regucalcin)

symbol:
RGN
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.3
gene_family:
alias symbol:
SMP30|RC
alias name:
senescence marker protein-30|gluco…
entrez id:
9104
ensembl gene id:
ENSG00000130988
ucsc gene id:
uc004dgz.2
refseq accession:
NM_004683
hgnc_id:
HGNC:9989
approved reserved:
1999-02-03
Xp11.3
基因染色体位置图

RGN(Regucalcin)是一种钙结合蛋白,主要表达于肝脏和肾脏,但在其他组织如脑、心脏和骨骼肌中也有分布。它的生物学功能包括调节细胞内钙离子浓度、抑制钙依赖性蛋白激酶和磷酸酶的活性,从而参与细胞信号传导、增殖、凋亡和氧化应激反应的调控。RGN也被称为 senescence marker protein-30(SMP30),因其表达水平随年龄增长而下降,与细胞衰老相关。该基因位于X染色体上(Xp11.3-p11.23),其表达受多种激素(如雌激素、甲状腺激素)和氧化应激的调节。RGN通过维持钙稳态保护细胞免受氧化损伤,并可能参与肝脏解毒功能。突变或表达异常可能导致钙信号紊乱,与衰老相关疾病、神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)、糖尿病和某些癌症有关。RGN过表达可增强细胞抗氧化能力,减少凋亡,而表达降低则加速衰老并增加氧化损伤敏感性。RGN属于钙结合蛋白家族,该家族成员通常具有EF-hand结构域,能特异性结合钙离子并参与细胞钙信号调控。研究表明,RGN可能通过调节钙信号通路影响其他基因的表达或功能,如p53、Bcl-2家族成员等,进而调控细胞命运。

The protein encoded by this gene is a highly conserved, calcium-binding protein, that is preferentially expressed in the liver and kidney. It may have an important role in calcium homeostasis. Studies in rat indicate that this protein may also play a role in aging, as it shows age-associated down-regulation. This gene is part of a gene cluster on chromosome Xp11.3-Xp11.23. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

由该基因编码的蛋白质是高度保守的,钙结合蛋白,其是在肝脏和肾脏中优先表达。它可以具有在钙稳态中起重要作用。在鼠的研究表明,这种蛋白还可以在老化中发挥作用,因为它显示了与年龄有关的下调。该基因是在染色体Xp11.3-Xp11.23基因簇的一部分。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2013年9月提供]

RGN基因的碱基序列:[NCBI]
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RGN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782813242       rs782802984       rs782809181       rs782802055       rs782794572       rs782786434       rs782784886       rs782775416       rs782784253       rs782768854       rs782758107       rs782757831       rs782753370       rs782752992       rs782752642       rs782748186       rs782747625      

RGN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTCAAGATAACTGGTCTGGG
58
AGAAGACCTGTCCTCATCC
58
ACAGGACAGATCTCCAACC
59
CTCAGCATCAATACACATTCCA
59
GAAACACGTCACTGATCTCC
59
TACTGGAGACTCACCACAC
58
AACCTTCAGATTCCCAGGG
59
ATTATCTGTGCGGGTGAGAG
60
AACACGTCACTGATCTCCC
59
ATACTGGAGACTCACCACAC
59
CAACCTTCAGATTCCCAGG
58
TTATCTGTGCGGGTGAGAG
59
TTTCAAGATAACTGGTCTGGG
58
GAAGACCTGTCCTCATCCC
59
CTTCTATTACATTGACAGCCTGTC
60
TTCTGCGGTTGGAGATCTG
60
CAGGACAGATCTCCAACCG
60
CTCAGCATCAATACACATTCCA
59
AAACACGTCACTGATCTCC
58
TACTGGAGACTCACCACAC
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
SP1
RGN
Repression

RGN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RGN基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001822
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0004341
Q15493 (UniProtKB)
IDA
GO:0004341
Q15493 (UniProtKB)
IDA
GO:0005509
Q15493 (UniProtKB)
ISS
GO:0005509
Q15493 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q15493 (UniProtKB)
ISS
GO:0005634
Q15493 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q15493 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q15493 (UniProtKB)
ISS
GO:0005829
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0006469
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0006874
Q15493 (UniProtKB)
ISS
GO:0007283
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0007568
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q15493 (UniProtKB)
IDA
GO:0010867
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0010907
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0010922
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0019853
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0030234
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0032515
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0032781
Q15493 (UniProtKB)
ISS
GO:0034260
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0045019
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0045723
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0050680
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0050848
Q15493 (UniProtKB)
ISS
GO:0051344
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:0097421
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1901318
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1901671
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1901896
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1902679
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1903011
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1903052
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1903611
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1903625
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1903629
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:1903634
Q15493 (UniProtKB)
IEA
GO:2000279
Q15493 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RGN基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Kidney Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Liver Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Liver Cirrhosis, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Liver carcinoma 0.082171535 9 0 BeFree_RGD
Hyperlipidemia 0.08 1 0 RGD
Diabetes Mellitus, Experimental 0.08 1 0 RGD
Liver Failure, Acute 0.00272435 1 0 LHGDN
Liver neoplasms 0.001357209 5 0 BeFree
Carcinogenesis 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree

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