RGMB (repulsive guidance molecule BMP co-receptor b)

symbol:
RGMB
locus group:
protein-coding gene
location:
5q15
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FLJ90406|DRAGON
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None
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285704
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HGNC:26896
approved reserved:
2004-02-04
5q15
基因染色体位置图

RGMB(Repulsive Guidance Molecule B)是排斥性导向分子家族(RGM家族)的一员,该家族还包括RGMA和RGMC(又称HFE2)。RGM家族成员在神经发育、铁代谢和细胞迁移等过程中发挥重要作用,其共性在于它们都是糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定的膜蛋白,通过结合骨形态发生蛋白(BMP)受体调控BMP信号通路,从而影响细胞分化、增殖和凋亡。RGMB主要在神经系统、血管内皮细胞和某些上皮组织中表达,其核心功能包括参与轴突导向、血管生成和突触可塑性。在神经发育中,RGMB通过排斥性信号引导神经纤维的正确路径,避免错误连接;在血管系统中,它通过调节内皮细胞迁移影响血管形成。RGMB的突变或表达异常与多种疾病相关,例如其功能丧失可能导致神经发育障碍或血管畸形,而过表达则与肿瘤进展(如乳腺癌、肺癌)相关,可能通过增强BMP信号促进癌细胞侵袭和转移。降低RGMB表达可能抑制肿瘤生长,但同时也可能干扰正常的神经或血管修复功能。此外,RGMB与铁调素(hepcidin)调控通路存在交叉,暗示其潜在参与铁代谢紊乱疾病(如血色素沉着症)。在基因家族层面,RGM成员均通过Neogenin受体传递信号,但RGMB因组织分布和结合配体的差异表现出独特功能。研究还发现,RGMB与免疫微环境相关,其过表达可能抑制T细胞活性,帮助肿瘤免疫逃逸。这些特性使RGMB成为神经退行性疾病、癌症和血管疾病的潜在治疗靶点。

RGMB is a glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored member of the repulsive guidance molecule family (see RGMA, MIM 607362) and contributes to the patterning of the developing nervous system (Samad et al., 2005 [PubMed 15671031]).[supplied by OMIM, Apr 2009]

RGMB是排斥导向分子家族的一个糖基(GPI)锚定构件(见RGMA,MIM 607362),并有利于神经系统发育的图案化(沙末等,2005 [搜索PubMed 15671031])。 [由OMIM,2009年4月供应]

RGMB基因的碱基序列:[NCBI]
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RGMB基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1508792       rs1508793       rs1818348       rs1828168       rs1828169       rs1828170       rs1979980       rs2249797       rs2271218       rs2271219       rs2277929       rs2302981       rs2545675       rs2545730       rs2545731       rs2545732       rs2547971      

RGMB基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GACAAACGTACCTGTGGTC
58
GGGAGCCATGACATAACCT
59
ACCCTTAAGGATCATTTACGGA
59
CCTCTTCTTCATCATTCTTAACCC
59
TTCTGGAGTCGGAGAACTG
59
ATCTCAGGAAACCAGTGCA
59
TAAGGAAGAAGAGGAAGCGA
58
TTTCTGGATTCGACATTGGG
58
CCTGGATCCAGTGCTACTG
60
GATCTGTACACTCATGGTGG
58
ATTCTGGAGTCGGAGAACTG
59
CATCATTCTTAACCCTTTCGCT
59
CCTGGATCCAGTGCTACTG
60
GATCTGTACACTCATGGTGG
58
AAGCTTTGGGACTCTTCTC
57
CTTCGCTTCCTCTTCTTCC
58
ATTCTGGAGTCGGAGAACTG
59
TTAACCCTTTCGCTCCTGG
60
CCTGGATCCAGTGCTACTG
60
CACATATTTCACCGTCAGGG
59
      尚未收录相关数据

RGMB基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RGMB基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005793
J3KNF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
J3KNF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030509
J3KNF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
J3KNF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0045893
J3KNF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0046658
J3KNF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005793
Q6NW40 (UniProtKB)
ISS
GO:0005886
Q6NW40 (UniProtKB)
IBA
GO:0007155
Q6NW40 (UniProtKB)
ISS
GO:0007165
Q6NW40 (UniProtKB)
ISS
GO:0015026
Q6NW40 (UniProtKB)
IBA
GO:0030509
Q6NW40 (UniProtKB)
ISS
GO:0030509
Q6NW40 (UniProtKB)
IBA
GO:0042802
Q6NW40 (UniProtKB)
ISS
GO:0045121
Q6NW40 (UniProtKB)
IEA
GO:0045893
Q6NW40 (UniProtKB)
ISS
GO:0046658
Q6NW40 (UniProtKB)
ISS

可能调控 RGMB基因的相关microRNA:     

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Rheumatoid Arthritis 0.12 1 0 CTD_human
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree

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