RCN1 (reticulocalbin 1)

symbol:
RCN1
locus group:
protein-coding gene
location:
11p13
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
Rcal|PIG20|FLJ37041
alias name:
proliferation-inducing gene 20
entrez id:
5954
ensembl gene id:
ENSG00000049449
ucsc gene id:
uc010reb.3
refseq accession:
NM_002901
hgnc_id:
HGNC:9934
approved reserved:
1997-07-25
11p13
基因染色体位置图

RCN1(也称为Reticulocalbin 1)是一种钙结合蛋白,属于CREC(Cab45/reticulocalbin/ERC-45/calumenin)基因家族成员。该家族蛋白的共同特点是含有多个EF-hand结构域,能够结合钙离子,并主要定位在内质网和高尔基体等分泌途径的细胞器中,参与钙离子稳态调控和蛋白质分泌过程。RCN1在多种组织中表达,尤其在分泌活跃的细胞(如胰腺β细胞、神经细胞)中表达较高。其生物学功能包括调节细胞内钙信号传导、参与蛋白质折叠与质量控制,并通过钙依赖性方式影响酶活性(如蛋白二硫键异构酶)。RCN1的突变或表达异常可能与疾病相关,例如某些研究发现其表达水平变化与阿尔茨海默病、糖尿病和癌症等疾病存在关联。在阿尔茨海默病中,RCN1可能通过影响β-淀粉样蛋白(Aβ)的生成或清除发挥作用;在胰腺β细胞中,RCN1表达降低可能导致胰岛素分泌异常。过表达RCN1可能干扰钙离子动态平衡,引发内质网应激反应,进而影响细胞存活;而表达降低则可能导致分泌蛋白的折叠缺陷或运输障碍。此外,RCN1与家族其他成员(如calumenin、ERC-55)功能部分冗余,但各自具有组织特异性表达模式。研究还显示,RCN1可能通过调控VEGF等因子影响肿瘤血管生成,其在高尔基体中的定位暗示其对细胞外基质蛋白修饰的潜在作用。需要注意的是,RCN1的具体机制仍在深入研究中,现有数据多来自细胞或动物模型。

Reticulocalbin 1 is a calcium-binding protein located in the lumen of the ER. The protein contains six conserved regions with similarity to a high affinity Ca(+2)-binding motif, the EF-hand. High conservation of amino acid residues outside of these motifs, in comparison to mouse reticulocalbin, is consistent with a possible biochemical function besides that of calcium binding. In human endothelial and prostate cancer cell lines this protein localizes to the plasma membrane.[provided by RefSeq, Jan 2009]

Reticulocalbin 1是位于ER的腔的钙结合蛋白。该蛋白包含具有相似6保守的区域,以高亲和性钙(2)结合基序,所述EF手。这些图案以外的氨基酸残基高度保守,在比较小鼠reticulocalbin,是除了该钙结合的一个可能的生化功能相一致。在人内皮细胞和前列腺癌细胞系该蛋白质定位于质膜。[通过的RefSeq,2009年1月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RCN1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4876       rs6711       rs8219       rs170327       rs190104       rs223042       rs223043       rs223044       rs223045       rs223046       rs223047       rs223048       rs223056       rs223057       rs223058       rs223059       rs223060      

RCN1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGACTAATGGTGCAGCTC
60
GAATTTGCAAATCGCGATAGC
59
TCAGGATGAGTATATTGCGGA
59
GTTAAACTGCTCCCGTTCTG
59
GAGCTCTATGGATCCATCTG
57
TAAGATCCAGGTGTCAGGC
59
GATCAGGATGAGTATATTGACAAGG
59
GTGGTGGAGTAGAAAGAACTG
58
GATCAGGATGAGTATATTGACAAGG
59
GTGGTGGAGTAGAAAGAACTG
58
TCAGTTCTTTCTACTCCACCAC
60
AACATATCCGCTCCTGAGC
60
GAGGAGAAGGTCCACTTCC
59
GATCAACAATCTTCCTGGGC
59
TATGGTTACTACCTAGGAAACCC
59
TCTGCAGCTTTGAATCTTCTC
59
CTTCCAGTACGACCACGAG
60
ATCAACAATCTTCCCTAGCCT
59
AATTTACAGCAGTTGTGATCCC
59
CTCATTCTAATCAGTGATCACAAGG
60
      尚未收录相关数据

RCN1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RCN1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
E9PP27 (UniProtKB)
IEA
GO:0001701
Q15293 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q15293 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q15293 (UniProtKB)
IPI
GO:0005783
Q15293 (UniProtKB)
IDA
GO:0005788
Q15293 (UniProtKB)
IEA
GO:0043010
Q15293 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RCN1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Animal Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Tuberculosis 0.002367032 1 1 GAD
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Renal carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of kidney 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Uterine Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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