RBM5 (RNA binding motif protein 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RBM5
locus group:
protein-coding gene
location:
3p21.31
gene_family:
Zinc fingers, RAN binding-type|G patch domain containing|RNA binding motif containing
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LUCA15|LUCA-15|H37
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None
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10181
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ucsc gene id:
uc003cyg.4
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NM_005778
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HGNC:9902
approved reserved:
1998-09-30

基因染色体位置

基因染色体位置

3p21.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

RBM5（RNA Binding Motif Protein 5）是一种RNA结合蛋白，属于RBM基因家族，该家族成员均含有RNA识别基序（RRM），参与RNA的剪接、稳定性和翻译调控。RBM5在细胞凋亡、细胞周期调控和肿瘤抑制中发挥重要作用，尤其在肺癌、乳腺癌和白血病等癌症中表现出显著的调控功能。RBM5通过调控前体mRNA的剪接影响多种基因的表达，例如调控FAS和BCL2等凋亡相关基因的可变剪接，从而影响细胞凋亡途径。RBM5的突变或表达异常可能导致剪接失调，进而促进肿瘤发生或发展。例如，RBM5在肺癌中常因缺失或突变而功能丧失，导致凋亡抑制和细胞增殖失控。过表达RBM5可诱导细胞凋亡并抑制肿瘤生长，而降低表达则可能削弱其肿瘤抑制功能，促进癌细胞的存活和增殖。此外，RBM5还参与DNA损伤修复和免疫调控，其表达水平变化可能影响其他基因（如TP53和MYC）的功能或信号通路。RBM基因家族的共性在于它们均含有保守的RRM结构域，能够结合RNA并参与转录后调控，但各成员在具体功能和调控机制上存在差异。RBM5与家族成员RBM6和RBM10在结构和功能上具有相似性，均与剪接调控和癌症相关，但RBM5在凋亡调控中的作用更为突出。研究RBM5有助于理解癌症发生的分子机制，并为靶向治疗提供潜在策略。

This gene is a candidate tumor suppressor gene which encodes a nuclear RNA binding protein that is a component of the spliceosome A complex. The encoded protein plays a role in the induction of cell cycle arrest and apoptosis through pre-mRNA splicing of multiple target genes including the tumor suppressor protein p53. This gene is located within the tumor suppressor region 3p21.3, and may play a role in the inhibition of tumor transformation and progression of several malignancies including lung cancer. [provided by RefSeq, Oct 2011]

该基因是一个候选肿瘤抑制基因，其编码一个核RNA结合蛋白，它是剪接的复合物的一个组成部分。所编码的蛋白质在细胞周期停滞的诱导作用及细胞凋亡通过的多个靶基因，包括肿瘤抑制蛋白p53前mRNA剪接。该基因位于肿瘤抑制区域3p21.3区内，并且可以在肿瘤转化和几个恶性肿瘤包括肺癌进展的抑制的作用。 [由RefSeq的，2011年10月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RBM5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2856234       rs5848906       rs10599830       rs41464448       rs73835203       rs74550293       rs75599056       rs75700356       rs111484530       rs112093695       rs115871263       rs116458104       rs139013029       rs139289182       rs139449477       rs140847565       rs140927160      

基因表达

基因表达

RBM5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCCACCCAGTCTCAAAGTG
59
GAGCATATTGGGCATAGCC
58
CTCTGAACAGGAAGTGCCT
59
TTCCGAAGAATGATCGTATCAC
58
TCAGATGGTGACTATGATTCGA
58
TTCCTCTTCATCAGCCTCAC
59
GCCCAATATGCTCAGTATTCAC
59
GCAGATGATGCATCAGATTCC
59
TCTGTAGGCTGGGATTACG
58
AGGTGTGACACTGCTAGAG
58
AAAGAGACCTACGTGCCAG
59
ATGTCTTTGGCAATCTGCTG
59
CATCAGTGACGAGAGGGAG
59
CCATCATTTCTCGAATATCGCT
58
AGAAGAAGGGAGCCTTAGC
58
CACTGTAAGCAGCAACCAG
59
CTCTCAGACCTTCACAAGC
57
CGGTCTCGGTATTTCATCTC
58
ATGTTGGAGATGAAATACCGAG
58
CATCAAACTGCTTCTTGCG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RBM5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RBM5基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000166
C9J9P7 (UniProtKB)
IEA
GO:0000381
C9J9P7 (UniProtKB)
IEA
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C9J9P7 (UniProtKB)
IDA
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C9J9P7 (UniProtKB)
IEA
GO:0008380
C9J9P7 (UniProtKB)
IEA
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C9J9P7 (UniProtKB)
IEA
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C9JFQ5 (UniProtKB)
IEA
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C9JFQ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
C9JFQ5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005681
C9JFQ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008380
C9JFQ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0042981
C9JFQ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0000381
C9JR02 (UniProtKB)
IEA
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C9JR02 (UniProtKB)
IEA
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C9JR02 (UniProtKB)
IEA
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C9JR02 (UniProtKB)
IEA
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F8W910 (UniProtKB)
IEA
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F8W910 (UniProtKB)
IEA
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F8W910 (UniProtKB)
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F8WE23 (UniProtKB)
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F8WE23 (UniProtKB)
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P52756 (UniProtKB)
IEA
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P52756 (UniProtKB)
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P52756 (UniProtKB)
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P52756 (UniProtKB)
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P52756 (UniProtKB)
TAS
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P52756 (UniProtKB)
TAS
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P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0003729
P52756 (UniProtKB)
IDA
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P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
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P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
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P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P52756 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P52756 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0005681
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0006396
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
P52756 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
P52756 (UniProtKB)
IEA
GO:0008285
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0043065
P52756 (UniProtKB)
IDA
GO:0043065
P52756 (UniProtKB)
TAS
GO:0044822
P52756 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RBM5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lung Neoplasms 0.005991584 4 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of lung 0.002171535 8 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.001900093 7 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000814326 3 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000542884 2 0 BeFree
Adenocarcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Small cell carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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