RBM23 (RNA binding motif protein 23)

symbol:
RBM23
locus group:
protein-coding gene
location:
14q11.2
gene_family:
RNA binding motif containing
alias symbol:
FLJ10482|CAPERbeta
alias name:
coactivator of activating protein-…
entrez id:
55147
ensembl gene id:
ENSG00000100461
ucsc gene id:
uc001whg.4
refseq accession:
NM_001077351
hgnc_id:
HGNC:20155
approved reserved:
2002-12-18
14q11.2
基因染色体位置图

RBM23(RNA Binding Motif Protein 23)是一种RNA结合蛋白,属于RBM基因家族,该家族成员通常含有RNA识别基序(RRM),参与RNA的加工、剪接、转运和稳定性调控。RBM23在多种组织中表达,尤其在睾丸中表达较高,表明它可能在生殖系统中发挥重要作用。其编码的蛋白通过与特定RNA分子结合,参与转录后调控,影响基因表达网络。RBM23的突变可能导致RNA代谢异常,进而影响细胞功能,但目前关于其突变的具体病理效应研究较少。有研究表明,RBM23可能与某些癌症(如前列腺癌和肝癌)的发生发展相关,但其确切机制尚不明确。若RBM23过表达,可能干扰正常的RNA加工过程,导致基因表达紊乱,甚至促进肿瘤发生;而降低表达则可能影响RNA代谢相关通路,导致细胞功能异常。RBM基因家族的共性在于它们均含有RRM结构域,能够识别并结合RNA,参与转录后调控,对维持细胞稳态至关重要。RBM23作为该家族成员之一,其功能可能与其他RBM蛋白存在协同或互补作用,但目前关于其具体相互作用的研究仍需进一步探索。

This gene encodes a member of the U2AF-like family of RNA binding proteins. This protein interacts with some steroid nuclear receptors, localizes to the promoter of a steroid- responsive gene, and increases transcription of steroid-responsive transcriptional reporters in a hormone-dependent manner. It is also implicated in the steroid receptor-dependent regulation of alternative splicing. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的U2AF样家族RNA结合蛋白中的一员。这种蛋白质与某些类固醇核受体相互作用,定位于一类固醇响应基因的启动子,并增加了类固醇应答转录记者转录的激素依赖性。它也牵涉在选择性剪接的类固醇受体依赖性调节。已发现该基因编码不同亚型的多个抄本变形。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

RBM23基因的碱基序列:[NCBI]
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RBM23基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1951119       rs2295683       rs2295684       rs3794452       rs3794453       rs3829408       rs4981449       rs4981450       rs7145630       rs7153449       rs8023107       rs10139179       rs10144905       rs10145221       rs10585401       rs10632974       rs11557895      

RBM23基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGCATCTGATGACTTTGAC
58
TTTCCTTTGTTGCTCATCCTC
58
CATCTTTGAGCCCTTTGGT
58
ATCAGAGAACGTGATGAAACC
59
CTAGCAATACCACCAGCAG
58
TCGACTACGATTGCTTGTC
58
CAATGAGACCAGTGGAAGC
59
CCGATCTCGACTACGACTG
60
CTAGCAATACCACCAGCAG
58
TCGACTACGATTGCTTGTC
58
CAATGAGACCAGTGGAAGC
59
CCGATCTCGACTACGACTG
60
CATCTTTGAGCCCTTTGGT
58
ATCAGAGAACGTGATGAAACC
59
GATGGCATCTGATGACTTTGAC
60
CCGATCTCGACTACGACTC
59
GATGGCATCTGATGACTTTGAC
60
CCGATCTCGACTACGACTC
59
CTAGCAATACCACCAGCAG
58
TCGACTACGATTGCTTGTC
58
      尚未收录相关数据

RBM23基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RBM23基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000166
G3V2B4 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
G3V2B4 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
G3V546 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
G3V546 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
G3V5Z6 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
G3V5Z6 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
G3XAP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
G3XAP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
G3XAP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006397
G3XAP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
H0YJJ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
H0YJJ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
Q86U06 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
Q86U06 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q86U06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86U06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86U06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86U06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86U06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86U06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
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IPI
GO:0005515
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GO:0005515
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IPI
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GO:0005515
Q86U06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q86U06 (UniProtKB)
IEA
GO:0006397
Q86U06 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q86U06 (UniProtKB)
IDA

可能调控 RBM23基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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