RBM14-RBM4 (RBM14-RBM4 readthrough)

symbol:
RBM14-RBM4
locus group:
other
location:
11q13.2
gene_family:
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None
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None
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100526737
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ENSG00000248643
ucsc gene id:
uc009yrk.4
refseq accession:
NM_001198845.1
hgnc_id:
HGNC:38840
approved reserved:
2011-02-21
11q13.2
基因染色体位置图

RBM14(RNA结合基序蛋白14)和RBM4(RNA结合基序蛋白4)属于RNA结合蛋白(RBP)家族,该家族成员通常含有RNA识别基序(RRM)并参与RNA代谢调控。RBM14是一种多功能核蛋白,参与转录调控、RNA剪接和DNA损伤修复,其表达产物能与多种RNA和蛋白质相互作用,影响基因表达网络。RBM14在胚胎发育、细胞增殖和分化中起重要作用,其突变可能导致剪接异常或转录失调,与癌症(如乳腺癌和肺癌)及神经退行性疾病相关。过表达RBM14可能促进肿瘤生长和转移,而敲低则可能抑制细胞增殖并诱导凋亡。RBM4是另一种重要的RNA结合蛋白,主要调控选择性剪接和翻译,影响肌肉发育、神经功能和糖代谢。RBM4通过结合特定mRNA序列调控其稳定性及翻译效率,其突变与肌萎缩侧索硬化症(ALS)和糖尿病有关。RBM4过表达可增强肌肉分化并改善胰岛素敏感性,而表达降低可能导致代谢紊乱和神经退行性变。RBM14和RBM4属于同一基因家族,具有保守的RRM结构域,但功能上存在差异和互补性。两者均可调控RNA加工过程,但RBM14更偏向转录和DNA修复,而RBM4侧重剪接和翻译调控。它们的表达失衡可能破坏RNA代谢稳态,进而影响多种生理和病理过程。研究这些基因有助于理解RNA调控网络的复杂性及其在疾病中的作用。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring RBM14 (RNA binding motif protein 14) and RBM4 (RNA binding motif protein 4) genes. Alternative splicing results in multiple transcript variants, one of which encodes a fusion protein that shares sequence identity with each individual gene product. This fusion protein contains RRM and zinc finger domains, and it functions to stimulate transcription in a hormone and receptor-dependent manner. [provided by RefSeq, Nov 2010]

这一位点代表自然发生和RBM4邻近RBM14之间通读转录(RNA结合基序蛋白14)(RNA结合基序蛋白4)基因。选择性剪接的结果在多个转录变异体,其中一个编码共享序列同一性与每个单独的基因产物的融合蛋白。该融合蛋白含有RRM和锌指结构域,其功能是刺激转录的激素和受体依赖的方式。 [由RefSeq的,2010年11月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RBM14-RBM4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2502       rs15969       rs470300       rs477335       rs477557       rs484262       rs484514       rs485484       rs495264       rs497858       rs500983       rs510356       rs517913       rs519380       rs527550       rs535211       rs544210      

RBM14-RBM4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGGTGAAAGGCTCTTGTC
59
AGAGTGAGCGAATCTCCTG
59
CCAAGGCCTCTTAATACTTGG
59
CGCCAATTACCTTTCACCA
59
CAAGGCCTCTTAATACTTGGA
58
TGTATTCTCATGCACAACCG
59
CAAGGCCTCTTAATACTTGGA
58
CATTCGTTTGCCTTTCACC
58
CCAAGGCCTCTTAATACTTGG
59
TATTCTCATGCACAACCGC
59
GGTGAAAGGCTCTTGTCAG
59
AAGAGTGAGCGAATCTCCT
58
CCAAGGCCTCTTAATACTTGG
59
TTCGTTTGCCTTTCACCAC
59
CAAGGCCTCTTAATACTTGGA
58
ACGCCAATTACCTTTCACC
59
CAAGGCCTCTTAATACTTGGA
58
CGCCAATTACCTTTCACCA
59
GGTGAAAGGCTCTTGTCAG
59
AGAGTGAGCGAATCTCCTG
59
      尚未收录相关数据

RBM14-RBM4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RBM14-RBM4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000166
A0A0A0MSL8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
A0A0A0MSL8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
A0A0A6YYI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
A0A0A6YYI9 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RBM14-RBM4基因的相关microRNA:     

BioGrid

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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