RBAK-RBAKDN (RBAK-RBAKDN readthrough)

symbol:
RBAK-RBAKDN
locus group:
other
location:
7p22.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100533952
ensembl gene id:
ENSG00000272968
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NM_001204513
hgnc_id:
HGNC:42971
approved reserved:
2013-05-20
7p22.1
基因染色体位置图

RBAK-RBAKDN是一个基因对,属于视网膜母细胞瘤(RB)通路相关基因家族。RBAK(Retinoblastoma-Associated KRAB-Zinc Finger Protein)编码一个KRAB结构域的锌指蛋白,通常与视网膜母细胞瘤蛋白(pRB)相互作用,参与细胞周期调控和转录抑制。RBAKDN是RBAK的一个剪接变体,可能具有不同的功能或调控特性。RBAK通过其KRAB结构域招募转录抑制复合物,影响基因表达,尤其在细胞增殖和分化中起重要作用。RBAK的突变或表达异常可能导致细胞周期失控,与某些癌症(如视网膜母细胞瘤、肺癌和乳腺癌)的发生相关。RBAK过表达可能增强对细胞周期的抑制,导致细胞增殖受阻,而降低表达可能解除对细胞周期的限制,促进肿瘤发生。RBAK-RBAKDN基因对的功能可能与pRB通路协同,调控E2F转录因子家族的活性,从而影响细胞周期进程。这个基因家族的共性包括参与细胞周期调控、转录抑制和肿瘤抑制功能。KRAB-Zinc Finger蛋白家族通常通过锌指结构域结合DNA,KRAB结构域介导转录抑制,广泛参与发育和疾病过程。RBAK-RBAKDN的异常表达还可能影响其他细胞周期相关基因(如CDKN1A、CCND1)的表达,进一步扰乱细胞稳态。研究显示,RBAK在某些癌症中表达下调,提示其可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。此外,RBAK可能参与DNA损伤应答和凋亡调控,但其具体机制仍需进一步研究。了解RBAK-RBAKDN的功能有助于揭示RB通路在癌症中的作用,并为相关治疗提供潜在靶点。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring RBAK (RB-associated KRAB zinc finger) and LOC389458 (hypothetical LOC389458) genes on chromosome 7. The read-through transcript encodes a protein that shares sequence identity with the upstream gene product but its C-terminal region is distinct due to frameshifts relative to the downstream gene. [provided by RefSeq, Mar 2011]

这一位点代表自然发生的周边RBAK(RB相关的KRAB锌指)和LOC389458(假设LOC389458)基因之间通读转录染色体7.通读转录物编码共享序列相同的蛋白质上游的基因产物,但它的C-末端区域是不同的,由于相对于下游基因移码。 [由RefSeq的,2011年3月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
RBAK-RBAKDN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6862       rs1127434       rs1130329       rs3801055       rs4403324       rs4475394       rs4523153       rs4548076       rs4585633       rs4590348       rs4640971       rs4720472       rs6463238       rs6463239       rs6942449       rs6946191       rs6955853      

RBAK-RBAKDN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCTGTGGGATATGATACCACC
60
TCACCTCCCATTATCCACG
59
CTGATGAGAAGATAACTTACAGGGA
60
GCTTGGTGGTATCATATCCCA
60
CCTGATGAGAAGATAACTTACAGG
59
CTTGGTGGTATCATATCCCAC
58
      尚未收录相关数据

RBAK-RBAKDN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RBAK-RBAKDN基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
A0A0A6YYG8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
A0A0A6YYG8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A0A6YYG8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
I3L0D1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
I3L0D1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
I3L0D1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RBAK-RBAKDN基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。