RARRES1 (retinoic acid receptor responder 1)

symbol:
RARRES1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q25.32
gene_family:
alias symbol:
TIG1|LXNL
alias name:
latexin-like
entrez id:
5918
ensembl gene id:
ENSG00000118849
ucsc gene id:
uc003fci.4
refseq accession:
NM_002888
hgnc_id:
HGNC:9867
approved reserved:
1998-02-03
3q25.32
基因染色体位置图

RARRES1(Retinoic Acid Receptor Responder 1)是一个由视黄酸(维生素A衍生物)诱导表达的基因,属于TIG(Tazarotene Induced Gene)基因家族。该家族成员通常参与细胞分化、增殖和凋亡调控,并在炎症反应、代谢调节和肿瘤发生中发挥作用。RARRES1编码一种分泌型蛋白,具有脂联素类似结构域,可能参与脂肪代谢和能量平衡调节。其主要作用位点包括脂肪组织、肝脏和免疫细胞,通过与细胞表面受体(如AdipoR1/2)相互作用调控下游信号通路(如AMPK、PPARγ)。RARRES1在多种癌症中表现异常,例如在前列腺癌、乳腺癌中常发生启动子甲基化导致的表达沉默,而在黑色素瘤中可能过表达。突变或表观遗传修饰导致的RARRES1功能丧失可能促进肿瘤细胞增殖、迁移和血管生成。过表达RARRES1可抑制肿瘤生长、诱导细胞凋亡并增强化疗敏感性,这可能通过抑制Wnt/β-catenin等促癌通路实现。相反,降低表达可能加剧代谢紊乱(如胰岛素抵抗)和慢性炎症。该基因还参与免疫调节,其表达水平变化可能影响巨噬细胞极化和T细胞功能。TIG家族共性包括:受视黄酸类物质调控、多含有分泌信号肽、参与上皮细胞分化和屏障功能维持。最新研究发现RARRES1可能作为脂肪因子参与肥胖相关疾病,并与非酒精性脂肪肝的进展相关。其双重角色(抑癌基因与代谢调节因子)使其成为癌症和代谢疾病的潜在治疗靶点。

This gene was identified as a retinoid acid (RA) receptor-responsive gene. It encodes a type 1 membrane protein. The expression of this gene is upregulated by tazarotene as well as by retinoic acid receptors. The expression of this gene is found to be downregulated in prostate cancer, which is caused by the methylation of its promoter and CpG island. Alternatively spliced transcript variant encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因被鉴定为维甲酸(RA)的受体应答基因。它编码1型膜蛋白。该基因的表达由他扎罗汀以及由视黄酸受体上调。该基因的表达被发现在前列腺癌,它是由它的启动子和CpG岛的甲基化而引起被下调。可变剪接转录变体编码不同同种型已被观察到。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RARRES1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6441222       rs6441223       rs6441224       rs6786423       rs7609656       rs7618110       rs7621322       rs11721000       rs57473606       rs59217052       rs59313096       rs73015649       rs73015651       rs73015652       rs73015654       rs73015655       rs73015657      

RARRES1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTCACTTCTTCAACTTCCGG
59
TTTGGATTAATCCACGCGC
59
CCTAAACCAGAAGATAATCATGGAC
60
CACGTAAGAGCTTCCAAGGA
60
ACCCAGAGTCTTTACTTCAGG
59
ATTGATGGTTGGTCTGGGT
59
CAGCATACCTGATAATCATGGAC
59
ACGTAAGAGCTTCCAAGGA
58
ACAACCCAGAGATAATCATGG
58
ACGTAAGAGCTTCCAAGGA
58
CAACACAGGAAATAATTCCCTG
58
TGTAGCTCTTGACAGTGGT
58
TGTGGGAAATGACAACACAG
59
TGATGGAGACCAAAGTCCA
58
CAGCATACCTGATAATCATGGA
57
ACGTAAGAGCTTCCAAGGA
58
GACCTAAACCAGAAGATAATCATGG
60
GTAAGAGCTTCCAAGGAAAGC
59
AACCCAGAGTCTTTACTTCAGG
60
TGGTTGGTCTGGGTTTCTG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CTCF
RARRES1
Activation

RARRES1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RARRES1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008285
P49788 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
P49788 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P49788 (UniProtKB)
IDA

可能调控 RARRES1基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Squamous cell carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of prostate 0.001900093 7 1 BeFree
Prostate carcinoma 0.001900093 7 1 BeFree
Benign Prostatic Hyperplasia 0.000814326 3 0 BeFree
Nasopharyngeal carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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