RAPGEF1 (Rap guanine nucleotide exchange factor 1)

symbol:
RAPGEF1
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.13
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C3G
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None
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2889
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uc064wrm.1
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NM_005312
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HGNC:4568
approved reserved:
1994-12-13
9q34.13
基因染色体位置图

RAPGEF1(也称为C3G或GRF2)是Rap鸟苷酸交换因子(GEF)家族的成员,属于GEF家族中的一员,其主要功能是激活小GTP酶Rap1和Rap2。RAPGEF1通过促进GDP与GTP的交换,使Rap1/2从非活性状态转变为活性状态,从而调控细胞黏附、迁移、增殖和分化等多种生物学过程。RAPGEF1在多种组织中广泛表达,尤其在神经系统和免疫系统中发挥重要作用。该基因的产物包含多个功能域,如CRK结合域(CBD)和催化性的GEF域,这些结构使其能够与CRK适配蛋白相互作用并激活下游信号通路。RAPGEF1的突变或异常表达可能导致功能失调,例如某些突变会削弱其GEF活性,进而影响Rap1/2的激活,导致细胞迁移和黏附异常。研究发现,RAPGEF1的异常表达与多种疾病相关,包括癌症、神经退行性疾病和心血管疾病。在癌症中,RAPGEF1的过表达可能通过激活Rap1促进肿瘤细胞的侵袭和转移,而降低表达则可能抑制这些过程。此外,RAPGEF1在神经系统中参与突触可塑性和神经元存活,其表达异常可能与阿尔茨海默病等神经退行性疾病有关。RAPGEF1属于RapGEF家族,该家族成员均具有激活Rap GTP酶的能力,并在细胞信号转导中发挥核心作用。家族成员通常通过不同的上游信号(如生长因子或细胞外基质)被激活,进而调控细胞行为。RAPGEF1的过表达可能增强Rap1/2的活性,促进细胞迁移和侵袭,而降低表达则可能抑制这些效应,并影响其他依赖Rap1/2的信号通路,如整合素介导的细胞黏附或MAPK通路。因此,RAPGEF1在多种生理和病理过程中扮演关键角色,其表达水平和活性的精细调控对维持细胞稳态至关重要。

This gene encodes a human guanine nucleotide exchange factor. It transduces signals from CRK by binding the SH3 domain of CRK, and activating several members of the Ras family of GTPases. This signaling cascade that may be involved in apoptosis, integrin-mediated signal transduction, and cell transformation. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码人鸟嘌呤核苷酸交换因子。它通过结合CRK的SH3结构域,并激活Ras家族GTP酶的几名成员从转导的信号CRK。这个信号级联可能参与细胞凋亡,整合素介导的信号转导和细胞转化。这个基因的几种可变剪接转录物变体已有描述,但一些变体的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RAPGEF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1772       rs2076       rs6879       rs729959       rs733530       rs733531       rs734638       rs734639       rs744236       rs744313       rs746754       rs746755       rs746756       rs752089       rs752090       rs753157       rs753159      

RAPGEF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTGACAGGAAAGATTTGGTG
58
TCTTGATGAGCTCCTCTGG
58
GTGCCCTCGTATAAGTCTG
57
ATGTGGAGAGGAAGAGGAG
57
GAATTCAGCACAGCTCAGC
59
AGCATCACTTGGTCAGACC
59
GACTGACAGGAAAGATTTGGTG
59
CTTGATGAGCTCCTCTGGG
59
GTGCCCTCGTATAAGTCTG
57
GAGAGGAAGAGGAGGTAGG
57
CGAATTCAGCACAGCTCAG
59
ATCACTTGGTCAGACCAGC
59
TGCCCTCGTATAAGTCTGTG
59
AGAGGAAGAGGAGGTAGGC
59
GAAGCTGCAGTACAGATATGAG
58
ACGAAGAACGTGTTCTTGC
59
GAATTCAGCACAGCTCAGC
59
ATCACTTGGTCAGACCAGC
59
      尚未收录相关数据

RAPGEF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RAPGEF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005085
H0Y6R4 (UniProtKB)
IEA
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H0Y6R4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007264
H0Y6R4 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
H0Y6R4 (UniProtKB)
IEA
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Q13905 (UniProtKB)
TAS
GO:0001568
Q13905 (UniProtKB)
IEA
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
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Q13905 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13905 (UniProtKB)
IPI
GO:0005768
Q13905 (UniProtKB)
TAS
GO:0005769
Q13905 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q13905 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q13905 (UniProtKB)
TAS
GO:0007165
Q13905 (UniProtKB)
NAS
GO:0007169
Q13905 (UniProtKB)
TAS
GO:0010976
Q13905 (UniProtKB)
IMP
GO:0016337
Q13905 (UniProtKB)
IEA
GO:0017034
Q13905 (UniProtKB)
IDA
GO:0017034
Q13905 (UniProtKB)
IMP
GO:0017124
Q13905 (UniProtKB)
IEA
GO:0032486
Q13905 (UniProtKB)
IMP
GO:0038180
Q13905 (UniProtKB)
IDA
GO:0043547
Q13905 (UniProtKB)
IDA
GO:0043547
Q13905 (UniProtKB)
IMP
GO:0046580
Q13905 (UniProtKB)
IEA
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Q13905 (UniProtKB)
IEA
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Q13905 (UniProtKB)
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Q13905 (UniProtKB)
IMP
GO:0070373
Q13905 (UniProtKB)
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GO:0090090
Q13905 (UniProtKB)
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GO:1901888
Q13905 (UniProtKB)
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GO:1990090
Q13905 (UniProtKB)
IDA
GO:2000178
Q13905 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RAPGEF1基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.005819831 5 6 BeFree_GAD
Squamous cell carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of gastrointestinal tract 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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