RAB12 (RAB12, member RAS oncogene family)

symbol:
RAB12
locus group:
protein-coding gene
location:
18p11.22
gene_family:
RAB, member RAS oncogene GTPases
alias symbol:
None
alias name:
None
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201475
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uc002knp.4
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HGNC:31332
approved reserved:
2005-02-09
18p11.22
基因染色体位置图

RAB12属于RAB基因家族,是RAS超家族中的一个小GTP酶蛋白家族成员。RAB家族主要参与调控细胞内囊泡运输、膜 trafficking 和信号转导等过程,其成员通常通过结合GTP(激活态)或GDP(失活态)来切换功能状态。RAB12在多种细胞类型中表达,尤其在神经细胞和分泌细胞中较为显著。它的主要功能是调控自噬过程,特别是参与自噬体与溶酶体的融合,以及某些特定蛋白质的降解途径。RAB12还参与调控细胞内的铁代谢,通过影响转铁蛋白受体的循环来调节铁的吸收和利用。在突变情况下,RAB12的功能异常可能导致自噬障碍,进而引发神经退行性疾病或代谢紊乱。例如,某些研究发现RAB12的突变与帕金森病等神经退行性疾病的发生有关,可能通过影响α-突触核蛋白的清除途径。此外,RAB12的过表达可能导致自噬过度激活,引发细胞凋亡或异常蛋白积累,而表达降低则可能抑制自噬,导致有害蛋白无法有效清除。RAB12还与其他RAB家族成员(如RAB7和RAB11)存在功能交叉,共同协调囊泡运输和细胞器间的物质交换。RAB基因家族的共性包括:均含有高度保守的GTPase结构域,通过GTP/GDP循环调控其活性;多数定位于特定细胞器膜上,参与膜运输的特异性步骤;并且通常需要效应蛋白(如GEFs和GAPs)辅助其功能切换。RAB12的异常表达或功能失调可能影响多种生理过程,包括神经保护、铁稳态和免疫反应,因此成为某些疾病的潜在治疗靶点。

None

RAB12基因的碱基序列:[NCBI]
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RAB12基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs321652       rs321653       rs321654       rs321655       rs888514       rs888515       rs4798661       rs7227048       rs7235110       rs7505175       rs9304017       rs9948960       rs9949275       rs9949488       rs9959962       rs9961850       rs11662866      

RAB12基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTCATCATTATCGGCTCC
58
TTTGAAGTCAACACCCACG
59
TTGATGATTTGCCGAAATGG
58
AGAAGCTCTGCATCTTCTG
57
TGATGATTTGCCGAAATGGA
58
GAGAAGCTCTGCATCTTCTG
59
GTCATCATTATCGGCTCCC
58
TTTGAAGTCAACACCCACG
59
TCATCATTATCGGCTCCCG
59
TTTGAAGTCAACACCCACG
59
TGATGATTTGCCGAAATGGA
58
AGAAGCTCTGCATCTTCTG
57
      尚未收录相关数据

RAB12基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RAB12基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0005525
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0005764
Q6IQ22 (UniProtKB)
ISS
GO:0005765
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0005776
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0006914
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0007264
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0008333
Q6IQ22 (UniProtKB)
ISS
GO:0015031
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0016239
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0019003
Q6IQ22 (UniProtKB)
IDA
GO:0031410
Q6IQ22 (UniProtKB)
IEA
GO:0044257
Q6IQ22 (UniProtKB)
ISS
GO:0055038
Q6IQ22 (UniProtKB)
ISS

可能调控 RAB12基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Myocardial Ischemia 0.12 1 0 CTD_human

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