PUM2 (pumilio RNA binding family member 2)

symbol:
PUM2
locus group:
protein-coding gene
location:
2p24.1
gene_family:
alias symbol:
PUMH2|KIAA0235
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None
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23369
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ENSG00000055917
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uc002rdu.3
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NM_015317
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HGNC:14958
approved reserved:
2001-03-27
2p24.1
基因染色体位置图

PUM2(Pumilio同源物2)属于PUM基因家族,该家族是一类高度保守的RNA结合蛋白家族,其成员通过识别特定的RNA序列(称为PUM结合元件,PBE)调控靶基因的翻译和稳定性。PUM2与家族成员PUM1共享类似结构,均含有8个重复的PUF结构域(Pumilio/FBF domain),可特异性结合RNA的3'非翻译区(3'UTR),从而抑制靶mRNA的翻译或促进其降解。PUM2在多种组织中表达,尤其在神经系统和生殖系统中发挥关键作用,参与神经元发育、突触可塑性及精子发生等过程。其靶基因包括与细胞周期、凋亡和分化相关的mRNA,如DAZ家族基因(Deleted in Azoospermia)。PUM2功能异常或突变可能导致神经系统疾病(如癫痫、智力障碍)和生殖障碍(如少精症)。过表达PUM2会增强对靶mRNA的抑制,可能引发细胞增殖受阻或神经发育异常;而表达降低则可能导致靶基因过度激活,与肿瘤发生(如胶质瘤)或生殖功能衰退相关。PUM家族共性在于通过PUF结构域实现RNA结合功能,并在进化中保留了对发育和稳态的调控作用。例如,PUM2与PUM1功能部分冗余,但敲除PUM2的小鼠表现出独特的睾丸萎缩和运动协调缺陷,说明其具有不可替代的生物学角色。目前研究还发现PUM2与病毒感染(如寨卡病毒)有关,因其可结合病毒RNA影响复制。专业术语解释:PUF结构域指能识别RNA特定序列的蛋白模块;3'UTR是mRNA终止密码子后的区域,含调控元件;冗余性指基因功能重叠,单个缺失可能不显表型。英文注释:PBE(Pumilio Binding Element),DAZ(Deleted in Azoospermia)。

This gene encodes a protein that belongs to a family of RNA-binding proteins. The encoded protein functions as a translational repressor during embryonic development and cell differentiation. This protein is also thought to be a positive regulator of cell proliferation in adipose-derived stem cells. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

这个基因编码属于家族RNA结合蛋白的蛋白质。所编码的蛋白质的功能作为胚胎发育和细胞分化过程中的平移阻遏。这种蛋白也被认为是细胞增殖的脂肪来源的干细胞的正调节。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2013年9月提供]

PUM2基因的碱基序列:[NCBI]
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PUM2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2820       rs6669       rs719148       rs741188       rs741189       rs741190       rs917903       rs917904       rs989982       rs1043400       rs1043419       rs1468741       rs1861077       rs2098294       rs2286982       rs2348703       rs3074570      

PUM2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTTGGCTTTGGAAGTGGT
60
GTCAGTCCTCCTGATGAACC
60
CTCCAGGACATTCACTTACG
58
TTGTCAGTCCTCCTAAATGC
58
CAGCCCTGTTTGATCTGTG
59
CTGGGACATTGAATGGTCTC
58
AATCAGGTACCAATGGACTC
57
ATTAGTCCTCTGAAAGAGCTG
57
GGTTAGAGACCGAGCTGTC
60
ACAGATCAAACTTGCAATCCG
60
TTTCTGTGTTGGTGCTTTCG
60
CTTACTGTTGGGATAAATCATACCC
60
GAGCTTCTCACCATTCAATGTC
60
TACCATGCTCACACCAAGG
60
TCTTGGCTTTGGAAGTGGT
60
GTCAGTCCTCCTGATGAACC
60
AATCAGGTACCAATGGACTC
57
ATTAGTCCTCTGAAAGAGCTG
57
GAGCTTCTCACCATTCAATGTC
60
TACCATGCTCACACCAAGG
60
      尚未收录相关数据

PUM2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PUM2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
A0A0A0MR59 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
A0A0C4DG68 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
C9JW01 (UniProtKB)
IDA
GO:0031965
C9JW01 (UniProtKB)
IDA
GO:0003723
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0003730
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q8TB72 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8TB72 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8TB72 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8TB72 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8TB72 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8TB72 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
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IDA
GO:0010494
Q8TB72 (UniProtKB)
ISS
GO:0010494
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IDA
GO:0010608
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0031965
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0034063
Q8TB72 (UniProtKB)
IEA
GO:0043488
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0048471
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0051983
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:0060964
Q8TB72 (UniProtKB)
TAS
GO:1900246
Q8TB72 (UniProtKB)
IDA
GO:2000637
Q8TB72 (UniProtKB)
IMP

可能调控 PUM2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Male infertility 0.00272435 1 0 LHGDN
Azoospermia 0.002367032 1 0 GAD

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