PTPRM (protein tyrosine phosphatase receptor type M)

symbol:
PTPRM
locus group:
protein-coding gene
location:
18p11.23
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing|Protein tyrosine phosphatases, receptor type
alias symbol:
RPTPU|hR-PTPu
alias name:
None
entrez id:
5797
ensembl gene id:
ENSG00000173482
ucsc gene id:
uc002knn.5
refseq accession:
NM_001105244
hgnc_id:
HGNC:9675
approved reserved:
1991-08-23
18p11.23
基因染色体位置图

PTPRM(Protein Tyrosine Phosphatase Receptor Type M)是一种受体型蛋白酪氨酸磷酸酶,属于PTP(Protein Tyrosine Phosphatase)基因家族。该家族的主要功能是通过去磷酸化调控细胞内的信号转导,与蛋白酪氨酸激酶(PTK)共同维持细胞内磷酸化平衡,影响细胞生长、分化、迁移和凋亡等过程。PTPRM作为一种跨膜蛋白,其胞外区含有多个免疫球蛋白样和纤维连接蛋白III型结构域,介导细胞间粘附;胞内区则具有磷酸酶活性,通过去磷酸化底物蛋白(如β-catenin、EGFR等)参与Wnt、MAPK等信号通路的调控。PTPRM在神经发育、免疫调节和组织稳态中发挥重要作用,尤其在突触可塑性和神经元连接中具有关键功能。突变或表达异常可能导致其磷酸酶活性丧失或底物特异性改变,与多种疾病相关。例如,PTPRM基因的异常表达与癌症(如乳腺癌、结肠癌)的进展和转移相关,其过表达可能通过增强细胞粘附抑制肿瘤侵袭,而低表达则可能促进转移。此外,PTPRM的突变还与神经系统疾病(如自闭症谱系障碍)和精神分裂症的风险增加有关,可能与突触功能紊乱有关。在PTPRM过表达情况下,可能抑制EGFR等促生长信号通路,导致细胞增殖受阻;而低表达时,则可能增强这些通路活性,促进肿瘤发生。PTP家族成员均含有保守的磷酸酶催化结构域,但不同亚型通过可变胞外区或非催化区实现功能特异性。研究PTPRM有助于开发靶向酪氨酸磷酸化的治疗策略,特别是在癌症和神经精神疾病领域。

The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and two tandem catalytic domains, and thus represents a receptor-type PTP. The extracellular region contains a meprin-A5 antigen-PTP mu (MAM) domain, an Ig-like domain and four fibronectin type III-like repeats. This PTP has been shown to mediate cell-cell aggregation through the interaction with another molecule of this PTP on an adjacent cell. This PTP can interact with scaffolding protein RACK1/GNB2L1, which may be necessary for the downstream signaling in response to cell-cell adhesion. Alternative splicing results in multiple transcripts encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的一个成员。的PTPs已知是信令调节多种细胞过程,包括细胞生长,分化,有丝分裂周期,和致癌性转化的分子。此PTP具有一个胞外区,一个跨膜区和两个串联的催化结构域,并因此代表了受体型PTP。胞外区含有meprin-A5抗原PTP亩(MAM)结构域,Ig样结构域和四个纤连蛋白III型样重复。此PTP已经示出通过与上相邻小区此PTP的另一分子的相互作用介导的细胞 - 细胞聚集。此PTP可以与支架蛋白RACK1 / GNB2L1,这可能是必需的下游信号响应于细胞 - 细胞粘附相互作用。选择性剪接结果编码不同亚型多重成绩单。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

PTPRM基因的碱基序列:[NCBI]
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PTPRM基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs965639       rs1251849       rs1318213       rs2169014       rs2242146       rs2242147       rs2242148       rs2242149       rs2290819       rs2305961       rs4797312       rs4797313       rs6506577       rs7227545       rs7342992       rs8084278       rs8087887      

PTPRM基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAATATCAGCACCCTCTATGC
58
TTTCAGCATGACTGTCACG
59
AATATCAGCACCCTCTATGCC
60
GTTTCAGCATGACTGTCACG
60
GTAGTTAAAGAACCACCCGT
58
GTTGAGCTGTATCCACAGG
58
AAGCCTTGAAGGACAGATCC
60
CAGCGGATAGTGATTTGCC
59
CAGATGAAGACCTCCCAGG
59
CTCTCCACTGAAGAAATATCTTCTC
59
GTGTCTTCACCATCGTCCT
59
GGGTTTCATCTGGGTAATAGGA
59
CTGTGTCTTCACCATCGTC
58
CAAATGGGTCTGGGTAATAGG
58
CAGCTAAGGCTGAGATCCC
60
CCAGCGGATAGTGATTTGC
59
CTCTCAGGGTTCATGATGTG
58
ATTCAAGTATTCCAGGGCCA
59
GTGTCTTCACCATCGTCCT
59
GGGTTTCATCTGGGTAATAGGA
59
      尚未收录相关数据

PTPRM基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PTPRM基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004725
E7EPS8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E7EPS8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
E7EPS8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3KRV2 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
J3KT55 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
J3KT55 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3QRB4 (UniProtKB)
IEA
GO:0001937
P28827 (UniProtKB)
IMP
GO:0004725
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0004725
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0004725
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0005001
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
P28827 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P28827 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P28827 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
P28827 (UniProtKB)
NAS
GO:0005911
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0005911
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0005913
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0006470
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0006470
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0007156
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0007165
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0010596
P28827 (UniProtKB)
IMP
GO:0010842
P28827 (UniProtKB)
IMP
GO:0016525
P28827 (UniProtKB)
IMP
GO:0030027
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0031175
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0031175
P28827 (UniProtKB)
IMP
GO:0031290
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0035335
P28827 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
P28827 (UniProtKB)
IEA
GO:0042493
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0042802
P28827 (UniProtKB)
IPI
GO:0045296
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0045909
P28827 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
P28827 (UniProtKB)
IDA
GO:0004725
Q49AC9 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
Q49AC9 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PTPRM基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 2 GAD
Fibrinogen Adverse Event 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 0 GAD
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Multiple Sclerosis 0.000271442 1 11 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree

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