PRSS50 (serine protease 50)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PRSS50
locus group:
protein-coding gene
location:
3p21.31
gene_family:
Proteases, serine
alias symbol:
TSP50|CT20
alias name:
cancer/testis antigen 20|testes sp…
entrez id:
29122
ensembl gene id:
ENSG00000283706
ucsc gene id:
uc021wxe.4
refseq accession:
NM_013270
hgnc_id:
HGNC:17910
approved reserved:
2009-11-06

基因染色体位置

基因染色体位置

3p21.31
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PRSS50基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs76203872       rs115081980       rs117456562       rs139333015       rs147253108       rs187429222       rs190001542       rs370984517       rs531611956       rs537901420       rs543309992       rs544292486       rs545307163       rs546230667       rs549151150       rs549870295       rs555447176      

基因表达

基因表达

PRSS50基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTGGTTCAGATCATCAAGTC
59
TCTCCAGTTAGCTCATAGCA
58
CTCTGGTTCAGATCATCAAGTC
59
TCTCCAGTTAGCTCATAGCA
58
CTGGTTCAGATCATCAAGTCC
59
CTCTCCAGTTAGCTCATAGCA
59
CTGGTTCAGATCATCAAGTCC
59
CTCTCCAGTTAGCTCATAGCA
59
TCTGGTTCAGATCATCAAGTC
58
TCTCCAGTTAGCTCATAGCA
58
TCTGGTTCAGATCATCAAGTC
58
TCTCCAGTTAGCTCATAGCA
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
CEBPB
PRSS50
Activation
18462069
SP1
PRSS50
Activation
18462069

基因本体信息

PRSS50基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRSS50基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004252
Q9UI38 (UniProtKB)
IEA
GO:0004298
Q9UI38 (UniProtKB)
IMP
GO:0005737
Q9UI38 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
Q9UI38 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
Q9UI38 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PRSS50基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Neoplasms, Germ Cell and Embryonal 0.00272435 1 0 LHGDN
Breast Carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001628651 6 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Multiple malignancy 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of cervix 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Cervix carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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