PRSS16 (serine protease 16)

symbol:
PRSS16
locus group:
protein-coding gene
location:
6p22.1
gene_family:
Proteases, serine
alias symbol:
TSSP
alias name:
thymus-specific serine protease
entrez id:
10279
ensembl gene id:
ENSG00000112812
ucsc gene id:
uc003nja.4
refseq accession:
NM_005865
hgnc_id:
HGNC:9480
approved reserved:
1999-12-10
6p22.1
基因染色体位置图

PRSS16(丝氨酸蛋白酶16)属于丝氨酸蛋白酶家族,该家族成员通常具有催化丝氨酸残基的活性位点,参与蛋白水解、信号转导和免疫调节等过程。PRSS16主要在胸腺髓质上皮细胞中表达,其编码的蛋白酶参与胸腺T细胞的选择和成熟过程,通过剪切特定肽段影响主要组织相容性复合体(MHC)II类分子的抗原呈递,从而调控自身免疫耐受的形成。该基因的突变可能导致胸腺功能异常,影响T细胞的发育和选择,增加自身免疫疾病(如多发性硬化或1型糖尿病)的风险。PRSS16过表达可能破坏正常的T细胞选择机制,导致自身反应性T细胞增多,引发自身免疫反应;而表达降低则可能削弱胸腺的阴性选择功能,同样增加自身免疫疾病的可能性。此外,PRSS16与某些癌症(如胸腺瘤)的关联也被研究,但其具体机制尚不明确。丝氨酸蛋白酶家族的共性包括依赖丝氨酸残基的催化三联体(通常由组氨酸、天冬氨酸和丝氨酸组成)、参与多种生理和病理过程(如凝血、补体激活和细胞凋亡)以及通过特异性底物剪切发挥功能。PRSS16作为该家族成员,具有组织特异性表达和独特的免疫调节功能,但其详细机制仍需进一步研究。

This gene encodes a serine protease expressed exclusively in the thymus. It is thought to play a role in the alternative antigen presenting pathway used by cortical thymic epithelial cells during the positive selection of T cells. The gene is found in the large histone gene cluster on chromosome 6, near the major histocompatibility complex (MHC) class I region. A second transcript variant has been described, but its full length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码只在胸腺中表达的丝氨酸蛋白酶。它被认为在T细胞的阳性选择过程中使用的皮质胸腺上皮细胞的替代抗原提呈途径中的作用。该基因大组蛋白基因簇中发现6号染色体上,靠近主要组织相容性复合体(MHC)I类地区。第二转录变体进行了说明,但其全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
PRSS16基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1062834       rs1234145       rs2273565       rs2295603       rs3734576       rs3734577       rs3734578       rs4546474       rs5030953       rs5030955       rs5030956       rs5030957       rs5030958       rs5030959       rs5030960       rs5030961       rs5030962      

PRSS16基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCCTCTTTAACATCTCCTCC
58
GGGATACCACGTCATTATACTC
58
GACGATCCTTCCTACAGGC
59
TGTGCAAGACAATGCAAGG
59
CCCTGGAGATTGTCTTGCA
60
TTGAGGTTCTGTGCTCCTC
59
ATCCGGAGATTGTCTTGCA
59
TTGAGGTTCTGTGCTCCTC
59
GACAATCCTATCCGGAGGG
59
GCTGCTGGAAGATGTTCTG
59
TCTTCTTATCCGCACTGGC
59
GCTGCTGGAAGATGTTCTG
58
CAGTTTCAGGAGAGCTCTG
58
ACAGGTGACATCTGTAGGA
57
CCAGGATGGACCCATATTCC
60
GGCTGTGCAAGACAATCTC
59
GGCTGAAGATTGTCTTGCA
59
TTGAGGTTCTGTGCTCCTC
59
ACAGACGATCCTTCCTACAG
59
TGTGCAAGACAATGCAAGG
59
      尚未收录相关数据

PRSS16基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRSS16基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006508
B4DZV2 (UniProtKB)
IEA
GO:0008236
B4DZV2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
B4DZV2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
C9JDN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008236
C9JDN6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
F2Z2N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008236
F2Z2N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WBG5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WF25 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
H0Y893 (UniProtKB)
IEA
GO:0008236
H0Y893 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
H0Y8B9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008236
H0Y8B9 (UniProtKB)
IEA
GO:0004185
Q9NQE7 (UniProtKB)
IBA
GO:0005764
Q9NQE7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005768
Q9NQE7 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
Q9NQE7 (UniProtKB)
IBA
GO:0008236
Q9NQE7 (UniProtKB)
NAS
GO:0008239
Q9NQE7 (UniProtKB)
IBA
GO:0016023
Q9NQE7 (UniProtKB)
IEA
GO:0030163
Q9NQE7 (UniProtKB)
NAS

可能调控 PRSS16基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.005005506 3 2 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.003181358 3 0 BeFree_GAD
Autoimmune Diseases 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Myasthenia Gravis 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Colitis 0.000271442 1 0 BeFree
Thymoma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。