PRR5-ARHGAP8 (PRR5-ARHGAP8 readthrough)

symbol:
PRR5-ARHGAP8
locus group:
other
location:
22q13.31
gene_family:
alias symbol:
None
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None
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553158
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ENSG00000248405
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uc062ezy.1
refseq accession:
NM_181334
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HGNC:34512
approved reserved:
2009-11-05
22q13.31
基因染色体位置图

PRR5-ARHGAP8是一个融合基因,由PRR5(富含脯氨酸蛋白5)和ARHGAP8(Rho GTP酶激活蛋白8)两个基因的部分序列融合而成。PRR5-ARHGAP8融合基因在多种癌症中被发现,包括白血病和实体瘤。PRR5编码的蛋白参与mTOR信号通路的调控,而ARHGAP8编码的蛋白属于Rho GTP酶激活蛋白家族,主要功能是通过促进GTP水解来负调控Rho家族GTP酶的活性,从而影响细胞骨架重组、细胞迁移和增殖等过程。当PRR5和ARHGAP8发生融合时,可能导致ARHGAP8的负调控功能丧失,进而增强Rho GTP酶的活性,促进肿瘤细胞的侵袭和转移。PRR5-ARHGAP8融合基因的突变或异常表达可能通过激活Rho信号通路,促进肿瘤的发生和发展。过表达PRR5-ARHGAP8可能增强肿瘤细胞的迁移和侵袭能力,而降低其表达可能抑制这些恶性表型。ARHGAP8属于ARHGAP基因家族,该家族成员均含有RhoGAP结构域,能够负调控Rho GTP酶的活性,从而在细胞骨架动态、细胞极性和运动等过程中发挥重要作用。PRR5-ARHGAP8融合基因的研究为理解肿瘤发生机制和开发新的治疗靶点提供了重要线索。

The PRR5-ARHGAP8 mRNA is an infrequent but naturally occurring read-through transcript of the neighboring proline rich 5, renal (PRR5) and Rho GTPase activating protein 8 (ARHGAP8) genes. The resulting fusion protein contains sequence identity with each individual gene product, and it includes domains characteristic of a RhoGAP protein. The significance of this read-through transcript and the function of its protein product have not yet been determined. [provided by RefSeq, Nov 2010]

的PRR5-ARHGAP8表达的是相邻的富含脯氨酸的5,肾功能(PRR5)和Rho GTP酶激活蛋白8(ARHGAP8)基因的罕见但自然发生通读成绩单。所得的融合蛋白包含与每个单独的基因产物的序列同一性,并且它包括一个RhoGAP蛋白质的特性域。此通读转录和其蛋白质产物的功能的重要性尚未确定。 [由RefSeq的,2010年11月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PRR5-ARHGAP8基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4372       rs4373       rs8777       rs8881       rs11183       rs13405       rs132428       rs132429       rs132430       rs132431       rs132432       rs132433       rs132434       rs132435       rs132436       rs132437       rs132438      

PRR5-ARHGAP8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCATCAGTCACAAGTTTGGG
59
CTGGTCGTATTTAAGGTGTTCG
59
TCGTCTATTTCCACTACGGG
59
CTTCTTGTACTTCCTATCGAACTC
59
ATCTCACTATGTGGCCCAG
59
TCTTCTTGTACCTGTAATCCCAG
60
GTGTTGTCACGTTCAGCTG
60
AAGTTCTTCTTGTACTCCAGCA
60
TCGTCTATTTCCACTACGGG
59
CTTCTTGTACTTCCTATCGAACTC
59
TCGTCTATTTCCACTACGGG
59
CTTCTTGTACTTCCTATCGAACTC
59
AGTTCGATAGGAAAGACGGG
59
AGTACTTTGGGAGGCTGAG
59
TCGTCTATTTCCACTACGGG
59
CTTCTTGTACTTCCTATCGAACTC
59
GTTCGATAGGAAAGACGGG
58
AGTACTTTGGGAGGCTGAG
59
GTCTATTTCCACTACGGGCT
59
CTTCTTGTACTTCCTATCGAACTC
59
      尚未收录相关数据

PRR5-ARHGAP8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRR5-ARHGAP8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007165
B1AHC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
B1AHC4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
H0Y9T8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PRR5-ARHGAP8基因的相关microRNA:     

BioGrid

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colonic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Stomach Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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