PRF1 (perforin 1)

symbol:
PRF1
locus group:
protein-coding gene
location:
10q22.1
gene_family:
C2 domain containing - ungrouped
alias symbol:
PFP|P1|HPLH2
alias name:
Perforin|perforin 1 (preforming pr…
entrez id:
5551
ensembl gene id:
ENSG00000180644
ucsc gene id:
uc009xqg.4
refseq accession:
NM_005041
hgnc_id:
HGNC:9360
approved reserved:
1989-02-23
10q22.1

PRF1基因编码穿孔素(Perforin),这是一种由细胞毒性T淋巴细胞(CTL)和自然杀伤(NK)细胞分泌的关键效应蛋白,属于免疫球蛋白超家族中的膜攻击复合物/穿孔素(MACPF)家族。穿孔素的主要功能是在靶细胞膜上形成孔道,使颗粒酶(如颗粒酶B)进入靶细胞内部,触发凋亡途径,从而清除病毒感染或癌变的细胞。这一机制在细胞介导的免疫反应中至关重要。PRF1基因突变会导致穿孔素功能缺陷,引发家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症(FHL2),这是一种致命的免疫调节紊乱疾病,表现为过度炎症反应和多器官衰竭。此外,穿孔素表达异常还与自身免疫性疾病(如1型糖尿病)和某些癌症的免疫逃逸有关。若PRF1过表达,可能导致过度免疫激活,引发组织损伤或自身免疫反应;而表达降低则削弱免疫监视功能,增加病毒感染和肿瘤发生风险。MACPF家族成员(如补体成分C9)的共同特点是能形成跨膜孔道,参与宿主防御。PRF1的活性受钙离子浓度和pH值调控,其表达水平受转录因子(如T-bet和Eomes)调节。了解PRF1的功能及调控机制对开发针对免疫缺陷和过度激活疾病的治疗策略具有重要意义。

The protein encoded by this gene has structural and functional similarities to complement component 9 (C9). Like C9, this protein creates transmembrane tubules and is capable of lysing non-specifically a variety of target cells. This protein is one of the main cytolytic proteins of cytolytic granules, and it is known to be a key effector molecule for T-cell- and natural killer-cell-mediated cytolysis. Defects in this gene cause familial hemophagocytic lymphohistiocytosis type 2 (HPLH2), a rare and lethal autosomal recessive disorder of early childhood. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质具有的结构和功能的相似性,以补充部件9(C9)。像C9,这种蛋白跨膜造成肾小管和能够裂解非特异性各种靶细胞中。该蛋白质是细胞裂解的颗粒的主要溶细胞蛋白之一,它是已知的对于T-细胞和自然杀伤细胞介导的??细胞溶解的关键效应分子。这种基因缺陷导致家族性噬血细胞淋巴组织细胞2型(HPLH2),儿童早期的一种罕见的和致命的常染色体隐性遗传疾病。在多个转录剪接的结果变体编码相同的蛋白质。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PRF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs885821       rs885822       rs1042652       rs1889490       rs2228018       rs2228019       rs3758560       rs3758561       rs3758562       rs3758563       rs3781307       rs3781308       rs5785987       rs6480459       rs6480460       rs7080373       rs7087844      

PRF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGCTTCTACAGTTTCCATGTG
60
GATAAGCCTGAGGTAGGCG
60
CGCTTCTACAGTTTCCATGTG
60
GATAAGCCTGAGGTAGGCG
60
CTTCTACAGTTTCCATGTGGT
58
AGATAAGCCTGAGGTAGGC
58
CTTCTACAGTTTCCATGTGGT
58
AGATAAGCCTGAGGTAGGC
58
GCTTCTACAGTTTCCATGTGG
59
GATAAGCCTGAGGTAGGCG
60
GCTTCTACAGTTTCCATGTGG
59
GATAAGCCTGAGGTAGGCG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
STAT4
PRF1
Activation

PRF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001771
P14222 (UniProtKB)
IDA
GO:0002357
P14222 (UniProtKB)
ISS
GO:0002418
P14222 (UniProtKB)
ISS
GO:0006915
P14222 (UniProtKB)
TAS
GO:0006968
P14222 (UniProtKB)
TAS
GO:0019835
P14222 (UniProtKB)
ISS
GO:0051260
P14222 (UniProtKB)
IDA
GO:0051607
P14222 (UniProtKB)
ISS
GO:0055085
P14222 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PRF1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HEMOPHAGOCYTIC LYMPHOHISTIOCYTOSIS, FAMILIAL, 2 0.44 2 13 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Lymphoma, Non-Hodgkin 0.24 0 2 CLINVAR_CTD_human
Familial Hemophagocytic Lymphocytosis 0.122367032 1 0 GAD_ORPHANET
Non-alcoholic Fatty Liver Disease 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Autistic Disorder 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Aplastic anemia, idiopathic 0.12 0 0 ORPHANET
APLASTIC ANEMIA, SUSCEPTIBILITY TO (finding) 0.12 0 1 CLINVAR
Aplastic Anemia 0.12 0 2 CLINVAR
Asthma 0.085895776 15 0 BeFree_GAD_RGD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.082638474 1 0 BeFree_GAD_MGD

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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