PRDM14 (PR/SET domain 14)

symbol:
PRDM14
locus group:
protein-coding gene
location:
8q13.3
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
63978
ensembl gene id:
ENSG00000147596
ucsc gene id:
uc003xym.3
refseq accession:
NM_024504
hgnc_id:
HGNC:14001
approved reserved:
2000-11-28
8q13.3
基因染色体位置图

PRDM14(PR domain containing 14)是一种含有PR结构域(PRDI-BF1和RIZ1同源结构域,参与表观遗传调控的蛋白模块)的转录调控因子,属于PRDM基因家族。该家族成员通常具有锌指结构(DNA结合域)和PR/SET结构域(具有组蛋白甲基转移酶活性),参与细胞分化、发育和肿瘤发生等过程。PRDM14在胚胎干细胞(ESC)中高表达,通过维持多能性(细胞分化为多种类型的能力)和抑制分化相关基因来调控干细胞的自我更新。其作用位点包括多能性相关基因(如OCT4、NANOG)的启动子区域,通过组蛋白修饰(如H3K27me3抑制标记)影响染色质状态。PRDM14突变或表达异常可能导致发育缺陷或癌症,例如在乳腺癌和睾丸生殖细胞肿瘤中常见过表达,与肿瘤侵袭性和不良预后相关。若PRDM14过表达,可能增强干细胞特性,促进肿瘤发生或阻碍正常分化;而降低表达则可能导致干细胞多能性丧失或过早分化。PRDM14还与DNA去甲基化(去除基因启动子的甲基化以激活表达)过程相关,尤其在原始生殖细胞(PGCs)中调控表观遗传重编程。该基因家族(PRDM)的共性包括通过甲基化修饰组蛋白或DNA来调控基因表达,影响细胞命运决定和疾病进程。在免疫系统中,PRDM14还参与B细胞发育。其功能冗余性(家族成员功能重叠)常见于PRDM家族,但PRDM14在多能性维持中的作用较为独特。

This gene encodes a member of the PRDI-BF1 and RIZ homology domain containing (PRDM) family of transcriptional regulators. The encoded protein may possess histone methyltransferase activity and plays a critical role in cell pluripotency by suppressing the expression of differentiation marker genes. Expression of this gene may play a role in breast cancer. [provided by RefSeq, Dec 2011]

该基因编码含有转录调节(PRDM)家庭PRDI-BF1和RIZ同源域的成员。所编码的蛋白质可具有组蛋白甲基转移酶活性和通过抑制分化标记基因的表达在细胞多能性的关键作用。这个基因的表达可能在乳腺癌的作用。 [由RefSeq的,2011年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PRDM14基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1982413       rs3750225       rs3750226       rs3750227       rs3750228       rs3750229       rs3750230       rs3812431       rs3812432       rs4412398       rs4442174       rs4618733       rs4737296       rs4737298       rs4738066       rs4738067       rs6472507      

PRDM14基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTGTACTAAGAGGTTCACAGC
58
TGCATTTGAAGGGCTTCTC
59
CTGGGATCTTCCGAACTGG
60
TAGCACACCTTGTCCTGAG
59
GGATCTTCCGAACTGGGAG
60
TAGCACACCTTGTCCTGAG
59
CAAGGTAAAGTGGTCAATGC
57
ATGACCATCTTCAAAGATCTCC
58
CAGCTCTGGATCTGATTCTC
58
GTCTGCATGAGGCATAGAC
58
CTTCTGGACTCCGGTTCAG
60
TAGCACACCTTGTCCTGAG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
PRDM14
POU5F1
Activation

PRDM14基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRDM14基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000902
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0001708
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0001827
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9GZV8 (UniProtKB)
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Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
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Q9GZV8 (UniProtKB)
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Q9GZV8 (UniProtKB)
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Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
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Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
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Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
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Q9GZV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q9GZV8 (UniProtKB)
TAS
GO:0006351
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007281
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007566
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
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Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0009566
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0030718
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0031490
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0034972
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035019
Q9GZV8 (UniProtKB)
TAS
GO:0040037
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0044030
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0048873
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0060817
Q9GZV8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PRDM14基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Testicular Germ Cell Tumor 0.24 1 1 CTD_human_GWASCAT
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.12 1 0 CTD_human
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Cervix carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Non-small cell lung cancer metastatic 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of mouth 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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