PRCC (proline rich mitotic checkpoint control factor)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PRCC
locus group:
protein-coding gene
location:
1q23.1
gene_family:
alias symbol:
RCCP1
alias name:
None
entrez id:
5546
ensembl gene id:
ENSG00000143294
ucsc gene id:
uc001fqa.4
refseq accession:
NM_005973
hgnc_id:
HGNC:9343
approved reserved:
1996-09-03

基因染色体位置

基因染色体位置

1q23.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PRCC（PRCC基因）位于人类1号染色体上，编码一种称为“乳头状肾细胞癌相关蛋白”的蛋白质。该基因的主要功能与细胞周期调控、RNA剪接和转录调控相关，尤其在肾细胞中发挥重要作用。PRCC蛋白通过与TFE3转录因子相互作用，参与基因表达的调控，影响细胞增殖和分化。PRCC基因的突变或易位（如与TFE3基因融合）会导致功能异常，最常见的是t(X;1)(p11;q21)染色体易位，这种突变与乳头状肾细胞癌（PRCC）的发生密切相关，导致TFE3-PRCC融合蛋白的异常表达，进而促进肿瘤生长。PRCC基因过表达可能扰乱正常的细胞周期和转录调控，促进肿瘤发生；而降低表达则可能影响肾脏细胞的正常功能，但具体机制尚不完全清楚。PRCC属于一个功能多样的基因家族，但目前尚未明确归类到特定家族。该基因的突变或异常表达不仅与肾癌相关，还可能与其他恶性肿瘤或发育异常有关。研究PRCC基因有助于理解肾癌的分子机制，并为靶向治疗提供潜在方向。

This gene encodes a protein that may play a role in pre-mRNA splicing. Chromosomal translocations (X;1)(p11;q21) that result in fusion of this gene to TFE3 (GeneID 7030) have been associated with papillary renal cell carcinoma. A PRCC-TFE3 fusion protein is expressed in affected carcinomas and is likely associated with altered gene transactivation. This fusion protein has also been associated with disruption of the cell cycle.[provided by RefSeq, Aug 2010]

该基因编码可能在mRNA前剪接作用的蛋白质。染色体易位（X; 1）（P11，Q21）是导致该基因的融合TFE3（GeneID 7030）已与乳头状肾细胞癌有关。一个PRCC-TFE3融合蛋白在受影响的癌表达，并有可能与改变的基因转录有关。该融合蛋白也已与细胞周期的破坏有关。[通过的RefSeq，2010年8月提供]

OMIM数据库中对PRCC基因的介绍     Wikipedia数据库中对PRCC基因的介绍

基因序列

基因序列

PRCC基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PRCC基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs928392       rs1044319       rs1044348       rs1044362       rs1062796       rs1412310       rs1758186       rs2025856       rs2274501       rs2274503       rs2274504       rs2644615       rs2768742       rs2768767       rs2777929       rs3753212       rs3765783      

基因表达

基因表达

PRCC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTATTCATCAGGCCAAGGAG
57
ATATTTGGCTTGGGTCTGAC
58
TTATTCATCAGGCCAAGGAG
57
ATATTTGGCTTGGGTCTGAC
58
TGACGAAGCATTTAAGCGG
59
GGTCATCACCTTTGATCTCCA
60
TCCCAAGCCAAAGAAGAGG
60
TCTTCCTCAGAATCTGAATCTCC
60
CATATGGAGGAATATTTCTGTGGAG
59
TCTTCCTCAGAATCTGACTGG
59
TAAGTGAAGAGTCAGATTCTGAGG
60
CAAGGCAGACAAACCAGTC
59
ATTATCAGGGTCTGCAGCA
59
AAAGCAGGTTCGTTTACCAG
59
ATCCTTCAGGGATCCAGTG
59
GTTAGTCTCTTTCACAGTCAGG
59
TATTATCAGTTTAAGCGGCTGC
59
GGTCATCACCTTTGATCTCCA
60
CTTATTCATCAGGCCAAGGA
57
TATTTGGCTTGGGTCTGAC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PRCC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRCC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q92733 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q92733 (UniProtKB)
IDA
GO:0007093
Q92733 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PRCC基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Renal Cell Carcinoma 0.122985861 11 0 BeFree_CTD_human
RENAL CELL CARCINOMA, Xp11-ASSOCIATED 0.12 0 0 ORPHANET
Papillary Renal Cell Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Sarcoma 0.000271442 1 0 BeFree
Clear-cell metastatic renal cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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