PRAF2 (PRA1 domain family member 2)

symbol:
PRAF2
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.23
gene_family:
alias symbol:
JM4|Yip6a
alias name:
None
entrez id:
11230
ensembl gene id:
ENSG00000243279
ucsc gene id:
uc033ecu.2
refseq accession:
NM_007213
hgnc_id:
HGNC:28911
approved reserved:
2004-09-01
Xp11.23
基因染色体位置图

PRAF2(Prenylated Rab Acceptor 1 Family Member 2)属于PRAF基因家族,该家族成员主要参与细胞内囊泡运输和膜转运过程,尤其是与Rab GTPases的调控相关。PRAF2定位于高尔基体和内质网,通过与Rab蛋白相互作用调节囊泡的形成、运输和融合,影响细胞分泌和膜蛋白分选。PRAF2的生物学功能包括维持细胞器完整性、参与神经递质释放及突触可塑性,还可能通过调控凋亡相关通路影响细胞存活。其突变可能导致囊泡运输障碍,与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)和某些癌症(如胶质瘤)的发生有关。若PRAF2过表达,可能干扰Rab蛋白的正常功能,导致分泌途径紊乱或异常细胞增殖;而表达降低则可能损害突触传递或诱发细胞凋亡。PRAF基因家族的共性在于均含有保守的PRAD(Prenylated Rab-binding Domain)结构域,能够特异性结合异戊二烯化修饰的Rab蛋白,协同调控细胞内运输网络。此外,PRAF2与家族其他成员(如PRAF1/PRA1、PRAF3)在组织分布上存在差异,例如PRAF2在脑组织中高表达,提示其对神经系统功能的特异性贡献。研究还发现PRAF2可能通过影响Wnt/β-catenin等信号通路参与肿瘤转移,但其具体机制仍需进一步探索。

None

PRAF2基因的碱基序列:[NCBI]
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PRAF2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782805009       rs782821061       rs782794836       rs782802341       rs782784533       rs782771748       rs782771450       rs782757176       rs782761022       rs782764657       rs782754327       rs782745423       rs782753806       rs782744611       rs782736017       rs782739165       rs782732316      

PRAF2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACAAGATCGAGAGCATTGG
60
CAGTGCCTCTAGTAGCAGG
59
AACTACCTTCTCTGCTTCGG
60
TCAGGAGCGTATGAAGTGG
59
AACTACCTTCTCTGCTTCGG
60
TCAGGAGCGTATGAAGTGG
59
AACAGGACATCTGTGACCG
60
GTGTGAGGGATATCTTAGTTTGG
59
ACTACCTTCTCTGCTTCGG
59
CTCAGGAGCGTATGAAGTG
58
ACTACCTTCTCTGCTTCGG
59
CTCAGGAGCGTATGAAGTG
58
ACTACCTTCTCTGCTTCGG
59
TCAGGAGCGTATGAAGTGG
59
ACTACCTTCTCTGCTTCGG
59
TCAGGAGCGTATGAAGTGG
59
AACAAGATCGAGAGCATTGG
58
CCAGTGCCTCTAGTAGCAG
59
      尚未收录相关数据

PRAF2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRAF2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A6NP52 (UniProtKB)
IEA
GO:0010008
O60831 (UniProtKB)
IEA
GO:0015031
O60831 (UniProtKB)
IEA
GO:0015813
O60831 (UniProtKB)
ISS
GO:0016021
O60831 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PRAF2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Central neuroblastoma 0.000542884 2 0 BeFree
Neuroblastoma 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of bone marrow 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant Glioma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant Childhood Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree

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