PPBP (pro-platelet basic protein)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PPBP
locus group:
protein-coding gene
location:
4q13.3
gene_family:
Endogenous ligands
alias symbol:
SCYB7|TGB|NAP-2-L1|LA-PF4|MDGF|LDGF|Beta-TG|CTAP3|CXCL7|PBP|b-TG1|TGB1|CTAPIII|NAP-2
alias name:
platelet basic protein|beta-thromb…
entrez id:
5473
ensembl gene id:
ENSG00000163736
ucsc gene id:
uc003hhj.4
refseq accession:
NM_002704
hgnc_id:
HGNC:9240
approved reserved:
1991-05-21

基因染色体位置

基因染色体位置

4q13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PPBP（Pro-Platelet Basic Protein）是一种属于CXC趋化因子家族的基因，也被称为CXCL7或β-血栓球蛋白（β-TG）。它主要在巨核细胞和血小板中表达，并在血小板活化时释放。PPBP编码的蛋白质经过剪切后形成多种活性形式，包括血小板碱性蛋白（PBP）、结缔组织激活肽III（CTAP-III）和中性粒细胞激活肽2（NAP-2）。这些蛋白质在炎症反应、血管生成和伤口愈合中发挥重要作用。PPBP的主要作用位点是血管内皮细胞和中性粒细胞，通过结合CXCR1和CXCR2受体来介导趋化作用，促进中性粒细胞的迁移和活化。PPBP的突变可能导致血小板功能异常或炎症反应失调，但具体的突变影响尚不完全清楚。研究表明，PPBP与动脉粥样硬化、血栓形成和某些癌症（如肺癌和乳腺癌）的发生发展有关。PPBP过表达可能加剧炎症反应和血管异常增生，促进肿瘤微环境的形成；而降低表达则可能影响血小板活化和炎症反应的正常过程。CXC趋化因子家族是一类富含半胱氨酸（C-X-C motif）的小分子分泌蛋白，主要参与免疫调节、炎症反应和血管生成。家族成员通常通过G蛋白偶联受体发挥作用，调控白细胞的迁移和活化。PPBP作为该家族的一员，与其他成员如IL-8（CXCL8）和PF4（CXCL4）具有相似的结构和功能特征，但在表达模式和具体生物学效应上存在差异。

The protein encoded by this gene is a platelet-derived growth factor that belongs to the CXC chemokine family. This growth factor is a potent chemoattractant and activator of neutrophils. It has been shown to stimulate various cellular processes including DNA synthesis, mitosis, glycolysis, intracellular cAMP accumulation, prostaglandin E2 secretion, and synthesis of hyaluronic acid and sulfated glycosaminoglycan. It also stimulates the formation and secretion of plasminogen activator by synovial cells. The protein also is an antimicrobial protein with bactericidal and antifungal activity. [provided by RefSeq, Nov 2014]

由该基因编码的蛋白是属于趋化因子家族，血小板衍生的生长因子。这种生长因子是一种强效化学引诱物和嗜中性粒细胞的活化剂。已经表明，以刺激各种细胞过程，包括DNA的合成，有丝分裂，糖酵解，细胞内cAMP积聚，前列腺素E2的分泌，和透明质酸和硫酸化糖胺聚糖的合成。它也刺激由滑膜细胞的形成和纤维蛋白溶酶原活化剂的分泌。该蛋白质也是抗微生物蛋白具有杀菌和抗真菌活性。 [由RefSeq的，2014年11月提供]

OMIM数据库中对PPBP基因的介绍     Wikipedia数据库中对PPBP基因的介绍

基因序列

基因序列

PPBP基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PPBP基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs183028       rs352009       rs352010       rs377579       rs552582       rs2435197       rs2435198       rs2458097       rs2458098       rs9291191       rs16850295       rs35033774       rs55765475       rs60720029       rs61290993       rs73824590       rs74663056      

基因表达

基因表达

PPBP基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGCAAAGAGGAAAGTCTAGAC
60
TTTGGGATGAATTCCAGAGGT
60
CTTCTGTCATTGCTGCTGAC
60
GACTTTCCTCTTTGCCTTTCG
60
CTGTCATTGCTGCTGACTG
59
GACTTTCCTCTTTGCCTTTCG
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
TBP
PPBP
Unknown
7958954

基因本体信息

PPBP基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PPBP基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002523
P02775 (UniProtKB)
IEA
GO:0002576
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0002690
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0005355
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0006954
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0006955
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0007186
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0008009
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0008083
P02775 (UniProtKB)
IEA
GO:0015758
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0030593
P02775 (UniProtKB)
IEA
GO:0031093
P02775 (UniProtKB)
TAS
GO:0032496
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0042127
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0042742
P02775 (UniProtKB)
IEA
GO:0043312
P02775 (UniProtKB)
IEA
GO:0045236
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:0051781
P02775 (UniProtKB)
IEA
GO:0070098
P02775 (UniProtKB)
IBA
GO:1904659
P02775 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PPBP基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypertensive disease 0.12 2 0 CTD_human
Hypersensitivity 0.12 1 0 CTD_human
Coronary Artery Disease 0.00272435 1 0 LHGDN
Acute Coronary Syndrome 0.00272435 1 0 LHGDN
Bronchiolitis, Viral 0.002367032 1 0 GAD
Asthma 0.002367032 1 0 GAD
Respiratory Syncytial Virus Infections 0.002367032 1 0 GAD
MRSA - Methicillin resistant Staphylococcus aureus infection 0.001357209 5 0 BeFree
Influenza 0.001085767 4 0 BeFree
Chagas Disease 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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