POC1B-GALNT4 (POC1B-GALNT4 readthrough)

symbol:
POC1B-GALNT4
locus group:
other
location:
12q21.33
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100528030
ensembl gene id:
ENSG00000259075
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uc001tbe.4
refseq accession:
NM_001199781
hgnc_id:
HGNC:42957
approved reserved:
2011-09-28
12q21.33
基因染色体位置图

POC1B-GALNT4是一个融合基因,由POC1B(Proteasome Maturation Protein)和GALNT4(Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 4)两个基因的部分序列组成。POC1B基因编码的蛋白是中心体和纤毛组装的关键调控因子,参与细胞周期调控和微管组织。GALNT4基因编码的蛋白属于多肽N-乙酰半乳糖胺转移酶家族(GALNT家族),负责在蛋白质的丝氨酸或苏氨酸残基上添加N-乙酰半乳糖胺(GalNAc),这是O-糖基化的第一步。GALNT家族共有20个成员,它们共同参与蛋白质翻译后修饰,影响蛋白质的稳定性、定位和功能,尤其在粘蛋白型O-糖基化中起核心作用。POC1B-GALNT4融合基因可能导致两种蛋白功能的异常结合,可能影响细胞周期和糖基化过程。POC1B的突变或表达异常与纤毛病如视网膜色素变性有关,而GALNT4的异常表达可能影响粘蛋白的糖基化,与某些癌症如胃癌和结肠癌的发展相关。如果POC1B-GALNT4过表达,可能导致细胞周期紊乱或异常的糖基化模式,进而影响细胞增殖和分化;降低表达则可能损害纤毛功能或糖基化过程,影响细胞信号传导和组织稳态。该融合基因的具体功能尚需进一步研究,但其组成基因的独立功能提示它可能在发育和疾病中扮演重要角色。

This locus represents naturally occurring transcripts that splice the 5' exons of the POC1B (POC1 centriolar protein homolog B) gene on chromosome 12 to the GALNT4 (UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4) gene, which is located within a POC1B intron. Alternative splicing results in two transcript variants, one of which encodes a fusion isoform that shares sequence identity with the products of each individual gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

此轨迹表示天然存在的剪接的5‘上12号染色体的POC1B的外显子(POC1中心粒蛋白同系物B)的基因的GALNT4转录(UDP-N-乙酰基的α-D-半乳糖胺:多肽N-二acetylgalactosaminyltransferase 4)基因,它位于一个POC1B内含子内。剪接导致两个转录变异体,其中一个编码共享序列同一性与每个基因的产物的融合同种型。 [由RefSeq的,2010年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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POC1B-GALNT4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1054807       rs2230281       rs2230282       rs2230283       rs3168593       rs3759319       rs3864928       rs4589356       rs7133847       rs7299750       rs7306772       rs10745507       rs10777184       rs10858892       rs10858893       rs10858894       rs10858895      

POC1B-GALNT4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGAGCGTTATTTCAAAGGC
59
CTGTCCCTTTCCAAGTTGC
59
GATCACCTCCTTGGACCTC
59
GTCTGAGAGCCTTCTTGAC
58
GATCACCTCCTTGGACCTC
59
TCTGAGAGCCTTCTTGACC
59
TGGAGCGTTATTTCAAAGGC
59
TGTCCCTTTCCAAGTTGCT
60
GATCACCTCCTTGGACCTC
59
CTGAGAGCCTTCTTGACCC
60
GAGCGTTATTTCAAAGGCCA
59
CTGTCCCTTTCCAAGTTGC
59
      尚未收录相关数据

POC1B-GALNT4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

POC1B-GALNT4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
F8VUJ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006486
F8VUJ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8VUJ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016757
F8VUJ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030246
F8VUJ3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 POC1B-GALNT4基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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