PLS3 (plastin 3)

symbol:
PLS3
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq23
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
T-plastin
alias name:
None
entrez id:
5358
ensembl gene id:
ENSG00000102024
ucsc gene id:
uc004eqd.4
refseq accession:
NM_001136025
hgnc_id:
HGNC:9091
approved reserved:
1997-08-18
Xq23
基因染色体位置图

PLS3(Plastin 3)是一种肌动蛋白结合蛋白,属于Plastin基因家族,该家族还包括PLS1和PLS2。Plastin家族的共性在于它们都含有肌动蛋白结合域,能够参与细胞骨架的重组和稳定,影响细胞形态、迁移和信号传导。PLS3主要在骨骼肌、神经元和造血细胞中表达,其核心功能是调节肌动蛋白丝的捆绑和动态重组,从而维持细胞结构的完整性和运动能力。PLS3在神经突触的形成和骨骼肌发育中尤为重要,它通过稳定肌动蛋白网络促进神经元的可塑性和肌肉收缩功能。PLS3的突变或表达异常与多种疾病相关,例如X连锁骨质疏松症(XLOP),患者因PLS3功能缺失导致骨密度降低和骨折风险增加。此外,PLS3的过表达在某些癌症(如乳腺癌和神经母细胞瘤)中可能促进肿瘤细胞的侵袭和转移,因其增强了细胞的迁移能力。相反,PLS3表达降低可能导致神经肌肉功能障碍或骨骼发育异常。研究还发现,PLS3的上调可能补偿脊髓性肌萎缩症(SMA)中SMN1基因缺失的部分功能,暗示其潜在的治疗价值。PLS3的调控机制涉及转录和翻译水平,且受细胞应激和生长因子信号的影响。该基因的突变类型包括错义突变、无义突变或拷贝数变异,不同突变可能导致功能丧失或获得异常功能。总体而言,PLS3在细胞骨架动力学和疾病中扮演多重角色,其表达水平的精确调控对维持正常生理功能至关重要。

Plastins are a family of actin-binding proteins that are conserved throughout eukaryote evolution and expressed in most tissues of higher eukaryotes. In humans, two ubiquitous plastin isoforms (L and T) have been identified. Plastin 1 (otherwise known as Fimbrin) is a third distinct plastin isoform which is specifically expressed at high levels in the small intestine. The L isoform is expressed only in hemopoietic cell lineages, while the T isoform has been found in all other normal cells of solid tissues that have replicative potential (fibroblasts, endothelial cells, epithelial cells, melanocytes, etc.). The C-terminal 570 amino acids of the T-plastin and L-plastin proteins are 83% identical. It contains a potential calcium-binding site near the N terminus. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Feb 2010]

Plastins是在整个真核生物进化保守,并表示在高等真核生物的大多数组织中的肌动蛋白结合蛋白的一个家族。在人类中,二无处不plastin亚型(L和T)已经确定。 Plastin 1(也称为丝束)是第三独特plastin亚型这是专门以高水平在小肠中表达。第l同种型表达仅在造血细胞谱系,而T同种型已在具有复制能力的固体组织(成纤维细胞,内皮细胞,上皮细胞,黑素细胞,等等)的所有其它正常细胞被发现。在T-plastin和L-网蛋白的C末端570氨基酸83%相同。它包含的N末端附近的一个潜在的钙结合位点。选择性剪接结果在多个抄本变形。[由RefSeq的,2010年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PLS3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs796856195       rs782820026       rs782821122       rs782819720       rs782817494       rs782816136       rs782815962       rs782814939       rs782814572       rs782813588       rs782812682       rs782812289       rs782812007       rs782809930       rs782807818       rs782809882       rs782807751      

PLS3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACATCAAGGATTCCAAAGCC
59
ATCTATCCGTGGTTCACCT
58
GACTCTATTAGAAGGAGAAACTCGT
60
TTTACGTGAGGATTGACACCA
60
GCTGACATCAAGCTTATTGAC
58
TTTGGTGCGATTTGATTGAG
57
CTCTCAGCGGATCTTTAAATGG
59
TTGCAAAGGCCTCTTTGAG
59
GAGCTTGATGAACTCAAAGAGG
59
TAACACGGTGAAACTCCGT
59
CTTGATGAACTCAAAGAGGCC
59
CACAAATGAATCCGTTGCTG
58
TATACCAATGAACCCTAACACC
58
TACAAAGCACAATTCCATCACC
60
GCTGACATCAAGCTTATTGAC
58
TTTGGTGCGATTTGATTGAG
57
GAGCTTGATGAACTCAAAGAGG
59
TAACACGGTGAAACTCCGT
59
TCATGTTGACTGATTCCAAAGC
60
TATCCGTGGTTCACCTTCC
59
      尚未收录相关数据

PLS3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PLS3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003779
A0A0A0MSQ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
A0A0A0MSQ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
P13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
P13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0032420
P13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0042491
P13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0060348
P13797 (UniProtKB)
IMP
GO:0005509
U3KQI3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PLS3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
BONE MINERAL DENSITY QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 18 0.12 0 0 ORPHANET
Degenerative polyarthritis 0.12 1 0 CTD_human
Sezary Syndrome 0.003538676 4 0 BeFree_LHGDN
Lymphoma, T-Cell, Cutaneous 0.00272435 1 0 LHGDN
Spinal Muscular Atrophy 0.001357209 5 0 BeFree
Osteoporosis 0.001085767 4 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.001085767 4 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000542884 2 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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