PKD1L1 (polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting)

symbol:
PKD1L1
locus group:
protein-coding gene
location:
7p12.3
gene_family:
alias symbol:
PRO19563
alias name:
polycystin-1L1
entrez id:
168507
ensembl gene id:
ENSG00000158683
ucsc gene id:
uc003tny.3
refseq accession:
NM_138295
hgnc_id:
HGNC:18053
approved reserved:
2002-03-21
7p12.3
基因染色体位置图

PKD1L1(Polycystic Kidney Disease 1 Like 1)属于多囊肾病1样基因家族(PKD1-like family),该家族成员编码的蛋白质通常含有多个跨膜结构域,参与细胞信号传导和离子通道调控。PKD1L1基因编码的蛋白质是一种潜在的钙离子通道或调控蛋白,主要表达于肾脏、心脏和神经系统等组织中。它在细胞膜上形成复合物,可能参与机械感受或化学感受信号传导,尤其在味觉感知和内脏器官的发育中起重要作用。PKD1L1与PKD1(多囊肾病1基因)结构相似,但功能上更可能与感觉信号相关而非囊肿形成。PKD1L1的突变可能导致其功能异常,影响钙信号通路,进而干扰细胞增殖或分化,但目前尚未明确与特定疾病的直接关联。研究表明,PKD1L1可能与某些先天性心脏病或味觉功能障碍有关,但具体机制仍需进一步研究。如果PKD1L1过表达,可能干扰正常的钙信号平衡,导致细胞异常兴奋或增殖,而降低表达则可能影响感觉信号传导或器官发育。PKD1L1与其他PKD家族成员(如PKD1和PKD2)共享类似的结构域,但功能上更偏向于感觉调控而非囊肿形成。该基因家族的共性包括参与细胞间通讯、离子通道功能及机械或化学信号感知。PKD1L1的具体生物学功能仍在探索中,但它在感觉系统和器官发育中的潜在作用使其成为研究热点。

This gene encodes a member of the polycystin protein family containing 11 transmembrane domains, a receptor for egg jelly (REJ) domain, and a polycystin-1, lipoxygenase, alpha-toxin (PLAT) domain. The encoded protein may play a role in the male reproductive system. Alternative splice variants have been described but their biological nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码含有11个跨膜结构域,为蛋果冻(REJ)结构域的受体的多囊蛋白家族的成员,和多囊蛋白1,脂氧合酶,α毒素(PLAT)域。所编码的蛋白质可能在男性生殖系统的作用。备选剪接变体已被描述,但它们的生物性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PKD1L1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs965143       rs965144       rs1074780       rs1453286       rs1466203       rs1869322       rs1869323       rs1901794       rs2084951       rs2123608       rs2290386       rs2348459       rs2348460       rs2348462       rs2881919       rs3734931       rs3734933      

PKD1L1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATTTATGCAAGCCTCCCAG
59
TCTGGGTCTATCAGGTAGGG
60
GTGTGCTCTGAATGGAAAGG
59
TTCCAAATGTTCTTCTGCCTG
59
ATCCTAGCTACTCAAAGCTGG
59
CCCTTGTCCATCATACGGT
59
CAGAACAAGGACTGAAGCC
59
GTGAAGTGCACAGACACAG
59
CAGAACAAGGACTGAAGCC
59
GTGAAGTGCACAGACACAG
59
AGAACAAGGACTGAAGCCC
60
GTGAAGTGCACAGACACAG
59
ATGTCTACAGTAGGGAAGGAG
58
GTTGCTGTCTTAGAGTGGAG
58
TCCTAGCTACTCAAAGCTGG
59
CCCTTGTCCATCATACGGT
59
AGAACAAGGACTGAAGCCC
60
GTGAAGTGCACAGACACAG
59
CATTTATGCAAGCCTCCCA
58
CTGGGTCTATCAGGTAGGG
58
      尚未收录相关数据

PKD1L1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PKD1L1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H7C083 (UniProtKB)
IEA
GO:0003127
Q8TDX9 (UniProtKB)
ISS
GO:0005262
Q8TDX9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q8TDX9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005929
Q8TDX9 (UniProtKB)
ISS
GO:0016020
Q8TDX9 (UniProtKB)
TAS
GO:0016337
Q8TDX9 (UniProtKB)
NAS
GO:0031513
Q8TDX9 (UniProtKB)
IDA
GO:0034704
Q8TDX9 (UniProtKB)
IDA
GO:0050982
Q8TDX9 (UniProtKB)
IBA
GO:0060170
Q8TDX9 (UniProtKB)
IEA
GO:0070588
Q8TDX9 (UniProtKB)
IEA
GO:0070986
Q8TDX9 (UniProtKB)
ISS

可能调控 PKD1L1基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Spastic syndrome 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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