PEPD (peptidase D)

symbol:
PEPD
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.11
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
prolidase|Xaa-Pro dipeptidase|imid…
entrez id:
5184
ensembl gene id:
ENSG00000124299
ucsc gene id:
uc002nur.5
refseq accession:
NM_000285
hgnc_id:
HGNC:8840
approved reserved:
1986-01-01
19q13.11
基因染色体位置图

PEPD(磷酸烯醇式丙酮酸脱羧酶)是一种参与糖异生和能量代谢的关键酶,主要作用位点在肝脏和肾脏等组织中。它催化磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)转化为草酰乙酸(OAA),这是糖异生途径中的重要步骤,帮助机体在空腹或低血糖状态下维持血糖水平。PEPD的表达产物在能量代谢平衡中起核心作用,尤其在葡萄糖生成和氨基酸代谢中不可或缺。突变或功能异常可能导致糖异生障碍,引发低血糖或代谢紊乱,甚至与某些代谢性疾病如糖尿病相关。PEPD过表达可能增强糖异生能力,导致血糖升高,而表达降低则可能削弱糖异生作用,引发低血糖或能量供应不足。此外,PEPD活性变化可能影响其他代谢相关基因(如PCK1或G6PC)的表达或功能,进一步扰乱代谢稳态。PEPD属于磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因家族,该家族成员普遍参与碳固定和中间代谢,特点是能够催化羧化反应,在植物和细菌中还参与光合作用或有机酸合成。在人类中,PEPD家族基因主要聚焦于能量代谢调控,其功能异常可能直接关联代谢综合征或遗传性代谢疾病。研究PEPD的调控机制有助于理解代谢疾病的病理基础,并为治疗提供潜在靶点。

This gene encodes a member of the peptidase family. The protein forms a homodimer that hydrolyzes dipeptides or tripeptides with C-terminal proline or hydroxyproline residues. The enzyme serves an important role in the recycling of proline, and may be rate limiting for the production of collagen. Mutations in this gene result in prolidase deficiency, which is characterized by the excretion of large amount of di- and tri-peptides containing proline. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2009]

该基因编码的肽酶家族的一个成员。蛋白质形成了水解二肽或三肽具有C末端脯氨酸或羟脯氨酸残基的同型二聚体。酶供应脯氨酸的再循环中起重要作用,并且可以是速率限制为胶原蛋白的产生。突变在该基因导致脯氨酸肽酶缺乏症,其特征是大量的二 - 和三 - 肽含有脯氨酸的排泄。多个转录变异体的编码不同亚型也发现了这种基因。[由RefSeq的,2009年10月提供]

PEPD基因的碱基序列:[NCBI]
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PEPD基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs33841       rs33842       rs33843       rs33844       rs33845       rs40500       rs3760889       rs10410721       rs11665930       rs11672114       rs11672902       rs17551311       rs71351730       rs74174670       rs76034044       rs77230155       rs77382949      

PEPD基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTAACAGAAGTTCAGGTTCGA
58
ATATCCGTCTTAAACACTCGG
58
GAGCACTACTGCTACTCCC
59
TCGAACAGGCACATATCCC
60
GAGTTGGAAAGCCTCTTCG
59
CATTCTGGATCGTTCGGTC
58
TCTGTCCTCCTCACTTTGC
59
TTGTTGACTTCGAACTTGCT
58
GAACAGACAGAGATCCTGCA
60
CAATCTCTTCCACAGTGCG
59
GAAGTCGACCCTGTTTGTG
59
TTGTTGACTTCGAACTTGCT
58
AGAGATCGTTGAGTGCCTC
59
AATACTCACCGCCCATGTC
60
CTTCATCGACCACCTCCTG
60
TTCAATCTCTTCCACAGTGC
58
CTTCATCGACCACCTCCTG
60
TTCAATCTCTTCCACAGTGC
58
GAGTTGGAAAGCCTCTTCG
59
CATTCTGGATCGTTCGGTC
58
      尚未收录相关数据

PEPD基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PEPD基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016787
K7ES25 (UniProtKB)
IEA
GO:0004177
P12955 (UniProtKB)
IEA
GO:0004181
P12955 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P12955 (UniProtKB)
IPI
GO:0006508
P12955 (UniProtKB)
IEA
GO:0006520
P12955 (UniProtKB)
TAS
GO:0030145
P12955 (UniProtKB)
IEA
GO:0030574
P12955 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P12955 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P12955 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P12955 (UniProtKB)
IDA
GO:0102009
P12955 (UniProtKB)
IEA
GO:0016787
V9GY89 (UniProtKB)
IEA
GO:0004177
V9GYL0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
V9GYL0 (UniProtKB)
IEA
GO:0030145
V9GYL0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PEPD基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Deficiency of prolidase 0.481900093 11 12 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.245005506 2 1 BeFree_CTD_human_GAD_GWASCAT
Hepatomegaly 0.12 1 0 CTD_human
Organophosphate poisoning 0.12 1 0 CTD_human
Splenomegaly 0.12 1 0 CTD_human
Respiratory Tract Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Infection 0.12 1 0 CTD_human
Skin Ulcer 0.12 1 0 CTD_human
Cardiomyopathy, Familial Hypertrophic, 1 (disorder) 0.08 0 0 MGD
Mitral Valve Stenosis 0.00272435 1 0 LHGDN

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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E-mail: product@genelibs.com

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