PDZD4 (PDZ domain containing 4)

symbol:
PDZD4
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq28
gene_family:
alias symbol:
KIAA1444|LU1|FLJ34125|PDZRN4L|LNX5
alias name:
None
entrez id:
57595
ensembl gene id:
ENSG00000067840
ucsc gene id:
uc004fiz.2
refseq accession:
NM_032512
hgnc_id:
HGNC:21167
approved reserved:
2004-04-20
Xq28
基因染色体位置图

PDZD4(PDZ Domain Containing 4)是一种含有PDZ结构域的蛋白质编码基因,属于PDZ结构域基因家族。PDZ结构域家族是一类广泛存在于真核生物中的蛋白质,其成员通常通过PDZ结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用,参与细胞信号传导、细胞极性维持、细胞骨架组织以及膜蛋白的定位与稳定等功能。PDZD4基因编码的蛋白通过其PDZ结构域与其他蛋白相互作用,可能在神经突触形成、细胞黏附和信号转导等过程中发挥作用。目前关于PDZD4的具体生物学功能研究较少,但已知其表达产物可能参与调控细胞增殖和分化过程。PDZD4的突变或表达异常可能影响其与其他蛋白的相互作用,进而干扰相关信号通路,但目前尚未明确其与特定疾病的直接关联。若PDZD4过表达,可能通过异常激活某些信号通路促进细胞增殖,甚至可能与肿瘤发生相关;而降低表达则可能影响细胞间通讯或突触功能,导致神经系统或发育异常。PDZ基因家族的共性在于其成员均含有至少一个PDZ结构域,该结构域通常由80-90个氨基酸组成,能够识别并结合特定靶蛋白的C端短肽序列,从而介导蛋白复合物的组装和亚细胞定位。PDZD4作为该家族成员之一,可能与其他PDZ蛋白协同调控细胞功能,但其具体机制仍需进一步研究。

None

PDZD4基因的碱基序列:[NCBI]
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PDZD4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782811920       rs782812995       rs782816767       rs782817403       rs782819274       rs782807192       rs782808516       rs782808899       rs782801855       rs782802494       rs782804053       rs782796201       rs782798573       rs782798709       rs782799042       rs782786229       rs782788903      

PDZD4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTATGTCGGAGAGGTAAATCCC
59
GGTTCTGGACGTCTACACC
59
TTGGATGAGCTGGAGTATGAG
59
TGGGATTTACCTCTCCGAC
58
CTACGTGAACGGGAAGGAG
59
CCATGATATGCTCGAAGGTG
58
TATGTCGGAGAGGTAAATCCC
58
GGTTCTGGACGTCTACACC
59
TGGATGAGCTGGAGTATGAG
58
TTGGGATTTACCTCTCCGAC
59
CTACGTGAACGGGAAGGAG
59
GATATGCTCGAAGGTGATGTC
58
ATGTCGGAGAGGTAAATCCC
59
GGTTCTGGACGTCTACACC
59
TGGATGAGCTGGAGTATGAG
58
TGGGATTTACCTCTCCGAC
58
CTACGTGAACGGGAAGGAG
59
AAGGTGATGTCGGTCTGAG
59
      尚未收录相关数据

PDZD4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PDZD4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q17RL8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005938
Q76G19 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PDZD4基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
synovial sarcoma 0.000271442 1 0 BeFree
Sicca Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree

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