PDLIM2 (PDZ and LIM domain 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PDLIM2
locus group:
protein-coding gene
location:
8p21.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
mystique
entrez id:
64236
ensembl gene id:
ENSG00000120913
ucsc gene id:
uc064laq.1
refseq accession:
NM_001368120
hgnc_id:
HGNC:13992
approved reserved:
2000-12-08

基因染色体位置

基因染色体位置

8p21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PDLIM2（PDZ and LIM domain protein 2，也称SLIM或mystique）是一种含PDZ结构域和LIM结构域的支架蛋白，属于PDLIM蛋白家族。PDZ结构域介导蛋白质间相互作用，而LIM结构域参与细胞骨架组织和信号转导。PDLIM2在细胞黏附、迁移、增殖和凋亡中起关键作用，主要定位于细胞质和细胞核，尤其在肌肉、心脏和免疫系统中高表达。其功能包括调节转录因子（如NF-κB和STAT）的活性，通过泛素-蛋白酶体系统调控蛋白降解，并参与细胞骨架重组。PDLIM2基因突变可能导致其支架功能受损，影响细胞信号通路，与癌症（如乳腺癌、前列腺癌）、心血管疾病和炎症性疾病相关。过表达PDLIM2可能抑制肿瘤生长（通过促进促凋亡因子）或增强转移（通过激活迁移相关通路），而低表达可能导致信号传导异常，加剧炎症或肿瘤进展。PDLIM家族（如PDLIM1、PDLIM4等）的共性是通过PDZ/LIM结构域整合信号复合物，调控细胞力学和基因表达。例如，PDLIM4在心肌中稳定细胞骨架，而PDLIM7参与神经元发育。PDLIM2的异常表达可能干扰家族其他成员的功能协同性，影响组织稳态。

This gene encodes a member of the ALP subfamily of PDZ-LIM domain proteins. The encoded protein suppresses anchorage-dependent growth and promotes cell migration and adhesion through interactions with the actin cytoskeleton via the PDZ domain. The encoded protein is also a putative tumor suppressor protein, and decreased expression of this gene is associated with several malignancies including breast cancer and adult T-cell leukemia. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

这个基因编码PDZ结构LIM结构域的蛋白质的ALP亚科的成员。所编码的蛋白质抑制锚地依赖性生长并通过与经由所述PDZ结构域的肌动蛋白细胞骨架相互作用促进细胞迁移和粘附。所编码的蛋白质也假定的肿瘤抑制蛋白，并降低该基因的表达与多种恶性肿瘤包括乳腺癌和成人T细胞白血病相关。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2011年10月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

PDLIM2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs17088407       rs73672795       rs73672796       rs73672797       rs75143414       rs75170068       rs75291371       rs79457772       rs116124043       rs140173211       rs187528242       rs191995537       rs367931550       rs375514677       rs529287873       rs531644754       rs533980842      

基因表达

基因表达

PDLIM2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCATGGTGACTAAGGTGGC
59
ACGATTATGTCTCCAGGCC
59
GAGAAGTGCAGTACCAGCA
60
CATCTTCAGGTTCAGCCCA
60
GAGAAGTGCAGTACCAGCA
60
CATCTTCAGGTTCAGCCCA
60
CTTAAGGTCCTCCTACTCCAG
59
GAACATGCCAGACTCTGGA
59
TCATGGTGACTAAGGTGGC
59
ACGATTATGTCTCCAGGCC
59
TCATGGTGACTAAGGTGGC
59
ACGATTATGTCTCCAGGCC
59
TCATGGTGACTAAGGTGGC
59
ACGATTATGTCTCCAGGCC
59
TCATGGTGACTAAGGTGGC
59
ACGATTATGTCTCCAGGCC
59
TCATGGTGACTAAGGTGGC
59
ACGATTATGTCTCCAGGCC
59
GGCTCCAGAACTGGTAGAG
59
CAACGCCATACCTTTGAGC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PDLIM2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PDLIM2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
A0A087WVI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
B3KPU0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005925
C9JS55 (UniProtKB)
IDA
GO:0015629
C9JS55 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
C9JSR2 (UniProtKB)
IDA
GO:0015629
C9JSR2 (UniProtKB)
IDA
GO:0001725
Q96JY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q96JY6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96JY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005925
Q96JY6 (UniProtKB)
IDA
GO:0008270
Q96JY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0015629
Q96JY6 (UniProtKB)
IDA
GO:0030864
Q96JY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0031005
Q96JY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0032036
Q96JY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0051371
Q96JY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q96JY6 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PDLIM2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Membranous glomerulonephritis 0.000271442 1 0 BeFree
Renal glomerular disease 0.000271442 1 0 BeFree
Adult T-Cell Lymphoma/Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Focal glomerulosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Autoimmune Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Nephrotic Syndrome, Minimal Change 0.000271442 1 0 BeFree
HTLV-I Infections 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2