PDCD5P1 (programmed cell death 5 pseudogene 1)

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PDCD5P1
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pseudogene
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12p12.3
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HGNC:49885
approved reserved:
2014-03-18
12p12.3
基因染色体位置图

PDCD5P1(Programmed Cell Death 5 Pseudogene 1)是一个假基因,属于PDCD5基因家族。假基因通常是由功能基因复制或逆转录而来,但由于突变积累而失去编码功能蛋白的能力。PDCD5基因家族的主要成员PDCD5(Programmed Cell Death 5)是一个与细胞凋亡(程序性细胞死亡)密切相关的基因,其编码的蛋白在调控细胞凋亡过程中起重要作用,尤其在DNA损伤反应和肿瘤抑制中具有关键功能。PDCD5蛋白通过促进p53的稳定性来增强细胞凋亡信号,从而在肿瘤发生中发挥抑制作用。PDCD5P1作为假基因,可能不编码功能性蛋白,但假基因有时可以通过竞争性结合miRNA或转录因子来调控其同源功能基因的表达,从而间接影响细胞功能。目前关于PDCD5P1的具体生物学功能研究较少,但假基因的异常表达可能与某些疾病相关,例如癌症。PDCD5基因家族的共性在于它们与细胞凋亡和肿瘤抑制相关,主要成员如PDCD5通过调控凋亡通路参与维持细胞稳态。如果PDCD5P1过表达或降低表达,可能会干扰PDCD5的正常功能,例如通过竞争性结合调控因子影响PDCD5的表达水平,进而影响细胞凋亡过程。由于PDCD5在肿瘤抑制中的重要作用,PDCD5P1的异常表达可能间接促进肿瘤发生或发展。此外,假基因的突变通常不会直接影响机体功能,但如果其调控作用被破坏,可能对相关信号通路产生间接影响。目前尚未明确PDCD5P1与特定疾病的直接关联,但假基因的异常表达或突变在某些癌症中可能作为潜在的生物标志物或治疗靶点。总的来说,PDCD5P1作为PDCD5基因家族的假基因成员,可能通过调控机制间接影响细胞凋亡和肿瘤发生,但其具体功能仍需进一步研究。

None

PDCD5P1基因的碱基序列:[NCBI]
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PDCD5P1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

PDCD5P1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTTAGCACTTGTAAAGCCT
57
CCATATCTTGCCATCTGTATAAGG
59
GGAAGCAGAAATGAGAAACAG
58
GTTACTTAAACCTGGCCCG
59
ACTTAGCACTTGTAAAGCCTG
59
CCATATCTTGCCATCTGTATAAGG
59
      尚未收录相关数据

PDCD5P1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PDCD5P1基因的本体(GO)信息:

可能调控 PDCD5P1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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