PDCD5 (programmed cell death 5)

symbol:
PDCD5
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.11
gene_family:
alias symbol:
TFAR19|MGC9294
alias name:
TFAR19 novel apoptosis-related|TF1…
entrez id:
9141
ensembl gene id:
ENSG00000105185
ucsc gene id:
uc002ntm.4
refseq accession:
NM_004708
hgnc_id:
HGNC:8764
approved reserved:
1999-12-10
19q13.11
基因染色体位置图

PDCD5(Programmed Cell Death 5)是一种与细胞凋亡密切相关的基因,其编码的蛋白质在调控细胞程序性死亡过程中发挥重要作用。PDCD5蛋白广泛表达于多种组织中,尤其在胸腺、脾脏等免疫器官中表达较高。该蛋白的主要功能是促进细胞凋亡,它能够通过激活caspase-3等凋亡相关酶来加速凋亡过程。PDCD5的作用位点主要集中在细胞质和细胞核内,在DNA损伤或外界刺激下会迅速转位至细胞核,参与DNA修复或凋亡信号的传递。PDCD5的突变可能导致其功能丧失,从而影响细胞凋亡的正常进行,与多种疾病的发生发展相关,特别是肿瘤。研究发现,PDCD5在多种恶性肿瘤如白血病、乳腺癌、胃癌等中表达降低,其表达水平与肿瘤恶性程度呈负相关,提示PDCD5可能具有抑癌作用。PDCD5过表达会增强细胞对凋亡信号的敏感性,促进肿瘤细胞死亡,而降低表达则可能导致细胞凋亡受阻,增加肿瘤发生风险。此外,PDCD5还参与免疫调节和炎症反应,其表达异常可能与自身免疫性疾病有关。PDCD5属于一个功能多样的基因家族,但目前尚未有明确的家族分类。研究表明,PDCD5与其它凋亡相关蛋白如PDCD4在功能上有一定相似性,都参与细胞凋亡调控,但具体机制和信号通路可能有所不同。PDCD5的发现为理解细胞凋亡机制提供了新的视角,也为肿瘤等疾病的治疗提供了潜在靶点。

None

PDCD5基因的碱基序列:[NCBI]
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PDCD5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs10396       rs888767       rs4499344       rs4805772       rs7251953       rs10402931       rs10405535       rs10410673       rs10411464       rs10500262       rs10500263       rs11084660       rs12461589       rs17833075       rs34040260       rs34156998       rs34724018      

PDCD5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTTAGCACTTGTAAAGCCT
57
ACCTTGTTCTGATACCTTCTC
57
CACAGGGAAGCAGAAATGAG
59
ACCTTGTTCTGATACACCTGG
60
CACAGGGAAGCAGAAATGAG
59
GTGCTAAGTTACTTAACCTGGC
59
AACAGGAAGCAAAGCACAG
59
AGTTACTTAACCTGGCCCG
59
GGCCAGGTTAAGTAACTTAGC
59
GTTGTCCATATCTTGCCATCTG
60
ACTTAGCACTTGTAAAGCCT
57
ACCTTGTTCTGATACCTTCTC
57
ACTTAGCACTTGTAAAGCCT
57
ACCTTGTTCTGATACCTTCTC
57
AACAGGAAGCAAAGCACAG
59
CCTTGTTCTGATACACCTGG
58
AACAGGAAGCAAAGCACAG
59
AATCGTCATCTTCATCAGAGTC
58
CTCCTAGGTATCAGAACAAGGT
59
CGTCATCTTCATCAGAGTCCA
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
KLF9
PDCD5
Activation

PDCD5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PDCD5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
K7EQA1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
K7ESJ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
K7ESJ4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
K7ESJ4 (UniProtKB)
IDA
GO:0003677
O14737 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O14737 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14737 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0008201
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0008285
O14737 (UniProtKB)
IMP
GO:0010628
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0010698
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0043065
O14737 (UniProtKB)
IMP
GO:0043280
O14737 (UniProtKB)
IMP
GO:0048487
O14737 (UniProtKB)
IPI
GO:0070062
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0071560
O14737 (UniProtKB)
IDA
GO:0090200
O14737 (UniProtKB)
IMP
GO:1903638
O14737 (UniProtKB)
IMP
GO:1903645
O14737 (UniProtKB)
IMP
GO:0003677
Q3HM38 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
X6R2P6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PDCD5基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Myeloid Leukemia, Chronic 0.005634266 2 0 BeFree_GAD_LHGDN
Rheumatoid Arthritis 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
leukemia 0.003538676 4 0 BeFree_LHGDN
Stomach Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Astrocytoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of lung 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
Degenerative polyarthritis 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000542884 2 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree

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