PDCD4 (programmed cell death 4)

symbol:
PDCD4
locus group:
protein-coding gene
location:
10q25.2
gene_family:
alias symbol:
H731
alias name:
nuclear antigen H731
entrez id:
27250
ensembl gene id:
ENSG00000150593
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uc001kzh.4
refseq accession:
NM_014456
hgnc_id:
HGNC:8763
approved reserved:
2000-05-10
10q25.2
基因染色体位置图

PDCD4(Programmed Cell Death 4)是一种重要的肿瘤抑制基因,属于PDCD基因家族,该家族成员主要参与细胞凋亡、增殖和分化调控。PDCD4基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白,通过抑制翻译起始因子eIF4A的活性来调控特定mRNA的翻译,从而影响细胞周期、凋亡和肿瘤发生。PDCD4在多种组织中表达,尤其在脾脏、胸腺和白细胞中表达较高。其主要功能包括抑制肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移,并通过调控AP-1、NF-κB等转录因子的活性来影响炎症反应和免疫应答。PDCD4的突变或表达降低与多种癌症(如肝癌、肺癌、乳腺癌)的发生发展密切相关,其表达水平下降通常导致肿瘤细胞增殖加速、凋亡减少和侵袭能力增强。相反,PDCD4过表达可抑制肿瘤生长并促进细胞凋亡。此外,PDCD4还参与调控其他基因的表达,如下调 cyclin D1 和上调 p21,从而影响细胞周期进程。PDCD4基因家族成员通常具有调控细胞命运和参与肿瘤抑制的共同特点。研究表明,PDCD4的表达受多种miRNA(如miR-21)的负调控,miR-21的过表达会降低PDCD4水平,进而促进肿瘤发展。因此,PDCD4不仅是癌症治疗的潜在靶点,也是预后评估的重要分子标志物。

This gene is a tumor suppressor and encodes a protein that binds to the eukaryotic translation initiation factor 4A1 and inhibits its function by preventing RNA binding. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2010]

该基因是肿瘤抑制并编码能结合到真核翻译起始因子4A1和抑制通过阻止RNA结合其功能的蛋白质。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2010年12月提供]

PDCD4基因的碱基序列:[NCBI]
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PDCD4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1052550       rs1059881       rs2146544       rs3209508       rs11195369       rs11548767       rs12248739       rs55858908       rs56875008       rs61469604       rs72377323       rs72819732       rs74378684       rs114976522       rs115021775       rs116669104       rs117501349      

PDCD4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAAGAAAGGTGGTGCAGG
59
TCTTTCACATCCACCTCCTC
59
GAAGTTGCGGAAATGTTAAGAG
58
TCCAATGCTAAGGATACTGC
58
TAGAGCTGTTGGAGATGGA
57
TATCCAGAGCAGCTCTAGC
58
AGAGATCTTTGTCCTTCAAGGG
60
AAGACGACCTCCATCTCCT
60
GAAGTTGCGGAAATGTTAAGAG
58
CCAATGCTAAGGATACTGCC
59
AAAGAAAGGTGGTGCAGGA
60
TCTTTCACATCCACCTCCTC
59
AGATCTTTGTCCTTCAAGGG
57
TAAGACGACCTCCATCTCC
58
GTGGAAAGCGTAAAGATAGTG
57
CTTTCAGCAGCATATCAATCTC
58
GAAGTTGCGGAAATGTTAAGAG
58
CAATGCTAAGGATACTGCCA
58
GGAAAGCGTAAAGATAGTGTG
57
CTTTCAGCAGCATATCAATCTC
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
MYB
PDCD4
Unknown

PDCD4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PDCD4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
Q53EL6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q53EL6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q53EL6 (UniProtKB)
ISS
GO:0005634
Q53EL6 (UniProtKB)
ISS
GO:0005634
Q53EL6 (UniProtKB)
IMP
GO:0005654
Q53EL6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q53EL6 (UniProtKB)
IMP
GO:0005829
Q53EL6 (UniProtKB)
IDA
GO:0006915
Q53EL6 (UniProtKB)
NAS
GO:0007569
Q53EL6 (UniProtKB)
IDA
GO:0034393
Q53EL6 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
Q53EL6 (UniProtKB)
IEA
GO:0043508
Q53EL6 (UniProtKB)
ISS
GO:0045786
Q53EL6 (UniProtKB)
NAS
GO:0045892
Q53EL6 (UniProtKB)
ISS
GO:0045892
Q53EL6 (UniProtKB)
IDA
GO:1904761
Q53EL6 (UniProtKB)
IMP
GO:0005654
Q5VZS7 (UniProtKB)
IDA

可能调控 PDCD4基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Invasiveness 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Metastasis 0.004885954 18 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.003810118 4 0 BeFree_LHGDN
Carcinogenesis 0.003800186 14 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Lung Neoplasms 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Cystadenocarcinoma, Serous 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Tumor Progression 0.002714419 10 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.002442977 9 0 BeFree

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