PDCD2 (programmed cell death 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PDCD2
locus group:
protein-coding gene
location:
6q27
gene_family:
Zinc fingers, MYND-type
alias symbol:
ZMYND7|RP8
alias name:
None
entrez id:
5134
ensembl gene id:
ENSG00000071994
ucsc gene id:
uc003qxw.4
refseq accession:
NM_002598
hgnc_id:
HGNC:8762
approved reserved:
1995-01-03

基因染色体位置

基因染色体位置

6q27
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PDCD2（Programmed Cell Death 2）是一种参与细胞凋亡调控的基因，属于PDCD基因家族。该基因编码的蛋白质在细胞凋亡、细胞周期调控和免疫反应中发挥重要作用。PDCD2蛋白主要定位于细胞核，通过与核糖体蛋白和其他转录因子相互作用，影响基因表达和蛋白质合成。研究表明，PDCD2在造血干细胞和淋巴细胞的发育中起关键作用，其表达水平的变化可能影响免疫系统的功能。PDCD2的突变或表达异常可能导致细胞凋亡失调，进而与某些疾病相关，如白血病、淋巴瘤等血液系统恶性肿瘤。过表达PDCD2可能促进细胞凋亡，导致组织损伤或免疫缺陷；而降低表达则可能抑制凋亡，增加细胞存活，从而促进肿瘤发生。PDCD2基因家族（PDCD家族）的成员通常与细胞凋亡和免疫调控相关，具有保守的功能结构域，参与细胞命运决定和免疫应答。PDCD2与家族其他成员（如PDCD1、PDCD4）在功能上有一定重叠，但各自具有独特的调控机制和作用靶点。研究还发现，PDCD2可能通过影响mTOR信号通路或p53依赖的凋亡途径发挥作用。此外，PDCD2的表达水平在某些病毒感染或炎症条件下可能发生改变，提示其在宿主防御反应中的潜在作用。总体而言，PDCD2是一个多功能的凋亡调控基因，其表达平衡对维持正常生理功能和疾病预防至关重要。

This gene encodes a nuclear protein expressed in a variety of tissues. Expression of this gene has been shown to be repressed by B-cell CLL/lymphoma 6 (BCL6), a transcriptional repressor required for lymph node germinal center development, suggesting that BCL6 regulates apoptosis by its effects on this protein. Alternative splicing results in multiple transcript variants and pseudogenes have been identified on chromosomes 9 and 12. [provided by RefSeq, Dec 2010]

该基因编码在各种组织中表达的核蛋白质。已经显示出该基因的表达由B-CLL细胞/淋巴瘤6（BCL6），淋巴结生发中心的发展需要转录抑制因子受到抑制，提示BCL6通过对这种蛋白质作用调节细胞凋亡。在多个抄本变形和假剪接的结果已经确定在[由RefSeq的，2010年12月提供]染色体9和12。

OMIM数据库中对PDCD2基因的介绍     Wikipedia数据库中对PDCD2基因的介绍

基因序列

基因序列

PDCD2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PDCD2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8770       rs734249       rs960744       rs2066954       rs2072917       rs2092309       rs2092310       rs3173219       rs3173220       rs3734763       rs4140615       rs4140616       rs6912363       rs6913308       rs6928843       rs7745933       rs9295417      

基因表达

基因表达

PDCD2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATATTGGAATTCCAGGTCATGC
59
TCAGCACAGGTGAAGACAG
60
GCATATTACTGCAGCAAGGA
59
CCAGATGATCTGGTTGTGC
59
GGAATTCCAGGTCATGCCT
60
TCTCAGCACAGGTGAAGAC
59
TATTACTGCAGCAAGGAGC
58
GTCCAGATGATCTGGTTGTG
58
CATATTACTGCAGCAAGGAGC
60
CCAGATGATCTGGTTGTGC
59
GGAATTCCAGGTCATGCCT
60
TCAGCACAGGTGAAGACAG
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
BCL6
PDCD2
Repression
20605493
BCL6
PDCD2
Unknown
11854457; 17468402

基因本体信息

PDCD2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PDCD2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0046872
A0A087WYJ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
F5H4V9 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
F5H4V9 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
J3QK82 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q16342 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q16342 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q16342 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q16342 (UniProtKB)
IEA
GO:0006915
Q16342 (UniProtKB)
TAS
GO:0006919
Q16342 (UniProtKB)
IDA
GO:0019899
Q16342 (UniProtKB)
IPI
GO:0043065
Q16342 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q16342 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q16342 (UniProtKB)
IDA
GO:1901532
Q16342 (UniProtKB)
IMP
GO:1902035
Q16342 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PDCD2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lymphoma 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Pneumonia, Interstitial 0.000271442 1 0 BeFree
Cancer Cell Growth 0.000271442 1 0 BeFree

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基因相关服务

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