PCGF3 (polycomb group ring finger 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCGF3
locus group:
protein-coding gene
location:
4p16.3
gene_family:
Ring finger proteins|polycomb group ring fingers
alias symbol:
FLJ36550|DONG1|RNF3A|MGC40413
alias name:
None
entrez id:
10336
ensembl gene id:
ENSG00000185619
ucsc gene id:
uc003gbe.4
refseq accession:
NM_006315
hgnc_id:
HGNC:10066
approved reserved:
1997-07-01

基因染色体位置

基因染色体位置

4p16.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCGF3（Polycomb Group RING Finger Protein 3）属于PcG（Polycomb Group）蛋白家族，该家族是一类表观遗传调控因子，通过修饰染色质结构（如组蛋白甲基化或泛素化）来沉默靶基因表达，主要参与胚胎发育、细胞分化及干细胞维持等过程。PCGF3是Polycomb抑制复合物1（PRC1）的核心组分，PRC1通过催化组蛋白H2A的泛素化（H2AK119ub）来抑制基因转录，其作用位点集中在发育相关基因的启动子或增强子区域。PCGF3的生物学功能包括维持细胞身份、调控细胞周期及抑制肿瘤发生。若PCGF3发生功能丧失性突变（如截短突变或错义突变），可能导致PRC1复合物组装异常，引发靶基因（如HOX基因）异常激活，进而干扰发育程序，与某些癌症（如白血病）或发育障碍相关。过表达PCGF3可能增强PRC1的基因沉默效应，导致分化阻滞（如维持干细胞多能性），而表达降低则可能使抑癌基因失控表达，促进细胞恶性转化。PCGF家族（含PCGF1-6）的共性是通过RING结构域介导PRC1的E3泛素连接酶活性，且成员间功能部分冗余但组织特异性不同。例如PCGF3与PCGF1/6在神经发育中作用突出，而PCGF4（BMI1）更广谱参与肿瘤发生。专业术语解释：表观遗传调控指不改变DNA序列的可遗传性基因表达调控；泛素化是一种蛋白质翻译后修饰，标记目标蛋白降解或功能改变；PRC1/2是Polycomb蛋白形成的两类多亚基复合物，分别催化H2A泛素化和H3K27甲基化。目前"Polycomb"中文译名"多梳"存在争议，部分文献直接使用英文原名。

The protein encoded by this gene contains a C3HC4 type RING finger, which is a motif known to be involved in protein-protein interactions. The specific function of this protein has not yet been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质包含一个C3HC4型RING指，这是公知的是参与蛋白质 - 蛋白质相互作用的基序。这种蛋白质的特定功能还没有被确定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对PCGF3基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCGF3基因的介绍

基因序列

基因序列

PCGF3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCGF3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1894       rs7336       rs747504       rs899389       rs899390       rs899391       rs899392       rs899393       rs1026740       rs1026741       rs1044147       rs1044180       rs1531583       rs1531584       rs1811560       rs2242233       rs2242234      

基因表达

基因表达

PCGF3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACCTGGAGGAGAACAACAC
59
TCTGTCATGACCGATGTACTG
60
TTCATCCTTTAACGAGCTGGA
60
GTGACAACCACGAACTTGAG
60
GGAAGATCAAGCTGTGGGA
59
CTCTCAGCTTAGGTGTGCA
59
AGTCTCTGTGACCAGAAGC
59
AGAAGGTGTGCAGACACTC
60
GTCACAATGTAGCAGGGAC
58
TCAACATCTTTGGCTTCTCC
58
GTCACAATGTAGCAGGGAC
58
TCAACATCTTTGGCTTCTCC
58
ACCTGGAGGAGAACAACAC
59
TCTGTCATGACCGATGTACTG
60
GGATTGTGATCCACCAGAG
58
TCATTTCCGCTTCTTGGAG
58
TTCATCCTTTAACGAGCTGGA
60
GTGACAACCACGAACTTGAG
60
GTTCACAGCGATTCAAAGG
57
GACTAGGTTGGCTTGTACC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCGF3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCGF3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A087WVH5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
C9J3G7 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
C9JGV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
C9JYD0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q3KNV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q3KNV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q3KNV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q3KNV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q3KNV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q3KNV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q3KNV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q3KNV8 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q3KNV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q3KNV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q3KNV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0031519
Q3KNV8 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCGF3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adverse effects in the therapeutic use of anticoagulants 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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