PCGEM1 (PCGEM1 prostate-specific transcript)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCGEM1
locus group:
non-coding RNA
location:
2q32.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
NCRNA00071|LINC00071|PCAT9
alias name:
non-protein coding RNA 71|long int…
entrez id:
64002
ensembl gene id:
ENSG00000227418
ucsc gene id:
uc002ute.3
refseq accession:
NR_002769
hgnc_id:
HGNC:30145
approved reserved:
2008-06-04

基因染色体位置

基因染色体位置

2q32.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCGEM1（Prostate Cancer Gene Expression Marker 1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），最初在前列腺癌中被发现并因其高表达与肿瘤进展相关而得名。它主要在前列腺组织中表达，并在多种癌症中表现出异常调控，尤其在促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭中起关键作用。PCGEM1的生物学功能包括作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除对下游靶基因的抑制，例如通过吸附miR-145-5p激活PI3K/AKT信号通路，促进肿瘤生长。此外，PCGEM1还能与转录因子（如c-Myc）或表观遗传修饰酶相互作用，调控基因表达网络。其主要作用位点为细胞核和细胞质，通过不同机制影响转录后调控和信号转导。PCGEM1的突变或异常表达与癌症恶性表型密切相关，例如其过表达在前列腺癌、乳腺癌和肝癌中均提示预后不良，而敲低PCGEM1可抑制肿瘤细胞活力并诱导凋亡。该基因还参与耐药性形成，如通过调控ABC转运蛋白增强化疗药物外排。PCGEM1属于lncRNA基因家族，该家族成员普遍不编码蛋白质，但通过调控染色质重塑、转录干扰或信号通路参与细胞分化、免疫应答和疾病发生。若PCGEM1过表达，可能激活促癌通路（如AR信号在前列腺癌中），而表达降低则可能抑制肿瘤进展，但具体效应因组织环境而异。目前研究认为PCGEM1是癌症诊断的潜在生物标志物和治疗靶点，但其在正常生理中的作用仍需进一步探索。

None

无

OMIM数据库中对PCGEM1基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCGEM1基因的介绍

基因序列

基因序列

PCGEM1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCGEM1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs934947       rs1347932       rs1439650       rs1439651       rs1439652       rs1439654       rs1561509       rs1561511       rs1579209       rs2033853       rs2357254       rs6414130       rs6434568       rs7567586       rs9808059       rs9808375       rs9808472      

基因表达

基因表达

PCGEM1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCCCTGAGATTTCTGAGG
59
CACAACGTAAATGAATGACCTG
58
GATTACAGCAGGCTTGGTG
58
ATAGTCCTCTTCCAGGAGCT
59
CCTTATCAAGTGAGCAGGCT
59
TAGTCCTCTTCCAGGAGCT
59
CTTATCAAGTGAGCAGGCT
57
ATAGTCCTCTTCCAGGAGC
57
TGCAACTTCCTCTAATTGGGA
59
CAGGGCAAGACTCCATCTC
59
AAACAAAGGTGCCTTTGCC
60
CCCTCAGAAATCTCAGGGC
60
GACAAGCCCTGAGATTTCTG
59
ACGTAAATGAATGACCTGATCC
59
TGCAACTTCCTCTAATTGGGA
59
AGACTCCATCTCACTTGATAAGG
59
CCTTATCAAGTGAGCAGGC
58
TAGTCCTCTTCCAGGAGCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCGEM1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCGEM1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCGEM1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostate carcinoma 0.003528744 13 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.003257302 12 0 BeFree
Prostatic Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Xenograft Model 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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