PCGEM1 (PCGEM1 prostate-specific transcript)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCGEM1
locus group:
non-coding RNA
location:
2q32.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
NCRNA00071|LINC00071|PCAT9
alias name:
non-protein coding RNA 71|long int…
entrez id:
64002
ensembl gene id:
ENSG00000227418
ucsc gene id:
uc002ute.3
refseq accession:
NR_002769
hgnc_id:
HGNC:30145
approved reserved:
2008-06-04

基因染色体位置

基因染色体位置

2q32.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCGEM1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs934947       rs1347932       rs1439650       rs1439651       rs1439652       rs1439654       rs1561509       rs1561511       rs1579209       rs2033853       rs2357254       rs6414130       rs6434568       rs7567586       rs9808059       rs9808375       rs9808472      

基因表达

基因表达

PCGEM1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCCCTGAGATTTCTGAGG
59
CACAACGTAAATGAATGACCTG
58
GATTACAGCAGGCTTGGTG
58
ATAGTCCTCTTCCAGGAGCT
59
CCTTATCAAGTGAGCAGGCT
59
TAGTCCTCTTCCAGGAGCT
59
CTTATCAAGTGAGCAGGCT
57
ATAGTCCTCTTCCAGGAGC
57
TGCAACTTCCTCTAATTGGGA
59
CAGGGCAAGACTCCATCTC
59
AAACAAAGGTGCCTTTGCC
60
CCCTCAGAAATCTCAGGGC
60
GACAAGCCCTGAGATTTCTG
59
ACGTAAATGAATGACCTGATCC
59
TGCAACTTCCTCTAATTGGGA
59
AGACTCCATCTCACTTGATAAGG
59
CCTTATCAAGTGAGCAGGC
58
TAGTCCTCTTCCAGGAGCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCGEM1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCGEM1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCGEM1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostate carcinoma 0.003528744 13 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.003257302 12 0 BeFree
Prostatic Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Xenograft Model 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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