PCDHA8 (protocadherin alpha 8)

symbol:
PCDHA8
locus group:
other
location:
5q31.3
gene_family:
Clustered protocadherins
alias symbol:
None
alias name:
KIAA0345-like 6
entrez id:
56140
ensembl gene id:
ENSG00000204962
ucsc gene id:
uc003lhs.2
refseq accession:
NM_018911
hgnc_id:
HGNC:8674
approved reserved:
2000-06-28
5q31.3
基因染色体位置图

PCDHA8(Protocadherin Alpha 8)属于原钙粘蛋白α基因家族(PCDHA基因家族),该家族是钙粘蛋白超家族的重要成员,主要参与细胞间粘附和信号传导。PCDHA基因家族共有14个成员(PCDHA1-PCDHA14),它们通过可变外显子的选择性剪接产生多种亚型,具有高度多样性。这些基因在神经系统中高度表达,尤其在突触形成、神经元迁移和神经回路建立中发挥关键作用。PCDHA8编码的蛋白质是一种跨膜蛋白,其胞外区含有多个钙离子结合域,介导同源或异源细胞间相互作用。该基因主要在大脑皮层、海马和小脑中表达,参与神经元连接特异性的调控。PCDHA8突变可能导致其粘附功能异常,与自闭症谱系障碍(ASD)、精神分裂症等神经发育疾病相关。研究表明,PCDHA8表达降低会破坏神经元间突触连接,影响神经网络稳定性;而过表达则可能导致异常神经回路形成。PCDHA8还参与调节神经干细胞的分化方向,其表达水平异常可能影响神经发生过程。此外,PCDHA8与其他原钙粘蛋白家族成员存在功能冗余,但同时又具有独特的表达模式和功能特性。该基因的表观遗传调控异常也被发现与某些神经系统疾病相关。PCDHA8作为神经发育的重要调控分子,其精确表达对维持正常脑功能至关重要。

This gene is a member of the protocadherin alpha gene cluster, one of three related gene clusters tandemly linked on chromosome five that demonstrate an unusual genomic organization similar to that of B-cell and T-cell receptor gene clusters. The alpha gene cluster is composed of 15 cadherin superfamily genes related to the mouse CNR genes and consists of 13 highly similar and 2 more distantly related coding sequences. The tandem array of 15 N-terminal exons, or variable exons, are followed by downstream C-terminal exons, or constant exons, which are shared by all genes in the cluster. The large, uninterrupted N-terminal exons each encode six cadherin ectodomains while the C-terminal exons encode the cytoplasmic domain. These neural cadherin-like cell adhesion proteins are integral plasma membrane proteins that most likely play a critical role in the establishment and function of specific cell-cell connections in the brain. Alternative splicing has been observed and additional variants have been suggested but their full-length nature has yet to be determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是protocadherinα基因簇的一个成员,的三个相关的基因簇的五个染色体串联连接,展示类似于B细胞和T细胞受体基因簇的一个不寻常的基因组组织之一。阿尔法基因簇是由相关的小鼠的CNR基因15钙粘蛋白家族的基因和由13个高度相似和2更远亲编码序列。 15 N-末端外显子,或外显子可变的串联阵列,后跟下游C末端外显子,或外显子恒定,这是由该集群中的所有基因的共享。大的,不间断的N-末端的每个外显子编码6钙粘蛋白胞外结构域,而C末端的外显子编码的胞质域。这些神经钙粘蛋白样细胞粘附蛋白是一体的质膜蛋白,最有可能发挥在大脑细胞特异性细胞连接的建立和功能起关键作用。选择性剪接已经观察到的和额外的变体已经提出,但它们的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PCDHA8基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs14615       rs31749       rs31871       rs31872       rs31873       rs31874       rs56002       rs56003       rs59479       rs151988       rs155358       rs155359       rs155360       rs155361       rs155362       rs155363       rs155364      

PCDHA8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCCCTGAGATAGCACTGAC
60
TACCAAATTGAGCGTCTTCAC
59
GGATCAGTTGATGTAGGCGA
60
CTCTAGGTGCACAGAGCTG
60
TTGATGTAGGCGAAGAGCA
59
CTCTAGGTGCACAGAGCTG
60
CGTCCCTGAGATAGCACTG
60
ACCAAATTGAGCGTCTTCAC
59
GATCATGGCCTCAAACCAC
59
CTCCTCTAGGTGCACAGAG
59
TGAGATAGCACTGACTTCCT
58
GACAGTACCAAATTGAGCGT
59
      尚未收录相关数据

PCDHA8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCDHA8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q9Y5H6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q9Y5H6 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q9Y5H6 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q9Y5H6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
Q9Y5H6 (UniProtKB)
TAS

可能调控 PCDHA8基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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